代谢组学什么类型的样本更适合,样本采集需要注意什么?绝大多数可以可靠收集的生物样本都适用于代谢组学研究。常见的样本主要有:临床和动物的血清、血浆、尿液、粪便、各类组织、体液;细胞和微生物、培养液和发酵液;植物的根、茎、叶、花等。代谢每时每刻都在发生变化,我们需要研究的是某个或多个瞬时状态,因此样本采集一般需要保证“快速、一致、简单”的,采集后通过低温淬灭(如液氮淬灭或低温冻存等)的方法阻止离体后的样本的代谢活动。另外,不同的检测要求也需要配合不同的收集方法,具体步骤请参照谱领生物样本收集步骤文件。在食品安全领域,利用代谢组学工具发现农兽药等在动植物体内的相关生物标志物也是一个热点领域。广东代谢组学分析方法
非靶向代谢组学:非靶向代谢组学可用于检测生物体内大多数小分子代谢物的动态变化,通过数据处理,多维统计和数学建模来分析生物扰动下的代谢指纹图谱。寻找两组间发生明显变化的差异代谢物,富集差异代谢通路, 获得整个生物体的代谢轮廓。 技术优势: 1、代谢组学能放大基因组和蛋白组的微小变化,具有较高的灵敏度、分辨率; 2、具有较宽的动态检测范围;3、相比于基因组学和蛋白质组学,检测费用更为低廉;4、代谢组学比较贴近生物体表型,能更直接、准确地反映生物体的生理病理状态,适合于生物样本中潜在标志物的筛选,疾病分期等。济南GC-MS非靶向代谢组学分析代谢组学主要技术手段是色谱(HPLC,GC)。
什么是非靶向代谢组学、靶向代谢组学?(1) 非靶向代谢组学(Untargeted metabolomics)即非目标代谢组学或发现代谢组学,无偏向性地对所有小分子代谢物(一般相对分子量小于1000)同时进行检测分析的代谢组学。(2) 靶向代谢组学(Trgeted metabolomics)则为目标性代谢组学,着重对于设定好的目标代谢物进行定性、量检测分析和研究。相比于其他组学,代谢组学有哪些特殊的优势?系统生物学有基因组学、转录组学、蛋白组学和代谢组学。代谢组学作为系统生物学的一个重要的分支,与其他组学相比有着其特有的优势,主要体现在以下几点:(1) 基因与蛋白质表达的微小变化会在相应代谢物水平上得到放大,更容易被检测。(2) 代谢物的种类要远小于基因和蛋白的数目。(3) 可与生物表型变化建立直接相关性。
代谢组学:代谢组学 (metabolomics)的出现是生命科学研究的必然。是对某一生物或细胞中相对分子量小于1,000的小分子代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。代谢组作为系统生物学的重要组成部分,在临床医学领域具有普遍的应用前景。 代谢产物是基因表达的产物,在代谢酶的作用下生成。虽然与基因或蛋白质相比,代谢产物较小,但是不能形成代谢产物的细胞是死细胞,因此不能小看代谢产物的重要性。 研究人员通过对机体代谢产物的深入研究,可以判断机体是否处于正常状态,而对基因和蛋白质的研究都无法得出这样的结论。事实上,代谢组学研究已经能诊断出一些代谢类疾病,如糖尿病、肥胖症,代谢综合症。目前,已经研究清楚的普通代谢途径包括三羧酸循环(TCA),糖酵解,花生四烯酸 (AA)/炎症途径。代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似。
代谢组学如何控制临床样本的质量?对于临床的样本建议每组比较低的25个生物学重复,达到30例以上比较好。因为临床样本受外界环境和遗传背景影响较大,需要很多生物学重复来消除这些外在影响。此外,在样本收集过程中,应保持收养的时间段和操作程序尽可能一致。代谢组学样本收集取样基本原则:表示性和一致性:验组与对照组样本在取材部位、时间处理等方面尽可能保持一致,从而保证实验的可信度;迅速性:操作过程迅速,很大限度缩短样本采集到实验的时间;低温原则:所有样本离体后,分离步骤应在4℃或冰上进行,分离好的样本立即存于-80℃,以免样本产生进一步代谢活动。代谢组学 (metabolomics)的出现是生命科学研究的必然。贵州代谢组学研究
代谢组学的研究对象与层次有哪些?广东代谢组学分析方法
代谢组学疾病诊断应用: 代谢组学研究人员已经对此进行了研究。新生儿是否缺失酶基因,可以在出生时就检测出来。可检测出包括涉及合成途径中的基本成分(如氨基酸)的酶。酶缺失的结果就是相应的代谢产物过少或过多。尿症(PKU)是一种常见的婴儿疾病。这种疾病是由于缺失将苯丙氨酸水解成酪氨酸所必须的苯丙氨酸水解酶基因,导致血液中苯丙氨酸累积造成的。若是不能及时检测出这种天生的代谢缺乏,在婴儿出生后九个月内,就会引起无法挽救的大脑损伤。这种疾病通过简单的血样和尿素化验就可以确诊。而血样和尿素化验以后也将成为代谢指纹研究方法的一部分。像尿症那样的疾病,研究人员正试图从疾病的生物化学基础着手,而不是只有检测生物标记物。他们希望通过代谢组学,可以找到更好的方法去治这些疾病。广东代谢组学分析方法