蛋白质磷酸化修饰类型：根据磷酸氨基酸残基的不同，可将磷酸化蛋白质分为4类，即O-磷酸盐蛋白质、N-磷酸盐蛋白质、酰基磷酸盐蛋白质和S-磷酸盐蛋白质。1、O-磷酸盐蛋白质通过羟氨基酸（如丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸）的磷酸化形成。2、 N-磷酸盐蛋白质通过精氨酸、赖氨酸或组氨酸的磷酸化形成。3、 酰基磷酸盐蛋白质通过天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸盐蛋白质通过半胱氨酸磷酸化形成。蛋白质磷酸化修饰鉴定方法：免疫印迹技术是在凝胶电泳和固相免疫测定技术基础上发展起来的、根据特定抗原-抗体的特异性反应来检测复杂样品中的某种蛋白质的免疫生化分析方法。蛋白质翻译后修饰在蛋白质中磷酸化位点分析时应该注意些什么问题？山东磷酸化修饰蛋白质组学分析方法

蛋白翻译后修饰：蛋白质氨基酸序列的特定位置可以与化学基团或者小分子量的蛋白共价结合从而发生蛋白质翻译后修饰（post-translational modifications，PTMs）。翻译后修饰是蛋白质生物合成的一个步骤，翻译后多肽链在成为成熟的蛋白质产品之前要经过修饰，PTMs的类型包括磷酸化、乙酰化、糖基化、泛素化和二硫键等等，它导致蛋白质组复杂性的大幅增加。对于任何给定的蛋白质，各种各样的PTMs提供了一种通过改变蛋白质的结构和功能来促进细胞快速变化的方法。PTMs在信号转导、蛋白质稳定性和周转率、蛋白质与蛋白质识别和相互作用以及空间定位中起着至关重要的作用。江苏蛋白质翻译后修饰组学类型蛋白质翻译后修饰可以改变蛋白质的物理、化学性质。

翻译后修饰蛋白组学分析：蛋白质组学的研究的工作不只聚焦于细胞不同生长时期或是疾病条件下的蛋白质表达水平变化，许多至关重要的生命进程不只由蛋白质相对丰度控制，更重要的是被时空特异分布的、可逆的翻译后修饰所调控，因而揭示翻译后修饰发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。蛋白质发生翻译后修饰时其分子质量会发生响应的改变，通过质谱能够精确测定蛋白质或多肽的分子质量。同时，发生翻译后修饰的蛋白质再样本中含量低且动态范围广，所以在质谱检测前需要对发生修饰的蛋白质或肽段进行富集。

蛋白质学组翻译后修饰分析自中而下分析策略：自中而下的蛋白质组学技术可用于组蛋白修饰的分析。样品制备与普遍使用的自下而上的分析策略相同，直到得到纯化的组蛋白。提取组蛋白后，用GluC进行消化。然后用弱阳离子交换/亲水相互作用色谱（WCX-HILIC）与配备电子转移解离（ETD）的高分辨率质谱联机联用，对样品进行理想的分离。谱识别可以用传统的软件进行，但是由于估计适当的错误发现率的问题，需要对结果进行过滤。自上而下的技术可以直接引入完整的蛋白质并在串联质谱仪上对其进行片段化，不需要蛋白质水解消化。目前，有两种完全分离蛋白质的方法：离线和在线。前者用四维分离法，后者用WCX-HILIC。在早期的研究中，乙酰化修饰一直被认为是真核细胞所特有的一种翻译后修饰。

质谱分析蛋白翻译后修饰原理：相较于没有发生翻译后修饰的蛋白，翻译后修饰蛋白会在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻译后修饰方式的质谱分析过程中，蛋白会首先被酶切成肽段，然后进入质谱进行分析；通过质谱分析，得到的是一系列肽段的相对分子质量信息。对于某一个特定的肽段而言，在没有发生任何翻译后修饰的情况下其序列信息和分子量是确定的，当它发生了某种翻译后修饰之后，例如磷酸化修饰，因为磷酸根的分子量也是确定的，所以在质谱检测过程中如果发现部分肽段的分子量刚好增加了一个磷酸根的分子量，则可以假设这个肽段发生了磷酸化修饰，再通过二级或多级质谱的谱图进行二次确认即可实现翻译后修饰类型鉴定及修饰位点分析等。蛋白质乙酰化修饰组学技术对细胞核内转录调控因子的刺激有着重要的作用。湖北蛋白质磷酸化修饰组学分析研究

自中而下的蛋白质组学技术可用于组蛋白修饰的分析。山东磷酸化修饰蛋白质组学分析方法

蛋白质磷酸化修饰组学：磷酸化蛋白质是由蛋白激酶将ATP或GTP分子上的磷酸基团转移到底物蛋白特定的氨基酸侧链上形成的。蛋白质磷酸化是一种可逆的蛋白质翻译后修饰。在哺乳动物的细胞生命周期中，至少有三分之一的蛋白质发生磷酸化修饰。磷酸化修饰参与许多信号转导途径和细胞代谢过程，且许多已知的疾病也与蛋白质的异常磷酸化有关。因此，对磷酸化蛋白质组进行定量研究，寻找差异表达的磷酸化蛋白质，有助于发现疾病的生物标志物和寻找新的具有诊疗潜力的药物靶标。山东磷酸化修饰蛋白质组学分析方法