蛋白质组学主要以全蛋白组（组织、细胞）、线粒体蛋白组、叶绿体蛋白组和外泌体蛋白组为研究对象，通过对蛋白组进行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物学功能、作用机制、疾病诊断的标志物以及预测蛋白的上、下游变化关系。蛋白质组学可以克服核酸水平预测的不确定性、反映核酸翻译后修饰情况。常用技术：非靶向蛋白组学：蛋白质定性（胶条鉴定和溶液鉴定），高通量定量蛋白组（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽组学。蛋白质组可以随着组织、甚至环境状态的不同而改变。广州4D定量蛋白质组学质谱鉴定

定量蛋白质组学技术：定量蛋白质组学是蛋白质组研究的重要内容，通过对基因表达产物——蛋白质的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境条件下的表达情况。近年来，随着非凝胶技术的发展，蛋白质组学（“Shotgun”proteomics）技术，特别是多维蛋白质鉴定（MultidimensionalProteinIdentification，MudPIT）已成为研究复杂生物样本中大规模蛋白质表达和定性和定量分析的强有力工具。蛋白质组学在医学的研究应用：蛋白质组学是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学。广州4D定量蛋白质组学质谱鉴定蛋白质组的研究能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。

蛋白质组学技术：飞行时间质谱：MALDI的基本原理是将分析物分散在基质分子（尼古丁酸及其同系物）中并形成晶体，当用激光（337nm的氮激光）照射晶体时，基质分子吸收激光能量，样品解吸附，基质-样品之间发生电荷转移使样品分子电离。它从固相标本中产生离子，并在飞行管中测定其分子量，MALDI-TOF-MS一般用于肽质量指纹图谱，非常快速（每次分析只需3~5min），灵敏（达到fmol水平），可以精确测量肽段质量，但是如果在分析前不修饰肽段，MALDI-TOF-MS不能给出肽片段的序列。

Labelfree非标记定量蛋白质组学技术特点：（1）不需要标记处理，操作简单，成本低、实验周期短；（2）每个样品单独处理、上机；（3）可以做任意样本的总蛋白质差异定量，样品类型不受限制；（4）对单个样品的蛋白总量要求相对较低，对于组织本身蛋白量不高，可以选择Label-Free，适用于一些难收集样品；（5）定性没有问题，但是定量的准确性较标记定量稍差，会受到质谱稳定性等因素的影响；（6）适合于大样本量的定量比较（大于24个样本）。蛋白质组学在医学的研究应用：蛋白质组学(Proteomics)是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学。蛋白质组的研究能为生命活动规律提供物质基础。

蛋白质组学：蛋白质组一词，源于蛋白质与基因组两个词的组合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全方面的认识。蛋白质组的研究不只能为生命活动规律提供物质基础，也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析，我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”，它们可成为新药物设计的分子靶点，或者也会为疾病的早期诊断提供分子标志。确实，那些世界范围内销路*的药物本身是蛋白质或其作用靶点为某种蛋白质分子。因此，蛋白质组学研究不只是探索生命奥秘的必须工作，也能为人类健康事业带来巨大的利益。近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域，如细胞生物学、神经生物学等。蛋白质组学项目

质谱技术相较于传统蛋白质鉴定技术而言，拥有灵敏、准确、高通量、自动化等特点。广州4D定量蛋白质组学质谱鉴定

蛋白质组的研究不但能为生命活动规律提供物质基础，也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析，我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”，它们可成为新药物设计的分子靶点，或者也会为疾病的早期诊断提供分子标志。确实，那些世界范围内销路比较好的药物本身是蛋白质或其作用靶点为某种蛋白质分子。因此，蛋白质组学研究不只是探索生命奥秘的必须工作，也能为人类健康事业带来巨大的利益。蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征。广州4D定量蛋白质组学质谱鉴定

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