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浙江泛素化修饰蛋白质组学质谱鉴定

来源: 发布时间:2022-03-23

蛋白质学组翻译后修饰的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一种替代方法,分析组蛋白时其原理类似于自下而上分析策略。在使用这种分析方法时,通常需要将被检测蛋白质消化成3-9kDa范围内的肽段,因此也无法保证检测到的肽段的完整性。但是,由于仪器的进步和保留了组蛋白尾部的组合修饰,自中而下分析法正逐渐受到欢迎。自中而下更接近于自下而上法的灵敏度。自上而下:自上而下技术可以直接对完整的蛋白质进行测序,包括翻译后修饰的蛋白质和其他大的蛋白质片段,而不只是肽段。这可以比较大程度地保留与PTMs相关的信息,使其适用于组蛋白的全方面表征和分析。自上而下技术对蛋白质的有效分辨率已达到229kDa,一次可以检测到的蛋白质数量也在增加。蛋白质的磷酸化修饰是生物体内重要的共价修饰方式之一。浙江泛素化修饰蛋白质组学质谱鉴定

蛋白质磷酸化修饰组学技术优点:1、全方面性:磷酸化蛋白质组学以整个细胞蛋白为研究对象,研究内容包括了细胞内具有生命功能的蛋白,如细胞增生、细胞分裂和细胞分化等相关蛋白,因而研究更为全方面。2、可靠性:传统的生物学研究蛋白质磷酸化往往针对特定条件,以两个蛋白或更多蛋白之间的相互作用为出发点,具有局限性,缺乏整体认识。磷酸化蛋白质组学则可检测不同蛋白激酶及磷酸化酶对同一个蛋白磷酸化程度的影响,因而结果具有普遍性和可靠性。3、有效性:磷酸化蛋白质组学反映的是细胞内真实发生的事件,在一次试验中考虑了不同变量,克服了生物学中逐步添加变量的缺陷。4、探索性:磷酸化蛋白质组学以细胞内蛋白为研究对象,相对于传统的生物学研究以及蛋白质芯片,更易发现未知的新磷酸化位点和磷酸化蛋白质。如果可以联合生物学技术,则可以发现具有磷酸化或者去磷酸化功能的酶。南京蛋白质乙酰化修饰组学主要技术常见的蛋白质翻译后修饰包括泛素化。

蛋白质磷酸化修饰鉴定方法:免疫印迹技术:技术优势特点。1、 检测特异性高。2、能够特异鉴定单个磷酸化位点。同位素标记(Isotope Labeled)结合免疫印迹法:此方法的原理是当蛋白发生磷酸化时,放射性32P的掺入和分子质量变化引起的凝胶迁移(gelshift),再通过免疫印迹方法检测同位素标记,从而达到鉴定磷酸化蛋白的目的。技术优势特点:1、检测技术灵敏并且直观。2、常用于体外磷酸化反应结果检测。3、 磷酸化鉴定不受抗体限制。4、可同时分析多个蛋白磷酸化。

蛋白质有哪些翻译后修饰?作用机制和生物学功能是什么?前体蛋白是没有活性的,常常要进行一个系列的翻译后加工,才能成为具有功能的成熟蛋白。加工的类型是多种多样的,一般分为以下几种:N-端fMet或Met的切除、二硫键的形成、化学修饰和剪切。当合成蛋白质时,20种不同的氨基酸会组合成为蛋白质。蛋白质的翻译后蛋白质其他的生物化学官能团(如醋酸盐、磷酸盐、不同的脂类及碳水化合物)会附在蛋白质上从而改变蛋白质的化学性质,或是造成结构的改变(如建立双硫键),来扩阔蛋白质的功能。再者,酶可以从蛋白质的N末端移除氨基酸,或从中间将肽链剪开。举例来说,胰岛素它会在建立双硫键后被剪开两次,并在链的中间移走多肽前体,而形成的蛋白质包含了两条以双硫键连接的多肽链。蛋白质磷酸化修饰的免疫印迹技术优点:能够特异鉴定单个磷酸化位点。

蛋白质糖基化修饰组学技术:糖基化是在酶的控制下,蛋白质或脂质附加上糖类的过程,发生于内质网和高尔基体等部位。在糖基转移酶作用下将糖转移至蛋白质,和蛋白质上的氨基酸残基共价结合。蛋白质经过糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是对蛋白的重要的修饰作用,有调节蛋白质功能作用。凝素亲和法是目前糖蛋白质组学中应用普遍的分离富集方法。凝集素(lectin)是一类糖结合蛋白质,能专一识别某一特殊结构的单糖或聚糖中特定的糖基序列而与之结合,它们与糖链可逆非共价结合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕获之后,通常用特定的单糖通过竞争结合凝集素将糖蛋白或糖肽洗脱下来。蛋白质经过酶解后利用凝集素(lectin)富集N-糖基化肽段,然后用N-糖酰胺酶(PNGase)在H218O中切除连接在天冬酰胺残基(Asn)上的糖链。蛋白质翻译后修饰组学磷酸化修饰具有可逆的特性。南京蛋白质乙酰化修饰组学主要技术

蛋白质翻译后修饰组学磷酸化修饰具有简单的特性。浙江泛素化修饰蛋白质组学质谱鉴定

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