蛋白质乙酰化修饰组学定量分析：1. SILAC细胞标记，组织/细胞破碎，提取、提纯目的蛋白质（基于SILAC的乙酰化修饰组学定量）。2. 使用胰蛋白酶将目的蛋白酶解成多肽片段。3. 对多肽片段进行iTRAQ标记（基于iTRAQ的乙酰化修饰组学定量）。4. 使用高效特异性乙酰化抗体对乙酰化修饰肽段进行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS对富集的乙酰化肽段进行序列分析。6. 数据分析，比对不同样本中蛋白乙酰化修饰水平差异，并对产生变化的生物学意义进行解释。蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的定位。浙江乙酰化修饰蛋白质组学技术服务

翻译后修饰蛋白组学分析：蛋白质组学的研究的工作不只聚焦于细胞不同生长时期或是疾病条件下的蛋白质表达水平变化，许多至关重要的生命进程不只由蛋白质相对丰度控制，更重要的是被时空特异分布的、可逆的翻译后修饰所调控，因而揭示翻译后修饰发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。蛋白质发生翻译后修饰时其分子质量会发生响应的改变，通过质谱能够精确测定蛋白质或多肽的分子质量。同时，发生翻译后修饰的蛋白质再样本中含量低且动态范围广，所以在质谱检测前需要对发生修饰的蛋白质或肽段进行富集。上海蛋白质棕榈酰化修饰组学目前对乙酰化修饰的功能研究主要集中在对细胞转录调控，以及对代谢通路的调控这两个方面。

蛋白质乙酰化修饰组学技术：乙酰化修饰是体内保守的可逆转的蛋白修饰，对细胞核内转录调控因子的刺激有着重要的作用。此外，还存在的非组蛋白乙酰化修饰参与了代谢通路及代谢酶活性的调节。采用肽段预分离降低高丰度组蛋白对蛋白乙酰化鉴定的影响，再结合免疫共沉淀通过抗体富集乙酰化的肽段，从而实现乙酰化的鉴定及定量。样品要求：1、SDS-PAGE条带：5个以上可见考染条带。2、溶液（目标蛋白质）：目标蛋白总量>50μg，目标蛋白浓度>80%。3、溶液（大规模混合蛋白质）：蛋白总量>1mg，蛋白浓度>1μg/μl。

蛋白质磷酸化修饰组学：磷酸化蛋白质是由蛋白激酶将ATP或GTP分子上的磷酸基团转移到底物蛋白特定的氨基酸侧链上形成的。蛋白质磷酸化是一种可逆的蛋白质翻译后修饰。在哺乳动物的细胞生命周期中，至少有三分之一的蛋白质发生磷酸化修饰。磷酸化修饰参与许多信号转导途径和细胞代谢过程，且许多已知的疾病也与蛋白质的异常磷酸化有关。因此，对磷酸化蛋白质组进行定量研究，寻找差异表达的磷酸化蛋白质，有助于发现疾病的生物标志物和寻找新的具有诊疗潜力的药物靶标。在众多乙酰化修饰的蛋白质中，研究较多的要数细胞核中包围DNA的组蛋白了。

蛋白质乙酰化修饰的功能：目前对乙酰化修饰的功能研究主要集中在对细胞转录调控，以及对代谢通路的调控这两个方面。在众多乙酰化修饰的蛋白质中，研究较多的要数细胞核中包围DNA的组蛋白了。组蛋白和DNA缠绕构成核小体，组蛋白的甲基化、乙酰化修饰能够调节DNA缠绕的松紧度，从而对基因表达进行调控，因此，组蛋白的翻译后修饰是表观遗传学研究中的重要一环。另外，研究也发现乙酰化修饰普遍存在于人的多种代谢酶之中，并且参与调控代谢通路以及代谢酶的活性。其中在肝脏这样的代谢中就存在着多种代谢酶被高度乙酰化。蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的活性。浙江乙酰化修饰蛋白质组学技术服务

质谱可以用于已知和未知的翻译后修饰检测。浙江乙酰化修饰蛋白质组学技术服务

质谱分析乙酰化蛋白质组：质谱分析技术可以对蛋白质组中的乙酰化蛋白进行鉴定、乙酰化位点定位以及定量。当质谱用于乙酰化定量蛋白组研究中时，因为乙酰化蛋白质在生物样本中含量低、动态范围广，需要先对乙酰化肽段进行富集，然后再对富集得到的乙酰化肽段样品进行定量分析。质谱定量乙酰化蛋白组采用肽段预分离降低高丰度蛋白的影响，结合免疫共沉淀通过高效的抗体富集乙酰化的肽段，从而实现大规模乙酰化的鉴定及定量。为了鉴定和定量更多的乙酰化肽段，在酶切过程中还可使用多种不同的酶对蛋白样品进行酶切。浙江乙酰化修饰蛋白质组学技术服务

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