LabelFree(非标记蛋白质组学技术)：在非标记策略的定量模型中，主要涉及两种不同的算法：其一，以肽段的色谱峰积分面积为基础，通过比较一对生物样品中相对应到蛋白质酶解多肽的色谱积分面积而得到两者的相对丰度；其二，以肽段被质谱检测的计数为基础，通过归一化来表征被检测蛋白质的相对丰度。非标记技术认为肽段在质谱中被捕获检测的频率（Counts）与其在混合物中的丰度成正相关，因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度，通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来，从而对蛋白质进行定量。蛋白质组学研究的首要任务是建立获取和分析蛋白质的常规、可靠、有效的技术。贵阳PRM靶向定量蛋白质组学研究

蛋白质组学，指对某一基因组所表达的所有蛋白质及其特征进行大规模、系统化地研究，以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。研究的内容主要包括：组成蛋白质一级结构氨基酸的序列特征、蛋白质的丰度、蛋白质活性、蛋白质的修饰、亚细胞定位和三维结构、蛋白质之间的相互作用以及对蛋白质的高阶复合物结构。质谱技术的发展为这些研究提供了有力的技术支撑，使得许多有实际应用的蛋白质组功能研究成为可能，包括翻译后修饰的整体分析，蛋白质相互作用网络的重建和模式生物蛋白表达谱的定量研究；在临床医学和转化医学研究中也越来越多地应用到蛋白质组学技术。广州蛋白质组学价钱iTRAQ定量是目前定量蛋白质组学应用比较普遍的技术。

蛋白质组学在医疗和健康方面有什么应用？基于质谱的蛋白质组学是目前比较主流的高通量蛋白质研究手段，当前在医疗健康方面的应用主要集中于基础研究和转化医学。随着质谱、系统生物学、生物信息学等相关学科的发展，我认为今后我们会更多地在现实生活中见到蛋白质组学相关的应用。如定量胰岛素、鉴定血红蛋白氨基酸突变（镰刀形红细胞症）、糖化血红蛋白比例测定等。从测试体量估计，应该远小于1%的ELISA测试量。由于成本和通量等原因，蛋白质组学技术并不如ELISA适合大量的日常分析。但对于一些分析有问题的项目，采用基于质谱（或二维胶等手段）的蛋白质组学有独特的技术优势。另外，蛋白质组学方法开发和验证周期短，在中高级特殊应用（如极少使用的特殊蛋白指标临床检测、未知疾病研究和控制）中也有其独特优势。

蛋白质组学：质谱分析蛋白质组学的基本原理主要是通过测定被测样品离子的理化性质来进行分析，根据样品的质量谱图和相关信息从而得到定性和定量结果。目前，蛋白质组学质谱分析一般是根据保留时间（retentiontime）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity）这三个维度对肽蛋白质进行鉴定和定量，即3D蛋白质组学。4D蛋白质组学在3D蛋白质组学的基础之上增加了第四维度，离子淌度（mobility），主要根据离子的形状和截面对离子进行分离，能够区分m/z差值非常小的肽段，使低丰度蛋白信号能够被区分和识别出来。4D蛋白质组学基于timsTOFPro质谱仪，结合PASEF（ParallelAccumulationSerialFragmentation，同步累积连续碎裂）与TIMS（TrappedIonMobilitySpectrometry，离子迁移谱），可重复测量所有检测离子的碰撞截面（CCS），能更快、更灵敏的进行蛋白质组定性和定量。在对早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治理方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景。

蛋白质组学主要以全蛋白组（组织、细胞）、线粒体蛋白组、叶绿体蛋白组和外泌体蛋白组为研究对象，通过对蛋白组进行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物学功能、作用机制、疾病诊断的标志物以及预测蛋白的上、下游变化关系。蛋白质组学可以克服核酸水平预测的不确定性、反映核酸翻译后修饰情况。常用技术：非靶向蛋白组学：蛋白质定性（胶条鉴定和溶液鉴定），高通量定量蛋白组（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽组学。目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。武汉Label free多肽组学质谱分析

蛋白质组学技术有飞行时间质谱。贵阳PRM靶向定量蛋白质组学研究

定量蛋白质组学技术：定量蛋白质组学技术主要分为标记（label）和非标记（labelfree）定量策略，标记策略又分为体内标记和体外标记两种。细胞内蛋白质组丰度的动态变化对各种生命过程有重要影响。例如在许多疾病的发生和发展进程中，常常伴随着某些蛋白质的表达异常。定量蛋白质组学就是把一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂的混合体系中所有的蛋白质进行精确的定量和鉴定。非标记（labelfree）的定量蛋白组学技术，Labelfree定量蛋白组学技术是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。贵阳PRM靶向定量蛋白质组学研究

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