蛋白组学样本寄送前是否需要精确计数或是称量？不同样本寄送会有不同的送样要求，按照收集方法提供可以保证实验用量充足。不需要精确计数或是称量，项目开展前会进行蛋白浓度的测定，后续也是不同样本等蛋白量处理、上机检测，但是要保证每个样本的寄样量达到实验要求。常规定量蛋白组实验的主要步骤有哪些，数据分析内容包含哪些？实验步骤：首先获得生物学样本，然后进行蛋白提取，定量，SDS-PAGE跑胶质控，还原烷基化，酶解，获得肽段，（标记+分组分），上机检测，搜库软件搜库，数据分析；数据分析：主要分为基础数据分析、?级数据分析和个性化数据分析三个部分?；》治鲋饕ú钜毂泶锏鞍咨秆?、层次聚类分析分析、COG注释分析、亚细胞定位分析、GO注释富集分析、KEGG注释分析、PPI分析等。蛋白质组学研究的首要任务是建立获取和分析蛋白质的常规、可靠、有效的技术。浙江Label free多肽组学分析方法

LabelFree(非标记蛋白质组学技术)：应用：1.需要快速在大量样本中找到差异表达的蛋白组合。2.需要在较短时间以较低成本得到具有提示意义的蛋白表达数据。3.需要检测的样品蛋白含量低。4.需要检测相互作用蛋白。技术特点：1.对质谱仪器设备要求较高，色谱和质谱需要同时有较好的稳定性和重复性。2.需要有特殊的定量分析软件。3.对样品中蛋白质总量要求较低，实验周期短，实验费用低。4.不需要额外并且昂贵的标记试剂，排除了标记过程带入实验误差的风险，同时也不必考虑标记效率的问题。北京定量乙?；鞍字首檠Я煊虻鞍字首檠П局噬现傅氖窃诖蠊婺Ｋ缴涎芯康鞍字实奶卣?。

蛋白组究竟研究的是什么呢？第1，蛋白质定性，或者说大规模检测某些蛋白质是否存在于样品当中；第2，蛋白质定量，也就是大规模检测某些蛋白质的含量（包括一定含量与相对含量）；第3，蛋白质翻译后修饰，这些修饰主要包括磷酸化，泛素化，糖基化，乙?；鹊龋舶ǘ哉庑┓牒笮奘蔚亩垦芯?。这三大块中所提到的大规模，既可以是样品数量的大规模高通量，也可以是少量样本中蛋白数量的大规模高通量。研究原因：首先，由于翻译调控和翻译后调控的存在，RNA的表达量与实际对应蛋白质的含量相关性并不高，就简单地测试了酵母中mRNA和对应蛋白质的定量相关性，结果是，低丰度蛋白与mRNA的相关性尤其低，而高丰度蛋白和其mRNA的相关性则高，经过平均后r值只为0.4。

蛋白质组学研究这样做：蛋白质组与基因组相对应，也是一个整体的概念，随着基因组学研究的不断深入，蛋白质组学已逐渐成为研究热点，对蛋白组学的研究可以使我们更容易接近生命的机理本质，但探究成千上万的蛋白质特性也是一个重大的技术挑战。蛋白质组（Proteome）指的是某一时刻或某一状态基因组表达的所有相应的蛋白，即细胞、组织或机体全部蛋白质的存在及活动形式，其是一个动态概念，它是在组织、细胞的整体蛋白质水平上，探索蛋白质作用模式、功能机理、调节控制以及蛋白质群体内的相互关系、从而获得生命活动调控网络的全方面而深入的认识，以揭示生命活动的基本规律。蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象，研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。

定量蛋白质组学方法学介绍：Label-free：Label-free定量，即非标记的定量蛋白质组学，不需要对比较样本做特定标记处理，只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化，通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量时所产生的质谱数据。Label-free定量不需要标记处理，操作简单，可以做任意样本的总蛋白质差异定量，但对实验操作的稳定性、重复性要求较高，准确性也较标记定量差。因此，Label-free技术适合于大样本量的定量比较，以及对无法用标记定量实现的实验设计。iTRAQ定量是目前定量蛋白质组学应用比较普遍的技术。南京新型修饰蛋白组学研究内容

定量蛋白质组学是蛋白质组研究的重要内容。浙江Label free多肽组学分析方法

蛋白质组学技术：等电聚焦：等电聚焦（isoelectricfocusing，IEF）是一种利用有pH梯度的介质分离等电点不同的蛋白质的电泳技术。等电聚焦凝胶电泳依据蛋白质分子的静电荷或等电点进行分离，等电聚焦中，蛋白质分子在含有载体两性电解质形成的一个连续而稳定的线性pH梯度中电泳。载体两性电解质是脂肪族多氨基多羧酸，在电场中形成正极为酸性，负极为碱性的连续的pH梯度。蛋白质分子在偏离其等电点的pH条件下带有电荷，因此可以在电场中移动；当蛋白质迁移至其等电点位置时，其静电荷数为零，在电场中不再移动，据此将蛋白质分离。浙江Label free多肽组学分析方法

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