蛋白质组学是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。蛋白质组学研究不只是探索生命奥秘的必须工作,也能为人类健康事业带来巨大的利益,是生命科学进入后基因时代的特征。蛋白质是生命存在和运动的物质基础,是细胞增殖、分化、衰老和凋亡等重大生命活动的执行者,亦是基因功能活动的执行者,是生命现象复杂性和多变性的直接体现者。蛋白质组研究是为了识别及鉴定一个细胞或组织所表达的全部蛋白质以及它们的表达模式,是对基因组研究的重要补充,是对生物体在蛋白质水平上定量、动态、整体性的研究。这类研究有助于了解蛋白的结构、细胞的功能、生命的本质及活动规律,为疾病的诊断、诊疗、疫苗及新药开发提供科学依据。蛋白质组学在应用中,更多地用于提供高通量蛋白质定性定量信息。河南外泌体蛋白质组学报价
蛋白质组学技术:飞行时间质谱:MALDI的基本原理是将分析物分散在基质分子(尼古丁酸及其同系物)中并形成晶体,当用激光(337nm的氮激光)照射晶体时,基质分子吸收激光能量,样品解吸附,基质-样品之间发生电荷转移使样品分子电离。它从固相标本中产生离子,并在飞行管中测定其分子量,MALDI-TOF-MS一般用于肽质量指纹图谱,非常快速(每次分析只需3~5min),灵敏(达到fmol水平),可以精确测量肽段质量,但是如果在分析前不修饰肽段,MALDI-TOF-MS不能给出肽片段的序列。广东定量N糖基化蛋白质组学一般流程蛋白质组学技术并带领生物技术取得关键性的突破。
蛋白质组学:蛋白质组一词,源于蛋白质与基因组两个词的组合,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全方面的认识。蛋白质组的研究不只能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析,我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”,它们可成为新药物设计的分子靶点,或者也会为疾病的早期诊断提供分子标志。确实,那些世界范围内销路*的药物本身是蛋白质或其作用靶点为某种蛋白质分子。因此,蛋白质组学研究不只是探索生命奥秘的必须工作,也能为人类健康事业带来巨大的利益。
蛋白质组学:常用技术:靶向蛋白组(PRM靶向蛋白/肽段定量),修饰蛋白组学(定量磷酸化修饰组学、定量糖基化修饰蛋白组学、定量乙酰化修饰蛋白组学和定量泛素化修饰蛋白组学),互作蛋白组学(代谢物与蛋白互作研究)。什么样本能做蛋白组学检测?大概可以测到多少的蛋白种类?原则上只要能提取到蛋白,就可以做蛋白组检测。样本测到的蛋白种类跟数据库和样本本身蛋白浓度有关,一般数据库越大,可以鉴定到的蛋白质数量越多。也与样本的类型有关,通常,组织细胞相比于体液样本,能够鉴定到更多的蛋白。蛋白质组学技术的发展已经成为现代的生物技术快速发展的重要支撑。
蛋白质组学发展趋势:1、基础研究方面:近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域,如细胞生物学、神经生物学等。在研究对象上,覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围,涉及到各种重要的生物学现象,如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等等。在未来的发展中,蛋白质组学的研究领域将更加普遍。2、应用研究方面:蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标比较有效的方法之一。在对早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治理方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景,目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。蛋白质组与基因组相对应,也是一个整体的概念。广东定量N糖基化蛋白质组学一般流程
iTRAQ定量是目前定量蛋白质组学应用比较普遍的技术。河南外泌体蛋白质组学报价
非标定量法(Label-free)是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度,分析不同来源样品蛋白的数量变化,认为肽段在质谱中被捕获检测的频率与其在混合物中的丰度成正相关,因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度,通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。按照其原理主要分为两种,第1种spectrumcounts类的非标记方法,发展比较早,已经形成多种定量算法,但是主要的原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础,各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。第二种非标记定量的原理是以MS1为基础,计算每个肽段的信号强度在LC-MS上的积分。河南外泌体蛋白质组学报价
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