circRNA转录组学成环机制：circRNA环化方式分为内含子环化和外显子环化。目前主流的成环机制可归类为：依赖于剪切体的索尾插接环化。在mRNA前体上，通过连续的组装小核核糖体蛋白从而催化外显子下游的5′供体的位点连接到上游的3′受体的位点，索尾插接形成环化，然后通过剪切形成circRNA。顺式作用元件促进circRNA形成。部分circRNA外显子两侧的内含子中含有反向互补序列，首先在剪切位点上并排形成RNA双链体，再通过可变剪切形成带内含子和不带内含子两种不同的circRNA。或者外显子内部以及两侧的内含子可以竞争进行RNA配对，然后通过可变剪切形成不同类型的circRNA。转录组学测序可以同时测到mRNA、lncRNA、micRNA以及circRNA么？北京SmalIRNA转录组学分析鉴定

转录组学应用于胃肠瘤转移机制研究：circRNA是一种非编码RNA，可以多种方式参与生物学功能，如细胞增殖、细胞周期、侵袭和转移等。近年来研究发现，环状RNA可以通过海绵吸附微小RNA和RNA结合蛋白参与转录后调控，从而影响瘤耐药过程中的DNA修复、凋亡、增殖、细胞转运，以及介导瘤耐药的细胞内酶，进而在瘤耐药中发挥重要调节作用。有研究证实通过干扰环状RNA的表达，可以提高瘤对药物的敏感性，提示环状RNA可能为抗瘤药物耐药性的研究提供新的靶点。武汉单细胞转录组学主要技术转录组学能准确地识别可变剪切位点及cSNP，UTR区域。

全转录组测序为什么需要构建两个文库？全转录组测序需要构建2个测序文库，一个小RNA文库和一个去除核糖体RNA的链特异性文库，然后分别上机测序。小RNA长度较短，一般小于50nt，采用测序策略为50SE。其他三类RNA序列一般大于200，通常在1000以上，可达几万，通过片段化构建150PE测序文库。然后小RNA文库可以获得miRNA序列信息，去核糖体的链特异性文库可以获得mRNA、lncRNA和circRNA的序列信息。转录组学即特定细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。

转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整转录信息的汇合，表示了基因表达的中间状态。转录组测序可以对所有转录物进行分类、确定基因的转录结构、量化转录物的表达水平。蛋白质是生命功能的直接执行者，蛋白组是一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。整合转录组学和蛋白质组学的表达数据对生物样本进行研究，可以从整体上解释生物学问题，探究生物体生理和疾病机理等。转录组学应用于胃肠瘤发生机制研究：利用转录组学可检测瘤细胞恶化过程中的RNA（编码RNA及非编码RNA）的变化，有助于更好地理解胃肠瘤的发生机制。转录组学测序样品纯度要求，电泳检测28S:18S至少大于1.8。

转录组学，基因组学，蛋白质组学的区别：蛋白组学针对的是全体蛋白，组要以2D-Gel和质谱为主，分为top-down和bottom-up分析方法。理念和基因组类似，将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段，在通过质量反推蛋白序列，之后进行搜索，标识已知未知的蛋白序列。转录组学研究的是某个时间点的mRNA总和，可以用芯片，也可以用测序。芯片是用已知的基因探针，测序则有可能发现新的mRNA。基因组学研究的主要是基因组DNA，使用方法目前以二代测序为主，将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。当然这只是第1步，随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作。转录学组测序能够提供更普遍的检测范围。武汉全长转录学组领域

普通转录组测序主要适用于不同的生长阶段或者发育过程。北京SmalIRNA转录组学分析鉴定

转录组学（Transcriptome）广义上指某一生理条件下，细胞内所有转录产物的汇合，包括信使RNA(mRNA)、核糖体RNA(rRNA)、转运RNA(tRNA)及非编码RNA(ncRNA)；狭义上指所有mRNA的汇合。转录组具有很强的时间和空间特性，是基因功能及结构研究的基础和出发点，掌握了生物个体基因转录水平的变化，可深入了解其生命活动特征和调控机制。通过新一代高通量测序，能够全方面快速地获得某一物种特定组织在某一状态下的几乎所有转录本的基因序列信息。北京SmalIRNA转录组学分析鉴定

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