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甘肃系统进化小基因组测序要多少钱

来源: 发布时间:2021-09-06

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标准分析:

1.测序数据概况

(1) 原始测序数据说明

(2) 测序数据质控及统计

(3) 三代测序数据统计

2.基因组组装

3. 基因组组分分析

(1) 编码基因分析

(2) ORFs扫描及跨膜结构预测

(3) 非编码RNA分析

4. 基因功能注释

 基因组圈图

高级分析:


比较基因组分析

1.SNP检测与注释

2.Indel检测与注释

3.SV检测

4.基因组共线性分析

5.线粒体与叶绿体基因组片段交流分析

6.共有和特有基因分析

7.系统进化分析、选择压力分析

定制化生信分析

1.密码子偏好性分析

2.长重复序列Long repeat分析

3.简单重复序列SSR分析

4.基因表达量及表达差异分析(可由客户提供RNAseq) 上海植物叶绿体基因组小基因组测序要多少钱您知道云生物的小基因组测序系列都有哪些吗?

    eggNOG全称为evolutionarygenealogyofgenes:Non-supervisedOrthologousGroups,是一个蛋白聚类数据库,带有功能描述和功能类别说明,由EMBL(欧洲分子生物实验室)维护。包含1,133个物种、共721,801个直系同源组、共41个不同水平的直系同源组分类,整合了5,214,234个蛋白序列。分别更新了4,873个COG数据库信息和4,850个KOG数据库信息。GO全称为GeneOntology,一套国际标准化的基因功能描述的分类系统。GO其分为三大类:1)细胞组分(CellularComponent):用于描述亚细胞结构、位置和大分子复合物,如核仁、端粒和识别起始的复合物等;2)分子功能(MolecularFunction):用于描述基因、基因产物个体的功能,如与碳水化合物结合或ATP水解酶活性等;3)生物过程(BiologicalProcess):用来描述基因编码的产物所参与的生物过程,如有丝分裂或嘌呤代谢等。Swiss-Prot,是2002年由UniProtconsortium建立的基因数据库,其特点在注释结果经过实验验证,可靠性较高,可用作其他数据的参考。

叶绿体基因组 | “**”遗传资源开发新模式:陆地表面分布着由许多植物组成的各种植物群落,它与气候、土壤、地形、动物界及水状况等自然环境要素密切相关。近年来,植物叶绿体基因组SSR(gSSR)遗传资源标记的开发检测到了更高水平的多态性而引起更多关注,为更***地了解东亚人口、分歧历史以及气候变化的影响提供了理想的模型。选取虎耳草科近源的2种独草根属(Oresitrophe)和1种槭叶草属(Mukdenia)植物为研究对象,测序并获取叶绿体基因组。


小基因组测序的优点有很多。

云生物专注于生物医药科研平台服务及基因检测定制,包括测序、芯片、数据库建设、软件开发以及其他科研解决方案和民用型基因检测产品。云生物拥有多个经验丰富、可提供一对一个性化定制分析服务的实验室平台,包括基因调控(ATAC-seq、CHIP-seq、Hi-C测序)、分子生物(数字PCR、荧光定量PCR、焦磷酸测序、PGM)、核酸测序(基因组、转录组、多样性)、芯片检测(基因芯片、蛋白芯片、组织芯片、PCR芯片)、蛋白代谢(蛋白组、代谢组、脂质组)、形态影像(免疫组化)、蛋白定量(定量Wes检测)、细胞生物(细胞生物学、ips、CRISPR/Cas9、细胞株构建)、生物信息(在线系统、软件开发、相关数据库)和转化应用(Microbe Trakr)等等。想要做小基因组测序?您要先了解小基因组测序的特点。天津动植物线粒体基因组小基因组测序售后服务

小基因组测序DNA质检需要多久?甘肃系统进化小基因组测序要多少钱

    采用二代IlluminaHiseq结合三代PacBio测序技术对样本DNA进行基因组测序,分别构建了IlluminaPE文库(300-500bp)和PacBio文库(8~10kb),对获得的测序数据利用生物信息学分析方法完成基因组完成图绘制。信息分析主要分为6大步骤:1.下机数据质控。过滤测序质量值低的reads,过滤duplicationreads,获得高质量的Cleandata;2.基因组组装。利用组装软件对Cleandata进行组装,多次调整参数及补洞后获得基因组完成图序列;3.基因组组分分析。组装完成后,分析样品的基因组组分,包括编码基因、ncRNA等;4.基因功能注释。与通用功能数据库比对获得样本的基因功能注释信息,并对特定功能进行分类;5.比较基因组分析。从基因组、基因两个层面比较样品与参考基因组的差异,包括共线性比较,SNP、Indel、SV检测,Core-Pan分析,物种进化分析等;6.基因组可视化分析。将编码基因、ncRNA、基因组GC%等信息以圈图的形式展示。 甘肃系统进化小基因组测序要多少钱

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