传统定量PCR方法简介:1)内参照法:在不同的PCR反应管中加入已定量的内标和引物,内标用基因工程方法合成。上游引物用荧光标记,下游引物不标记。在模板扩增的同时,内标也被扩增。在PCR产物中,由于内标与靶模板的长度不同,二者的扩增产物可用电泳或高效液相分离开来,分别测定其荧光强度,以内标为对照定量待检测模板。2)竞争法:选择由突变克隆产生的含有一个新内切位点的外源竞争性模板。在同一反应管中,待测样品与竞争模板用同一对引物同时扩增(其中一个引物为荧光标记)。扩增后用内切酶消化PCR产物,竞争性模板的产物被酶解为两个片段,而待测模板不被酶切,可通过电泳或高效液相将两种产物分开,分别测定荧光强度,根据已知模板推测未知模板的起始拷贝数。3)PCR-ELISA法:利用地高辛或生物素等标记引物,扩增产物被固相板上特异的探针所结合,再加入抗地高辛或生物素酶标抗体-辣根过氧化物酶结合物,终酶使底物显色。常规的PCR-ELISA法只是定性实验,若加入内标,作出标准曲线,也可实现定量检测目的。PCR 反应中通过控制温度变化使得核酸分子重复地解链与延伸,从而实现对目的片段的指数扩增。珠三角相对定量qPCR仪厂家
实时荧光定量PCR技术有效地解决了传统定量只能终点检测的局限,实现了每一轮循环均检测一次荧光信号的强度,并记录在电脑软件之中,通过对每个样品Ct值的计算,根据标准曲线获得定量结果。因此,实时荧光定量PCR无需内标是建立在两个基础之上的:1)Ct值的重现性PCR循环在到达Ct值所在的循环数时,刚刚进入真正的指数扩增期(对数期),此时微小误差尚未放大,因此Ct值的重现性极好,即同一模板不同时间扩增或同一时间不同管内扩增,得到的Ct值是恒定的。2)Ct值与起始模板的线性关系由于Ct值与起始模板的对数存在线性关系,可利用标准曲线对未知样品进行定量测定,因此,实时荧光定量PCR是一种采用外标准曲线定量的方法。外标准曲线的定量方法相比内标法是一种准确的、值得信赖的科学方法。利用外标准曲线的实时荧光定量PCR是迄今为止定量准确,重现性比较好的定量方法,已得到全世界的公认,范围广用于基因表达研究、转基因研究,药物疗效考核、病原体检测等诸多领域。湛江灵敏度qPCR仪厂家q225pcr无需参比染料、无需定期校准,更加简化的操作流程与减轻的维护负担只为更好地专注于实验。
而在指数增长期,由于底物充足,聚合酶活性高,反应产物以指数形式积累,且与初始模板量存在定量关系,因此,在该时期对模板起始量进行定量分析准确且重复性比较好。Ct值,是在指数增长期内,荧光信号到达荧光检测阈值时所经历的循环数,其中C循环(Cycle),t阈值(threshold)。每条扩增曲线的Ct值都与初始模板量的对数存在线性关系,初始模板的拷贝数浓度越高,对应的Ct值越小;反之则越大。因此,先根据已知拷贝数浓度标准品的扩增曲线拟合出标准曲线方程,再将样本扩增曲线的Ct值代入标准曲线方程中,便可计算未知样本初始模板的拷贝数浓度,从而实现定量分析。
qPCR的荧光标记方法分为以SYBR Green I染料法为主的荧光染料嵌合法,以Taqman探针法为主的荧光探针法(Cycling Probe,Molecular Bracon等),淬灭染料引物法。SYBR Green I 是高灵敏度的非特异性双链DNA荧光染料,具有绿色激发波长。它以非特异性方式结合在dsDNA双螺旋小沟区域。游离的SYBR Green I 只发出极弱的荧光信号,PCR过程中,当扩增生成dsDNA时,SYBR Green I 逐渐与dsDNA结合,荧光信号被千倍放大,荧光信号的强度与扩增得到的dsDNA的浓度成正比。荧光信号被仪器检测并采集得到“扩增曲线”,通过荧光信号的强度反映出体系中dsDNA的浓度。终点法检测(也称 “读板检测”)测量的是PCR循环结束时累计的PCR产物量。
PCR反应需要五种关键试剂:PCR模板:也称为模板DNA,需要常规的试剂盒进行提取。如基因组DNA(gDNA),cDNA和质粒DNA。DNA聚合酶:所有PCR反应都需要可在高温下工作的DNA聚合酶。Taq聚合酶是一种常用的酶,它可以在70°C时以60个碱基/秒的速率整合核苷酸,并可以扩增高达5kb的模板,使其适用于无特殊要求的标准PCR。引物:DNA聚合酶需要短序列的核苷酸,以指示它们需要在哪里开始扩增。在PCR中,这些序列称为引物,是单链DNA的短片段(约15-30个碱基)。脱氧核苷酸三磷酸(dNTPs):是合成DNA新链的基础,包括四个基本DNA核苷酸(dATP,dCTP,dGTP和dTTP)。PCR缓冲液:PCR缓冲液可确保在整个PCR反应过程中保持比较好条件。PCR缓冲液的主要成分包括氯化镁(MGCl2,充当DNA聚合酶的辅助因子),tris-HCl和氯化钾(在反应过程中保持稳定的pH值)。目前市面上已经有很多成熟的包含PCR缓冲液的Taq聚合酶。使用 PCR 扩增 DNA 是当今实验室的一项基础技术,创新不断将其应用范围从研究实验室扩展到临床。广州准确qPCR仪报价
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qPCR中的荧光探针是一种短链寡核苷酸,带有荧光基团和淬灭基团,它可以特异结合目的产物的DNA序列。其检测原理是荧光共振能量转移(FRET),即荧光基团和淬灭基团在目标DNA分子扩增过程中因为聚合酶的外切活性从而水解分离使荧光信号的释放;随着扩增过程的推进,机器实时检测增强的荧光信号,从而产生终的荧光扩增曲线。根据修饰基团标记和能量转移方式,可以将探针分为TaqMan探针、分子信标和其他探针。TaqMan探针(荧光淬灭水解探针)现今常用的TaqMan探针主要是水解探针,其多是5’端标记荧光基团,3’端标记淬灭基团的短单链寡聚核苷酸。在qPCR反应中,基于TaqDNA聚合酶的5’-3’核酸外切酶活性,对TaqMan探针进行切割,使荧光基团和猝灭基团分离,荧光基团发出的荧光信号不会被淬灭,释放的荧光信号被机器接收。TaqMan探针的qPCR相比于染料法多了一条TaqMan探针,可以特异性结合DNA序列,因而具有更好的特异性,但探针合成价格偏高。珠三角相对定量qPCR仪厂家
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