蛋白质学组翻译后修饰自下而上分析策略:常用的糖蛋白分离和富集技术有:a. 凝集素亲和技术;b. 肼化学富集;c. 亲水性相互作用色谱法;d. β-消除/迈克尔加成反应。基于质谱的糖蛋白鉴定和糖基化位点测定方法有:a. PNGase F酶法;b. Endo H酶法;c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化:泛素是一种由76个氨基酸组成的多肽,在真核生物中高度保守,可通过异肽键与目标蛋白赖氨酸残基的氨基进行共价连接。泛素化蛋白的富集主要基于标记,泛素用亲和标签(通常为6xHis)进行标记,并通过镍螯合色谱亲和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端为Arg-Gly-Gly结构,经胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修饰蛋白的肽链上,使肽的质量增加114,因此可作为泛素定位位点的质量标记。用HPLC对样品进行预分离,使用针对特定残留结构的抗体富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的浓度。串联质谱可以鉴定泛素化位点。自中而下的蛋白质组学技术可用于组蛋白修饰的分析。山东蛋白质氧化修饰组学费用
蛋白质学组翻译后修饰分析:组蛋白是一类高度保守的蛋白质,是染色质的关键成分,是DNA包装的结构单位。组蛋白的功能受其翻译后修饰介导。组蛋白翻译后修饰包括通过丝氨酸或苏氨酸残基的磷酸化,赖氨酸或精氨酸的甲基化,赖氨酸的乙酰化和脱乙酰基,赖氨酸的泛素化和磺酰化等对组蛋白进行的共价修饰。组蛋白这些修饰对于核完整性至关重要,因为它们可以调节染色质结构并募集参与基因调节、DNA修复和染色体浓缩的酶。组蛋白的翻译后修饰大多位于N末端的尾巴上,因为N末端是蛋白质中比较暴露和比较灵活的区域。分析组蛋白翻译后修饰有助于探索组蛋白修饰与染色体浓缩、DNA转录等生物功能之间的关系。南京丙二酰化修饰蛋白质组学服务通过蛋白质翻译后修饰也进一步增加了细胞通路机制和生命活动的多样性和复杂性。
蛋白磷酸化修饰过程:蛋白磷酸化修饰这一过程是通过蛋白激酶催化,将磷酸基团从ATP转移到多肽底物的丝氨酸、苏氨酸,或酪氨酸残基上。并且磷酸化修饰的过程是可逆的,去磷酸化反应由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化检测方法:Western Blot检测方法:Western Blot是检测蛋白磷酸化水平的常用方法,主要过程为先利用SDS-PAGE分离蛋白质,随后将蛋白质转移到PVDF膜上,然后使用特异性识别磷酸化蛋白的抗体来鉴定目标蛋白的磷酸化水平。只有被磷酸化修饰的蛋白才会在相应分子质量的地方显现特异性蛋白条带。
蛋白磷酸化检测方法:一、Western Blot检测方法优势:1. WB方法简便,多数实验室具备Western Blot设备条件。2. 许多磷酸化抗体十分灵敏,能够检测低至10ug的蛋白样品。3. 对于丰度低的蛋白,可以先通过IP使用目标蛋白的抗体对目标蛋白进行富集,再进行WB检测被磷酸化的蛋白,检测效率可以提高几倍甚至几十倍。二、质谱检测方法:Western Blot的方法虽然简便,但是对于大规模分析复杂的生物样品的磷酸化水平就不再适用了。而质谱却能很好的解决这一问题。依靠高准确度质谱仪,如今快速准确分析细胞中高丰度蛋白的磷酸化修饰已是非常简单的事。具体的检测方法为先通过SDS-PAGE胶,或者2D-PAGE胶等分离目标蛋白,将含有目标蛋白的条带切下,胰酶消化,LC-MS/MS检测分析蛋白序列和相应位点的磷酸化修饰。这个方法适用于同时检测多个目标蛋白的磷酸化水平。蛋白质磷酸化修饰的免疫印迹技术优点:检测特异性高。
蛋白质翻译后修饰分析策略:早期蛋白质组研究的大部分工作集中在细胞生长的不同时期,或疾病或有丝分裂原刺激后的蛋白质表达水平的变化。然而,许多生命过程不只受蛋白质的相对丰度控制,还受时空分布可逆的翻译后修饰控制。因此,揭示翻译后修饰的规律是了解蛋白质复杂性和多样的生物学功能的前提。蛋白质的翻译后修饰是一个复杂的过程。目前,发现的比较常见的修饰类型是糖基化、泛素化和磷酸化。样品中翻译后修饰蛋白质含量低、动态范围广给相关研究带来了很大的挑战。基于翻译后修饰蛋白的异质性和相对丰度低的特点,主要利用凝胶、生物质谱和生物信息学工具对其进行研究。用于PTM分析的质谱方法类似于用于“常规”蛋白质鉴定的方法,包括自下而上、自中而下和自上而下的蛋白质组学分析。蛋白质翻译后修饰组学磷酸化修饰具有简单的特性。四川磷酸化修饰蛋白质组学领域
蛋白质磷酸化修饰组学具有有效性。山东蛋白质氧化修饰组学费用
蛋白质翻译后修饰组学:蛋白质翻译后修饰(Post-translational modification, PTM)是指对翻译后的蛋白质进行共价加工的过程。它通过在一个或多个氨基酸残基加上修饰基团,可以改变蛋白质的物理、化学性质,进而影响蛋白质的空间构象和活性状态、亚细胞定位、折叠及其稳定性以及蛋白质-蛋白质相互作用。蛋白质翻译后修饰的丰度变化在生命活动研究中具有重大意义,异常的翻译后修饰会导致多种疾病的发生。质谱可以分辨蛋白质修饰前和修饰后分子量上的变化,因此只要知道靶蛋白翻译后修饰前后分子量的变化,就能对翻译后修饰方式进行鉴定和定量。山东蛋白质氧化修饰组学费用
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