如何获得高质量GC/MS代谢组学数据?实验设计先不谈,在仪器分析阶段,若想获得高质量数据,有以下几个方面需要注意。1)前处理方法的一致性。不同实验人员操作方式不尽相同。因此,一个项目应当只由一个人负责前处理。推荐使用自动衍生设备,以减少人为的误差。2)检测之前需确保仪器处于比较好工作状态。仪器的控制软件都有系统自检功能,可以快速便捷地核查质谱仪器的状态。但更重要的是气相色谱状态,推荐使用一组混标作为仪器质控。在每一个项目开始之前,先进行质控样检测,确认气相色谱的分离度和质谱的整体响应。3)后期数据矫正,特别是对于大样本项目。我们可以在检测序列中加入随行质控样本(每个样品取少量后混合),在后期数据处理时,使用质控样本结合如LOESS之类的算法对整体数据进行矫正。代谢组学与临床化学较为相似。南京LC-MS/MS非靶向脂质组学检测多少钱
GC-MS非靶向代谢组学能检测到哪些类别的代谢物?衍生化极大地拓展了GC/MS的检测分析范围。GC/MS能检测到有机酸、氨基酸、单糖、糖醇、胺类、脂肪酸、吲哚、单甘油酯、核苷、二糖、生育酚、甾醇和胆汁酸等代谢物。如何提高定性准确度?GC/MS的定性有双重标准,一是保留指数,二是质谱信息的相似度(similarity)。不同于LC/MS的软电离源,GC/MS使用的EI源属于硬电离,能量较强且稳定,在将代谢物分子电离后,分子离子峰进一步碎裂产生丰富的碎片离子。因此,我们很难在GC/MS上看到分子离子峰。GC/MS提供的是代谢物的“指纹图谱”,将仪器得到的实际指纹图谱和质谱库(如NIST库)进行比对后,我们将会得到一个叫相似度的指标。保留指数和相似度都必须满足设定的阈值,软件才会给出色谱峰的定性结果。然后采用标准品质谱信息进行完全比对定性,也就是说只有经过标准品比对,代谢物才是被100%定性。深圳靶向代谢组学检测多少钱代谢组学技术可应用于疾病早期诊断。
代谢组学概念:代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW<1000)。 在食品安全领域,利用代谢组学工具发现农兽药等在动植物体内的相关生物标志物也是一个热点领域。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。主要技术手段是核磁共振(NMR),质谱(MS),色谱(HPLC,GC),其中以NMR为主。通过检测一系列样品的NMR 谱图,再结合模式识别方法,可以判断出生物体的病理生理状态,并有可能找出与之相关的生物标志物(biomarker)。
代谢组学需要多少的生物学重复?生物学重复指的是相同处理的相同类型的生物样本的数量(如相同剂量给药后2小时的小鼠采集并且相同储存条件和处理方法血清样本)。相较于基因和蛋白,代谢物处于生命活动的下游,收到环境和遗传背景等因素影响较大,生物学重复少可能会放大组内差异对于整体差异的影响,进而影响结果(如准确和足够多的找出生物标志物)。因此根据不同的生物类型,需要不同的生物学重复来增加数据的可靠性和说服力。代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似。选择代谢组学作为科研技术手段的优势有哪些?
代谢组学疾病诊断应用:与基因组学和蛋白质组学相比, 代谢组学的研究侧重于相关特定组分的共性,是要涉及研究每一个代谢组分的共性、特性和规律,目前据此目标相距甚远。尽管充满了挑战,研究人员仍然坚信,与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学与生理学的联系更加紧密。疾病导致机体病理生理过程变化,引起代谢产物发生相应的改变,通过对某些代谢产物进行分析,并与 正常人的代谢产物比较,寻找疾病的生物标记物,将提供一种较好的疾病诊断方法。代谢组学研究对象大都是相对分子质量1000以内的小分子物质。河南脂质代谢组学多主要技术
代谢组学效仿了基因组学和蛋白质组学的研究思想。南京LC-MS/MS非靶向脂质组学检测多少钱
药物代谢和代谢组学区别:代谢组学与药物代谢不同是它关注的对象不是外源性的药物而是生物体本身就有的内源性代谢物。这些代谢物是糖,脂肪,蛋白质,核酸,胆汁酸等等代谢得到的。还有共生菌代谢的,是一个庞大的混合物。目的是通过样本的对比,发现潜在标志物,指导疾病早期诊断甚至基因水平的研究。而药物代谢的目标是只要只要追踪到这种药物分子在体内变化就好,相当具有靶向性,因此使用的技术手段就是LC-MS。检测药物的中间体,和具体的药效,药代动的效应。南京LC-MS/MS非靶向脂质组学检测多少钱
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