蛋白磷酸化检测方法：质谱检测方法优势：1. 准确度高，能够同时检测多个蛋白的多个磷酸化位点。2. 适用于大规模分析蛋白磷酸化水平。3. 不依赖于磷酸化抗体。在实际应用中，Western Blot与质谱分析方法各有各的好，谁也无法完全被另一种方法所替代。所以在选择测定磷酸化修饰的时候还应该根据具体需要来决定。如果研究的蛋白正好有商业化的磷酸化抗体，那么lucky you，你可以选择Western Blot进行快速磷酸化测定研究。但是如果你所研究的蛋白质没有可用的商业化磷酸抗体，或是抗体价效过低，亦或是需要大规模地检测细胞内磷酸化蛋白的水平的话，质谱检测会是更好地选择。乙酰化修饰是体内高度保守的可逆转的蛋白修饰。贵阳蛋白质氧化修饰组学质谱分析

蛋白质学组翻译后修饰自下而上分析策略：常用的糖蛋白分离和富集技术有：a. 凝集素亲和技术；b. 肼化学富集；c. 亲水性相互作用色谱法；d. β-消除/迈克尔加成反应。基于质谱的糖蛋白鉴定和糖基化位点测定方法有：a. PNGase F酶法；b. Endo H酶法；c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化：泛素是一种由76个氨基酸组成的多肽，在真核生物中高度保守，可通过异肽键与目标蛋白赖氨酸残基的氨基进行共价连接。泛素化蛋白的富集主要基于标记，泛素用亲和标签（通常为6xHis）进行标记，并通过镍螯合色谱亲和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端为Arg-Gly-Gly结构，经胰蛋白酶水解后，Gly-Gly保留在修饰蛋白的肽链上，使肽的质量增加114，因此可作为泛素定位位点的质量标记。用HPLC对样品进行预分离，使用针对特定残留结构的抗体富集泛素化肽，可很大程度上提高泛素化蛋白的浓度。串联质谱可以鉴定泛素化位点。江苏蛋白质丙酰化修饰组学领域蛋白质磷酸化修饰的免疫印迹技术优点：检测特异性高。

质谱分析乙酰化蛋白质组：质谱分析技术可以对蛋白质组中的乙酰化蛋白进行鉴定、乙酰化位点定位以及定量。当质谱用于乙酰化定量蛋白组研究中时，因为乙酰化蛋白质在生物样本中含量低、动态范围广，需要先对乙酰化肽段进行富集，然后再对富集得到的乙酰化肽段样品进行定量分析。质谱定量乙酰化蛋白组采用肽段预分离降低高丰度蛋白的影响，结合免疫共沉淀通过高效的抗体富集乙酰化的肽段，从而实现大规模乙酰化的鉴定及定量。为了鉴定和定量更多的乙酰化肽段，在酶切过程中还可使用多种不同的酶对蛋白样品进行酶切。

蛋白质糖基化修饰组学技术：糖基化是在酶的控制下,蛋白质或脂质附加上糖类的过程,发生于内质网和高尔基体等部位。在糖基转移酶作用下将糖转移至蛋白质,和蛋白质上的氨基酸残基共价结合。蛋白质经过糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是对蛋白的重要的修饰作用,有调节蛋白质功能作用。凝素亲和法是目前糖蛋白质组学中应用普遍的分离富集方法。凝集素（lectin）是一类糖结合蛋白质，能专一识别某一特殊结构的单糖或聚糖中特定的糖基序列而与之结合，它们与糖链可逆非共价结合，糖蛋白或糖肽被凝集素捕获之后，通常用特定的单糖通过竞争结合凝集素将糖蛋白或糖肽洗脱下来。蛋白质经过酶解后利用凝集素（lectin）富集N-糖基化肽段，然后用N-糖酰胺酶（PNGase）在H218O中切除连接在天冬酰胺残基（Asn）上的糖链。蛋白质翻译后修饰组学磷酸化修饰具有简单的特性。

蛋白质磷酸化修饰类型：根据磷酸氨基酸残基的不同，可将磷酸化蛋白质分为4类，即O-磷酸盐蛋白质、N-磷酸盐蛋白质、酰基磷酸盐蛋白质和S-磷酸盐蛋白质。1、O-磷酸盐蛋白质通过羟氨基酸（如丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸）的磷酸化形成。2、 N-磷酸盐蛋白质通过精氨酸、赖氨酸或组氨酸的磷酸化形成。3、 酰基磷酸盐蛋白质通过天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸盐蛋白质通过半胱氨酸磷酸化形成。蛋白质磷酸化修饰鉴定方法：免疫印迹技术是在凝胶电泳和固相免疫测定技术基础上发展起来的、根据特定抗原-抗体的特异性反应来检测复杂样品中的某种蛋白质的免疫生化分析方法。在细胞中，乙酰化修饰的反应由乙酰基转移酶所催化，将乙酰辅酶A的乙酰基转移并添加在蛋白质赖氨酸残基上。湖北蛋白质棕榈酰化修饰组学类型

蛋白质乙酰化修饰组学技术对细胞核内转录调控因子的刺激有着重要的作用。贵阳蛋白质氧化修饰组学质谱分析

蛋白质学组翻译后修饰的研究策略：自中而下：自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一种替代方法，分析组蛋白时其原理类似于自下而上分析策略。在使用这种分析方法时，通常需要将被检测蛋白质消化成3-9kDa范围内的肽段，因此也无法保证检测到的肽段的完整性。但是，由于仪器的进步和保留了组蛋白尾部的组合修饰，自中而下分析法正逐渐受到欢迎。自中而下更接近于自下而上法的灵敏度。自上而下：自上而下技术可以直接对完整的蛋白质进行测序，包括翻译后修饰的蛋白质和其他大的蛋白质片段，而不只是肽段。这可以比较大程度地保留与PTMs相关的信息，使其适用于组蛋白的全方面表征和分析。自上而下技术对蛋白质的有效分辨率已达到229kDa，一次可以检测到的蛋白质数量也在增加。贵阳蛋白质氧化修饰组学质谱分析

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