蛋白质组学研究这样做:蛋白质组与基因组相对应,也是一个整体的概念,随着基因组学研究的不断深入,蛋白质组学已逐渐成为研究热点,对蛋白组学的研究可以使我们更容易接近生命的机理本质,但探究成千上万的蛋白质特性也是一个重大的技术挑战。蛋白质组(Proteome)指的是某一时刻或某一状态基因组表达的所有相应的蛋白,即细胞、组织或机体全部蛋白质的存在及活动形式,其是一个动态概念,它是在组织、细胞的整体蛋白质水平上,探索蛋白质作用模式、功能机理、调节控制以及蛋白质群体内的相互关系、从而获得生命活动调控网络的全方面而深入的认识,以揭示生命活动的基本规律。蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征。PRM定量蛋白质组学一般流程
常规蛋白质组学:Labelfree多肽组学:顾名思义,就是不使用任何标记方法,直接对肽段进行质谱鉴定和定性定量分析。实验流程简单,只需要对蛋白进行常规酶解和除盐步骤即可上机。定量方式分为两种:峰面积(Peakintensity)和峰计数(Spectralcount),常用的是峰面积。不过,由于质谱采集时只选取topN的母离子进行二级碎裂和MS2检测,所以会丢失一些丰度较低的肽段信息,缺失值比较多。TMT/iTRAQ标记定量蛋白组学:TMT全称是TandemMassTag,是经典化学标记试剂,普遍用于差异表达蛋白质组分析研究中。该技术采用6重、10重或16重同位素标签,与肽段的氨基发生共价结合反应,可实现同时对6个/10个/16个不同样品中蛋白质的定性和定量分析。(目前16标鹿明生物可提供技术服务)。广东蛋白质组学价格蛋白质组与基因组相对应,也是一个整体的概念。
PRM靶向定量蛋白质组学分析流程是怎样的?要做PRM首先要明确目标蛋白(或多肽)是什么,设计和建立针对这些目标蛋白PRM质谱采集方法,然后对待测样品进行PRM数据采集,将得到的原始谱图数据导入分析软件提取子离子信息进行定量。另外,如果配制已知浓度的标准肽段,用PRM额外做一个标准曲线,即可实现一定的定量。PRM靶向定量蛋白质组学技术能应用到哪些方面?研究工作中涉及到蛋白或多肽定量的都可以通过PRM技术来实现。具体说来,比如验证定量蛋白质组学中某些蛋白的变化,多肽的相对和一定的定量,想做蛋白定量却没有抗体,针对蛋白修饰位点的定量,想同时定量多个蛋白的情况等,都可以用PRM来做。
蛋白质组学发展趋势:技术发展方面:蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存,各有优势和的特点,而难以象基因组研究一样形成比较一致的方法。除了发展新方法外,更强调各种方法间的整合和互补,以适应不同蛋白质的不同特征。另外,蛋白质组学与其它学科的交叉也将日益明显和重要,这种交叉是新技术新方法的活水之源,特别是,蛋白质组学与其它大规模科学如基因组学,生物信息学等领域的交叉,构成组学(omics)生物技术研究方法,所呈现出的系统生物学(SystemBiology)研究模式,将成为未来生命科学比较令人激动的新前沿。蛋白质组可以随着组织、甚至环境状态的不同而改变。
蛋白组学技术:质谱技术相较于传统蛋白质鉴定技术而言,拥有灵敏、准确、高通量、自动化等特点。质谱鉴定蛋白质的基本原理是先将样品分子离子化,然后根据不同离子之间的质荷比差异来分离并确定蛋白质的相对分子质量。根据蛋白质酶解后所得到的肽质量指纹图谱、肽序列标签、和肽阶梯序列去检索蛋白质或核酸序列数据库,质谱技术可达到对蛋白质的快速鉴定和高通量筛选。因产生离子的方法不同而发展起来的质谱包括基质辅助激光解吸离子化质谱、电喷雾离子化质谱、表面增强激光解吸离子化质谱等。蛋白质组学包括蛋白与蛋白相互作用等。广州新型修饰蛋白组学技术服务
蛋白质组学技术有电喷雾质谱。PRM定量蛋白质组学一般流程
蛋白质组学,指对某一基因组所表达的所有蛋白质及其特征进行大规模、系统化地研究,以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。研究的内容主要包括:组成蛋白质一级结构氨基酸的序列特征、蛋白质的丰度、蛋白质活性、蛋白质的修饰、亚细胞定位和三维结构、蛋白质之间的相互作用以及对蛋白质的高阶复合物结构。质谱技术的发展为这些研究提供了有力的技术支撑,使得许多有实际应用的蛋白质组功能研究成为可能,包括翻译后修饰的整体分析,蛋白质相互作用网络的重建和模式生物蛋白表达谱的定量研究;在临床医学和转化医学研究中也越来越多地应用到蛋白质组学技术。PRM定量蛋白质组学一般流程
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