代谢组学研究方法：代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似，通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色谱-质谱联用（LC-MS）的方法，比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说，代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱峰，然后了解不同化合物的结构，建立一套完备的识别这些不同化合物特征的分析方法。另一种方法是代谢轮廓分析（metabolomic profiling）,研究人员假定了一条特定的代谢途径，并对此进行更深入的研究。代谢组学作为系统生物学的一个重要的分支，与其他组学相比有着其特有的优势。常规靶向代谢组学领域

代谢组学：代谢组学 （metabolomics）的出现是生命科学研究的必然。是对某一生物或细胞中相对分子量小于1,000的小分子代谢产物进行定性和定量分析的一门新学科。代谢组作为系统生物学的重要组成部分，在临床医学领域具有普遍的应用前景。 代谢产物是基因表达的产物，在代谢酶的作用下生成。虽然与基因或蛋白质相比，代谢产物较小，但是不能形成代谢产物的细胞是死细胞，因此不能小看代谢产物的重要性。 研究人员通过对机体代谢产物的深入研究，可以判断机体是否处于正常状态，而对基因和蛋白质的研究都无法得出这样的结论。事实上，代谢组学研究已经能诊断出一些代谢类疾病，如糖尿病、肥胖症，代谢综合症。目前，已经研究清楚的普通代谢途径包括三羧酸循环（TCA），糖酵解，花生四烯酸 （AA）/炎症途径。杭州个性化定制靶向代谢组学定性分析代谢组学技术可应用于病因病机研究。

如何获得高质量GC/MS代谢组学数据？实验设计先不谈，在仪器分析阶段，若想获得高质量数据，有以下几个方面需要注意。1）前处理方法的一致性。不同实验人员操作方式不尽相同。因此，一个项目应当只由一个人负责前处理。推荐使用自动衍生设备，以减少人为的误差。2）检测之前需确保仪器处于比较好工作状态。仪器的控制软件都有系统自检功能，可以快速便捷地核查质谱仪器的状态。但更重要的是气相色谱状态，推荐使用一组混标作为仪器质控。在每一个项目开始之前，先进行质控样检测，确认气相色谱的分离度和质谱的整体响应。3）后期数据矫正，特别是对于大样本项目。我们可以在检测序列中加入随行质控样本（每个样品取少量后混合），在后期数据处理时，使用质控样本结合如LOESS之类的算法对整体数据进行矫正。

代谢组学需要多少的生物学重复？生物学重复指的是相同处理的相同类型的生物样本的数量（如相同剂量给药后2小时的小鼠采集并且相同储存条件和处理方法血清样本）。相较于基因和蛋白，代谢物处于生命活动的下游，收到环境和遗传背景等因素影响较大，生物学重复少可能会放大组内差异对于整体差异的影响，进而影响结果（如准确和足够多的找出生物标志物）。因此根据不同的生物类型，需要不同的生物学重复来增加数据的可靠性和说服力。代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似。代谢组学是系统生物学的组成部分。

代谢组学什么类型的样本更适合，样本采集需要注意什么？绝大多数可以可靠收集的生物样本都适用于代谢组学研究。常见的样本主要有：临床和动物的血清、血浆、尿液、粪便、各类组织、体液；细胞和微生物、培养液和发酵液；植物的根、茎、叶、花等。代谢每时每刻都在发生变化，我们需要研究的是某个或多个瞬时状态，因此样本采集一般需要保证“快速、一致、简单”的，采集后通过低温淬灭（如液氮淬灭或低温冻存等）的方法阻止离体后的样本的代谢活动。另外，不同的检测要求也需要配合不同的收集方法，具体步骤请参照谱领生物样本收集步骤文件。代谢组学主要研究的是产物的小分子代谢物（MW<1000）。深圳常规靶向代谢组学服务

代谢组学的研究处于生物信息流的中游。常规靶向代谢组学领域

什么是非靶向代谢组学、靶向代谢组学？(1) 非靶向代谢组学（Untargeted metabolomics）即非目标代谢组学或发现代谢组学，无偏向性地对所有小分子代谢物（一般相对分子量小于1000）同时进行检测分析的代谢组学。(2) 靶向代谢组学（Trgeted metabolomics）则为目标性代谢组学，着重对于设定好的目标代谢物进行定性、量检测分析和研究。相比于其他组学，代谢组学有哪些特殊的优势？系统生物学有基因组学、转录组学、蛋白组学和代谢组学。代谢组学作为系统生物学的一个重要的分支，与其他组学相比有着其特有的优势，主要体现在以下几点：(1) 基因与蛋白质表达的微小变化会在相应代谢物水平上得到放大，更容易被检测。(2) 代谢物的种类要远小于基因和蛋白的数目。(3) 可与生物表型变化建立直接相关性。常规靶向代谢组学领域

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