代谢组学概念:代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(MW<1000)。 在食品安全领域,利用代谢组学工具发现农兽药等在动植物体内的相关生物标志物也是一个热点领域。其样品主要是动植物的细胞和组织的提取液。主要技术手段是核磁共振(NMR),质谱(MS),色谱(HPLC,GC),其中以NMR为主。通过检测一系列样品的NMR 谱图,再结合模式识别方法,可以判断出生物体的病理生理状态,并有可能找出与之相关的生物标志物(biomarker)。代谢组学技术得到了迅速发展。湖北常规靶向代谢组学研究内容
GC-MS非靶向代谢组学医学分析生物样本为何要衍生化处理?有哪些衍生化的方法?GC的流动相为气体(通常为高纯氦),这就要求被分析物必须能够气化,而生物样本中很多内源性代谢物都含有极性基团,具有沸点高、不易气化特点。衍生化能够降低这些代谢物的沸点,增加它们的热稳定性,以便分析能够顺利进行。衍生化方法及试剂种类繁多,根据不同的分析目标,需选择合适的衍生化方法。如分析脂肪酸,我们可以采用甲酯化衍生。在GC/MS代谢平台上,比较常用的衍生化方法是硅烷化衍生,因为它的广谱高效。在进行硅烷化衍生之前,还需添加甲氧胺吡啶溶液,以封闭羰基(针对α-酮酸和糖类,保护作用),减少衍生化副产物的生成。广东非靶向代谢组学质谱鉴定代谢组学技术可应用于疾病早期诊断。
代谢组学的研究领域有哪些?1、疾病机制研究。2、疾病诊断与防治。3、新药筛选和开发。4、药物作用机制的研究。5、药物毒性评价。6、植物的细胞代谢组学研究。7、微生物代谢组学研究。代谢组能够检测到的代谢物含量是多少?不同检测平台的灵敏度不一样,灵敏度比较高,可达到fM级。另外,相同含量的不同物质,由于自身化学性质不同,质谱的离子化效率、信号响应强度会差异很大。物质的检测灵敏度跟自身的化学性质有关,化学性质的影响主要表现在离子化效率和质谱碎裂行为两方面。因此,相同含量的不同物质,可能一个能检测出来,另一个检测不出来。
代谢组学的研究分为靶向和非靶向。通俗说就是你有没有目标分子。传统代谢组学研究利用的是GC-MS,因为代谢物大多数都不是高沸点的,而且GC-MS有庞大的数据库检索。然后发展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸点物质难以检测的弊端。NMR用于代谢组学不是很多,一方面是NMR这个东西入行起点有点高,另一方面是样品太复杂而且灵敏度不高。但是NMR样品处理简单,无损。不需要各种衍生化。而且NMR对于物质结构的指认要比MS更精确(比如异构体)因此对定性非常有用,成为非靶向代谢组学的重要方法。代谢组学作为系统生物学的重要组成部分,在临床医学领域具有普遍的应用前景。
代谢组学究竟是一门什么样的研究方向?首先定义什么是代谢组学。简单的说就是研究生物体对内外刺激的整体代谢应答规律。那么为什么代谢组学是基因组,转录组,蛋白质组的下游。我们研究它到底有什么意义。中心法则告诉我们了遗传信息的流向,的执行者蛋白质中很多酶参与了体内的代谢过程。基因测序数量太大,而且基因水平解释问题往往很吃力。因为基因的调控和生物学事件之间隔了一个很漫长的信号转导过程。蛋白同理,一是蛋白种类巨大,二是蛋白组学发展进入瓶颈;发展代谢组是因为代谢物种类只有不到1w种,建立它的差异分析更加简单,同时在价格等方面更有推广的意义。代谢组学在生物信息的传递中起到承上启下的作用。湖北常规靶向代谢组学研究内容
代谢组学的代谢产物是基因表达的产物。湖北常规靶向代谢组学研究内容
代谢组学有哪些应用?近年来,代谢组学技术得到了迅速发展,主要可应用于:功能基因组学、疾病早期诊断、病因病机研究、药物毒理学、中医药现代化、植物代谢组学、微生物代谢组学、营养学、环境科学等生命科学的各个领域。为什么要选择代谢组学?首先需要明确的是代谢组学的目标分析物主要为生物小分子及其代谢产物,如糖、有机酸、脂质、维生素、氨基酸、芳香烃之类等化合物。所以,如果关注的是小分子物质,那么采用代谢组学的方法,可以对样品内检测到的小分子物质进行定性、定量分析。同于基因组学和蛋白组学,代谢组学的研究反映某一时刻下正在发生的生命活动情况,研究代谢物的表达量、代谢物与生理病理变化的关系,能够帮助寻找新的生物标记物,发现新的代谢途径,以及更进一步深入了解目前已知的这些途径,应用于疾病的早期诊断、药物靶点的发现、疾病的病理生理研究。湖北常规靶向代谢组学研究内容
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