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蛋白质乙酰化修饰组学分析研究

来源: 发布时间:2022-01-04

蛋白质翻译后修饰的检测方法:质谱是蛋白质翻译后修饰检测的常用技术之一,可以用于已知和未知的翻译后修饰检测。蛋白质翻译后修饰(post-translational modifications,PTMs),如磷酸化、乙酰化、泛素化、SUMO化、糖基化等,大幅度的增加了蛋白质组的复杂性。检测蛋白质的翻译后修饰,了解它们如何工作、影响蛋白质组和调控基因组将极大地提高我们对遗传学和表观遗传学的理解。目标蛋白的PTMs研究通常需要一个富集步骤,因为修饰蛋白的丰度一般较低。大多数PTMs检测方法都是结合富集策略开发的,以比较好的识别、验证和研究目标蛋白中PTMs的功能。蛋白质的翻译后修饰通过可逆的共价键将小分子或蛋白质与底物蛋白质上特定的氨基酸结合。蛋白质乙酰化修饰组学分析研究

蛋白质学组翻译后修饰自下而上分析策略:常用的糖蛋白分离和富集技术有:a. 凝集素亲和技术;b. 肼化学富集;c. 亲水性相互作用色谱法;d. β-消除/迈克尔加成反应。基于质谱的糖蛋白鉴定和糖基化位点测定方法有:a. PNGase F酶法;b. Endo H酶法;c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化:泛素是一种由76个氨基酸组成的多肽,在真核生物中高度保守,可通过异肽键与目标蛋白赖氨酸残基的氨基进行共价连接。泛素化蛋白的富集主要基于标记,泛素用亲和标签(通常为6xHis)进行标记,并通过镍螯合色谱亲和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端为Arg-Gly-Gly结构,经胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修饰蛋白的肽链上,使肽的质量增加114,因此可作为泛素定位位点的质量标记。用HPLC对样品进行预分离,使用针对特定残留结构的抗体富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的浓度。串联质谱可以鉴定泛素化位点。武汉棕榈酰化修饰蛋白质组学价格乙酰化修饰是体内高度保守的可逆转的蛋白修饰。

翻译后修饰蛋白的检测方法:翻译后修饰蛋白的检测技术包括有免疫沉淀、western blot、质谱技术、体外生化分析等。其中,免疫沉淀是大多数翻译后修饰检测中的关键步骤,它利用蛋白特异性抗体或某种翻译后修饰的特异性抗体来富集目标蛋白,之后再用western blot或质谱技术分析目标蛋白。Western blot和质谱技术均可用于蛋白质翻译后修饰的下游检测,其中Western blot相对简单但依赖于特异性抗体且无法识别单个蛋白质变化,质谱则可以检测包括未知PTM在内的几乎所有的PTMs但成本更高需要专业知识来分析产生的大量数据。研究人员可以根据成本、有无可用抗体,以及有没有目标等选择合适的方法进行检测。

蛋白质磷酸化修饰类型:根据磷酸氨基酸残基的不同,可将磷酸化蛋白质分为4类,即O-磷酸盐蛋白质、N-磷酸盐蛋白质、酰基磷酸盐蛋白质和S-磷酸盐蛋白质。1、O-磷酸盐蛋白质通过羟氨基酸(如丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸)的磷酸化形成。2、 N-磷酸盐蛋白质通过精氨酸、赖氨酸或组氨酸的磷酸化形成。3、 酰基磷酸盐蛋白质通过天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸盐蛋白质通过半胱氨酸磷酸化形成。蛋白质磷酸化修饰鉴定方法:免疫印迹技术是在凝胶电泳和固相免疫测定技术基础上发展起来的、根据特定抗原-抗体的特异性反应来检测复杂样品中的某种蛋白质的免疫生化分析方法。目前对乙酰化修饰的功能研究主要集中在对细胞转录调控,以及对代谢通路的调控这两个方面。

蛋白质翻译后修饰分析策略:早期蛋白质组研究的大部分工作集中在细胞生长的不同时期,或疾病或有丝分裂原刺激后的蛋白质表达水平的变化。然而,许多生命过程不只受蛋白质的相对丰度控制,还受时空分布可逆的翻译后修饰控制。因此,揭示翻译后修饰的规律是了解蛋白质复杂性和多样的生物学功能的前提。蛋白质的翻译后修饰是一个复杂的过程。目前,发现的比较常见的修饰类型是糖基化、泛素化和磷酸化。样品中翻译后修饰蛋白质含量低、动态范围广给相关研究带来了很大的挑战。基于翻译后修饰蛋白的异质性和相对丰度低的特点,主要利用凝胶、生物质谱和生物信息学工具对其进行研究。用于PTM分析的质谱方法类似于用于“常规”蛋白质鉴定的方法,包括自下而上、自中而下和自上而下的蛋白质组学分析。在众多乙酰化修饰的蛋白质中,研究较多的要数细胞核中包围DNA的组蛋白了。济南蛋白质乙酰化修饰组学有哪些

蛋白质磷酸化修饰怎么定义?蛋白质乙酰化修饰组学分析研究

蛋白质泛素化修饰组学技术:泛素化修饰是一种重要的翻译后修饰。泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物体内80%~85%的蛋白质降解。此外,泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位,调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的多种细胞活动。样品要求:1、SDS-PAGE条带:5个以上可见考染条带。2、溶液(目标蛋白质):目标蛋白总量>50μg,目标蛋白浓度>80%。3、溶液(大规模混合蛋白质):蛋白总量>1mg,蛋白浓度>1μg/μl。蛋白质乙酰化修饰组学分析研究

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