RNA-Seq转录组学的应用：RNA-Seq即对转录组进行测序和分析。一般来说在研究所会委托公司测序得到数据自己进行后续的生信分析（质控，mapping，差异基因表达分析，SNV分析等）。RNA-Seq有着巨大的应用前景。在不同背景下比较mRNA水平同一物种，不同组织：研究基因在不同部分的表达情况。同一物种，同一组织：研究基因在不同处理下，不同条件下的表达变化。同一组织，不同物种：研究基因的进化关系。时间序列实验：基因在不同时期的表达情况与发育的关系。基因分类：找到细胞特异，疾病相关，处理相关的基因表达模式，用于诊断疾病和预测等。基因网络和通路：基因在细胞活动中的功能，基因间的相互作用。转录组学测序包括mRNA和非编码RNA。山东外泌体转录组学方法

宏转录学组概念：宏转录组测序是对某一特定时期、特定环境样品中的全部微生物的RNA进行高通量测序，直接获得该环境中所有微生物转录组信息的一种测序技术的新应用。宏转录组中不只包含有微生物的物种信息，还有微生物的基因表达信息。如果说宏基因组能告诉我们微生物群，那么宏转录组则能告诉我们这些微生物，这有助于挖掘微生物功能基因和探索微生物与环境、疾病、动植物等关系的机制。宏转录组分析：从以G为单位的高通量测序数据中获取研究所需的微生物种类、基因、通路等信息是进行宏转录组研究必须经历的一步。现在网络上分析组学数据的工具五花八门。能否从众多组学工具中选择出适合分析宏转录组数据的软件，能否搭建一套完整、快速、高效、灵敏、高精确的宏转录组分析pipline，直接关乎到后期数据分析的进行。广州转录组学应用基于高通量测序平台的转录组学测序技术能够全方面获得物种特定组织的转录本信息。

转录组学即特定细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组学（transcriptomics），是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。简而言之，转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。转录组学（transcriptomics），是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。简而言之，转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。

RNA-Seq，是基于新一代测序技术的转录组学研究方法：首先提取生物样品的全部转录的RNA并进行mRNA富集，然后反转录为cDNA后进行的新一代高通量测序，在此基础上进行片段的拼接组装，从而可得到一个个的转录本，进而可以形成对该生物样品当前发育状态的基因表达状况的全局了解。不同阶段或部位的生物样品的RNA-Seq转录组进行比较分析，则可以在转录层面得到基因表达水平的变化，针对关键基因则可以进行代谢通路（Pathway）的构建。转录组学即特定细胞在某一功能状态下转录出来的所有RNA的总和，包括mRNA和非编码RNA。转录组学测序有什么样的样品要求？

转录组学，基因组学，蛋白质组学的区别：蛋白组学针对的是全体蛋白，组要以2D-Gel和质谱为主，分为top-down和bottom-up分析方法。理念和基因组类似，将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段，在通过质量反推蛋白序列，之后进行搜索，标识已知未知的蛋白序列。转录组学研究的是某个时间点的mRNA总和，可以用芯片，也可以用测序。芯片是用已知的基因探针，测序则有可能发现新的mRNA。基因组学研究的主要是基因组DNA，使用方法目前以二代测序为主，将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。当然这只是第1步，随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作。转录组学测序可以同时测到mRNA、lncRNA、micRNA以及circRNA么？广州转录组学应用

转录组学无需预先设计特异性探针。山东外泌体转录组学方法

全转录组学测序技术优势：文库优化：针对不同长度的序列采用两种文库构建方法，采用去核糖体的链特异性文库可以获得mRNA、lncRNA和circRNA的序列信息。数据全：全转录组测序完成后可获取4类主要RNA（miRNA，mRNA，lncRNA，circRNA）数据，可对这些数据进行标准分析及整合分析。关联全：通过对mRNA/miRNA/lncRNA/circRN序列测定及后续分析，深入开展全转录组调控网络(ceRNA网络)分析。样本类型：细胞，组织，体液、血清、血浆、全血，总RNA等。建议总RNA起始量：＞15μg，浓度≥200ng/μL）。山东外泌体转录组学方法

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