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南京蛋白质糖基化修饰组学领域

来源: 发布时间:2021-12-31

质谱分析蛋白翻译后修饰:相对于蛋白质印迹等技术,质谱技术能更有效的对蛋白质的翻译后修饰进行分析,且可以对常规的Western blot 翻译后修饰蛋白鉴定进行补充。质谱分析蛋白翻译后修饰一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的质谱方法无法保证可以完全识别目的蛋白的特定翻译后修饰,因为质谱是通过蛋白质序列内的多个肽段来鉴定的,这很大程度上降低了翻译后修饰肽段被识别的机会。一种提高质谱仪检测到修饰肽段数量的策略是使用PTM亲和试剂进行肽段富集,而不是使用PTM亲和试剂进行蛋白富集,这将减少富集的未修饰肽段的数量。蛋白质的翻译后修饰调控着底物的酶活性、功能以及三级结构的变化。南京蛋白质糖基化修饰组学领域

蛋白质磷酸化修饰组学:磷酸化蛋白质是由蛋白激酶将ATP或GTP分子上的磷酸基团转移到底物蛋白特定的氨基酸侧链上形成的。蛋白质磷酸化是一种可逆的蛋白质翻译后修饰。在哺乳动物的细胞生命周期中,至少有三分之一的蛋白质发生磷酸化修饰。磷酸化修饰参与许多信号转导途径和细胞代谢过程,且许多已知的疾病也与蛋白质的异常磷酸化有关。因此,对磷酸化蛋白质组进行定量研究,寻找差异表达的磷酸化蛋白质,有助于发现疾病的生物标志物和寻找新的具有诊疗潜力的药物靶标。南京蛋白质糖基化修饰组学领域蛋白质翻译后修饰组学磷酸化修饰具有简单的特性。

蛋白质翻译后修饰:蛋白质的翻译后修饰通过可逆的共价键将小分子或蛋白质与底物蛋白质上特定的氨基酸结合,调控着底物的酶活性、功能以及三级结构的变化。各种蛋白质翻译后修饰在信号通路和网络中发挥着重要的作用,翻译后修饰系统的紊乱将导致一系列疾病的发生。通过实验的方法鉴定蛋白质翻译后修饰的位点需要耗费大量的资金和时间,并且酶反应的优化常常难以实现。而计算的方法则能够快速、准确的预测酶特异性的底物蛋白质及其修饰位点。

蛋白质-蛋白质相互作用是蛋白质发挥功能的主要机制之一,在DNA损伤修复,自噬和代谢等过程中都扮演着非常重要的角色,蛋白相互作用异常便会导致疾病的发生.在蛋白质的赖氨酸,丝氨酸和苏氨酸等氨基酸残基上,可发生甲基化,乙酰化,磷酸化和泛素化等200多种翻译后修饰,这些修饰通常能改变蛋白质的电性,疏水性和空间结构等属性,为与之结合的蛋白提供结合的锚定或产生位阻效应,像一把开关在时空上精确调控蛋白质-蛋白质相互作用的发生以及动态变化.结构研究表明,蛋白质之间的相互作用通常由临近的几个氨基酸残基直接结合,替换该区域的氨基酸残基,通常能破坏结合,使其失去部分功能或酶活性,可以针对性地开发和设计抑制剂,用于疾病的诊疗。蛋白质修饰可检测修饰类型有磷酸化、糖基化、乙酰化、泛素化、丙酰化、丁酰化、丙二酰化。

蛋白质学组翻译后修饰的研究策略:目前,有几种分析蛋白质翻译后修饰的策略,包括质谱(MS)、Eastern blotting、放射性标记和Western blotting。放射性标记和Western blotting是比较传统、特异性和相对定量的方法。该过程需要事先知道翻译后修饰类型。局限性包括抗体的特异性和可用性。质谱技术也常被用于翻译后修饰分析,不受修饰类型和相关修饰位点的现有知识的限制。自下而上:自下而上的技术是蛋白质组学研究中使用的质谱策略之一。在根据序列鉴定肽之前,需要使用蛋白酶消化蛋白质。由于该技术不能保证在检测过程中被检测肽的完整性和稳定性,因此无法获得不同蛋白质翻译后修饰之间关系的信息,这意味着它无法检测到某些修饰。因此,该方法不适用于分析组蛋白的组合翻译后修饰。常见的蛋白质翻译后修饰包括糖基化。深圳丙二酰化修饰蛋白质组学服务

蛋白质的翻译后修饰通过可逆的共价键将小分子或蛋白质与底物蛋白质上特定的氨基酸结合。南京蛋白质糖基化修饰组学领域

乙酰化修饰蛋白质组学分析:乙酰化修饰蛋白质组学分析是指从蛋白质组学的水平分析蛋白质乙酰化修饰,包括乙酰化蛋白质的鉴定和定量。提供基于质谱的乙酰化蛋白组研究服务。蛋白质乙酰化包括组蛋白乙酰化和非组蛋白乙酰化。组蛋白乙酰化主要是赖氨酸乙酰化,已在基因转录调控作用方面被普遍的研究。非组蛋白乙酰化构成了哺乳动物细胞中乙酰化蛋白的主要部分,参与了所有主要生物过程,包括蛋白质的定位、转移、功能和降解,遗传物质的转录和复制等。除了重要的生物学功能以外,乙酰化蛋白质及其调控酶还与衰老和多种疾病(如神经变形紊乱、心血管疾病等)紧密相关。因此,对乙酰化修饰蛋白质组进行研究有助于进一步探索细胞的生命活动与了解相关疾病的发病机制。南京蛋白质糖基化修饰组学领域

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