蛋白质组学在医学的研究应用:蛋白质组学(Proteomics)是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学,包括对蛋白质表达模式和蛋白质组功能模式的研究。蛋白质组学的发展对寻找疾病的诊断标志、筛选药物靶点、毒理学研究等有重要意义,也因此被普遍应用于医学研究。蛋白质组学研究,总体可分为一下几个步骤:(1)差异筛?。―iscovery)(2)初步验证(Verification)(3)然后确诊(Validation)?;谥势椎牡鞍字首檠悄壳氨冉现髁鞯母咄康鞍字恃芯渴侄?,当前在医疗健康方面的应用主要集中于基础研究和转化医学。蛋白质组学在医疗和健康方面有什么应用?山东修饰蛋白组学项目
非标定量法(Label-free)是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度,分析不同来源样品蛋白的数量变化,认为肽段在质谱中被捕获检测的频率与其在混合物中的丰度成正相关,因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度,通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。按照其原理主要分为两种,第1种spectrumcounts类的非标记方法,发展比较早,已经形成多种定量算法,但是主要的原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础,各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。第二种非标记定量的原理是以MS1为基础,计算每个肽段的信号强度在LC-MS上的积分。山东修饰蛋白组学项目定量蛋白质组学是蛋白质组研究的重要内容。
蛋白组究竟研究的是什么呢?第1,蛋白质定性,或者说大规模检测某些蛋白质是否存在于样品当中;第2,蛋白质定量,也就是大规模检测某些蛋白质的含量(包括一定含量与相对含量);第3,蛋白质翻译后修饰,这些修饰主要包括磷酸化,泛素化,糖基化,乙?;鹊?,也包括对这些翻译后修饰的定量研究。这三大块中所提到的大规模,既可以是样品数量的大规模高通量,也可以是少量样本中蛋白数量的大规模高通量。研究原因:首先,由于翻译调控和翻译后调控的存在,RNA的表达量与实际对应蛋白质的含量相关性并不高,就简单地测试了酵母中mRNA和对应蛋白质的定量相关性,结果是,低丰度蛋白与mRNA的相关性尤其低,而高丰度蛋白和其mRNA的相关性则高,经过平均后r值只为0.4。
蛋白质组学技术:等电聚焦:等电聚焦(isoelectricfocusing,IEF)是一种利用有pH梯度的介质分离等电点不同的蛋白质的电泳技术。等电聚焦凝胶电泳依据蛋白质分子的静电荷或等电点进行分离,等电聚焦中,蛋白质分子在含有载体两性电解质形成的一个连续而稳定的线性pH梯度中电泳。载体两性电解质是脂肪族多氨基多羧酸,在电场中形成正极为酸性,负极为碱性的连续的pH梯度。蛋白质分子在偏离其等电点的pH条件下带有电荷,因此可以在电场中移动;当蛋白质迁移至其等电点位置时,其静电荷数为零,在电场中不再移动,据此将蛋白质分离。蛋白质组学包括蛋白与蛋白相互作用等。
我国科学家已经在重大疾病如肝病、维甲酸诱导白血病细胞凋亡启动模型及维甲酸定向诱导胚胎干细胞向神经系统分化的模型等比较蛋白质组研究以及一些重要生理和病理体系的蛋白质组成分研究方面获得了重要成就。蛋白质组学的重要应用领域有:在临床疾病中的应用、在微生物蛋白质组学中的应用、在植物研究中的应用、在肾脏病学领域的应用。我们通过研究蛋白质组,可以为患者提供有用的疾病诊断、诊疗、预后评估信息;可以早期更为准确的诊断出胰腺??;也可以为AD的诊断、诊疗药物的设计和筛选奠定基础。这项研究技术其实离我们生活非常近,对我们生命而言尤为重要。近年来,高通量蛋白质分离与鉴定技术,如双向电泳、生物质谱、蛋白质芯片、酵母双杂交系统、生物信息学等相继建立并日趋完善,加速了蛋白质组学的发展。蛋白质组学相关技术目前在一小部分]应用中具有独特优势。上海新型修饰蛋白组学应用
蛋白质组学包括蛋白质的表达水平。山东修饰蛋白组学项目
蛋白质组学在医疗和健康方面有什么应用?具体而言,蛋白质组学在此类应用中,更多地用于提供高通量蛋白质定性定量信息。作为检测手段的蛋白质组学:事实上,在当前的生物医学研究和临床诊断中,蛋白质组学相关技术有非常多的应用。因为蛋白质组学技术的本质(从分析化学角度来看),就是对蛋白质的定性定量分析。生物医学和临床诊断中,需要大量表征一种或多种蛋白质的含量、氨基酸序列、翻译后修饰等信息。蛋白质组学相关技术目前在一小部分]应用中具有独特优势。有很多蛋白质组学的研究者在工业界和医院进行相关研究和日常工作。很容易发现,当前蛋白质组学的临床应用更多地集中在第二类。第1类的应用更接近于生物医学基础研究,目前还没有和大部分人的现实生活产生关系。山东修饰蛋白组学项目
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