蛋白质乙酰化修饰组学定量分析：1. SILAC细胞标记，组织/细胞破碎，提取、提纯目的蛋白质（基于SILAC的乙酰化修饰组学定量）。2. 使用胰蛋白酶将目的蛋白酶解成多肽片段。3. 对多肽片段进行iTRAQ标记（基于iTRAQ的乙酰化修饰组学定量）。4. 使用高效特异性乙酰化抗体对乙酰化修饰肽段进行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS对富集的乙酰化肽段进行序列分析。6. 数据分析，比对不同样本中蛋白乙酰化修饰水平差异，并对产生变化的生物学意义进行解释。蛋白质磷酸化修饰的免疫印迹技术优点：能够特异鉴定单个磷酸化位点。广东甲基化修饰蛋白质组学

蛋白质翻译后修饰的检测方法：质谱是蛋白质翻译后修饰检测的常用技术之一，可以用于已知和未知的翻译后修饰检测。蛋白质翻译后修饰（post-translational modifications，PTMs），如磷酸化、乙酰化、泛素化、SUMO化、糖基化等，大幅度的增加了蛋白质组的复杂性。检测蛋白质的翻译后修饰，了解它们如何工作、影响蛋白质组和调控基因组将极大地提高我们对遗传学和表观遗传学的理解。目标蛋白的PTMs研究通常需要一个富集步骤，因为修饰蛋白的丰度一般较低。大多数PTMs检测方法都是结合富集策略开发的，以比较好的识别、验证和研究目标蛋白中PTMs的功能。广州亚硝基化修饰蛋白质组学领域蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的活性。

蛋白翻译后修饰组学技术在准确医学中的应用：尽管目前大数据的获得会采用基因组学和转录组学，但是关键的发现还是依赖蛋白质组数据而得到的。近来越来越多的研究表明蛋白组学驱动的准确的医学具有极大的实用性和普适性，蛋白组学的研究更加速了临床转化的进程。蛋白翻译后修饰（post-ranslational modification, PTM)赋予了蛋白种类的丰富性及蛋白功能的多样化，研究蛋白翻译后修饰不只可以确定蛋白修饰（磷酸化、泛素化、酰化、甲基化、SUMO化等）或蛋白酶裂解的新位点，还可以发现生物标记物及探索药物/化学调节物的作用机制。

蛋白质磷酸化修饰组学技术优点：1、全方面性：磷酸化蛋白质组学以整个细胞蛋白为研究对象，研究内容包括了细胞内具有生命功能的蛋白，如细胞增生、细胞分裂和细胞分化等相关蛋白，因而研究更为全方面。2、可靠性：传统的生物学研究蛋白质磷酸化往往针对特定条件，以两个蛋白或更多蛋白之间的相互作用为出发点，具有局限性，缺乏整体认识。磷酸化蛋白质组学则可检测不同蛋白激酶及磷酸化酶对同一个蛋白磷酸化程度的影响，因而结果具有普遍性和可靠性。3、有效性：磷酸化蛋白质组学反映的是细胞内真实发生的事件，在一次试验中考虑了不同变量，克服了生物学中逐步添加变量的缺陷。4、探索性：磷酸化蛋白质组学以细胞内蛋白为研究对象，相对于传统的生物学研究以及蛋白质芯片，更易发现未知的新磷酸化位点和磷酸化蛋白质。如果可以联合生物学技术，则可以发现具有磷酸化或者去磷酸化功能的酶。在蛋白翻译后修饰方式的鉴定过程中，蛋白会首先被酶切成肽段，然后进入质谱进行分析。

翻译后修饰蛋白组学分析：在蛋白翻译后修饰方式的鉴定过程中，蛋白会首先被酶切成肽段，然后进入质谱进行分析。通过质谱分析，得到的是一系列肽段的分子质量信息。对于某一个特定肽段而言，在没有发生任何翻译后修饰的情况下，其序列信息和分子量是确定的。当它发生了某种翻译后修饰之后，例如磷酸化修饰，由于序列信息和分子量是确定的，磷酸根的分子量也是确定的。在质谱检测过程中发现其中的部分肽段的分子量刚好增加了一个磷酸根的分子量，假设这个肽段就发生了磷酸化修饰，再通过二级质谱图进行二次确认。蛋白质糖基化是一种常见的蛋白质翻译后修饰。广州亚硝基化修饰蛋白质组学领域

蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的定位。广东甲基化修饰蛋白质组学

蛋白质泛素化修饰组学技术：泛素化修饰是一种重要的翻译后修饰。泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物体内80%~85%的蛋白质降解。此外，泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位，调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的多种细胞活动。样品要求：1、SDS-PAGE条带：5个以上可见考染条带。2、溶液（目标蛋白质）：目标蛋白总量>50μg，目标蛋白浓度>80%。3、溶液（大规模混合蛋白质）：蛋白总量>1mg，蛋白浓度>1μg/μl。广东甲基化修饰蛋白质组学

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