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北京蛋白质翻译后修饰组学分析研究

来源: 发布时间:2021-12-29

蛋白质学组翻译后修饰的类型:翻译后修饰的类型包括N端fMet或Met的去除、二硫键的形成、化学修饰和肽键的裂解,其中磷酸化是比较常见的。蛋白质的化学修饰反应是在维持蛋白质的完整性和功能性的基础上,通过基于其氨基酸残基的化学反应获得新的生物结合物。翻译后修饰在哪里发生?翻译后修饰主要发生在氨基酸侧链或蛋白质的C端或N端。现有的官能团或新官能团的引入可被用于修饰蛋白质,以扩展20个标准氨基酸的化学组成。翻译后修饰的位点通常带有可以在化学反应中充当亲核试剂的官能团,如丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的羟基;赖氨酸、精氨酸和组氨酸胺形式;同时,在蛋白质的N端和C端,天冬酰胺也可作为翻译后修饰中的一种聚糖连接点。翻译后修饰也发生在氧化的蛋氨酸和侧链位点的一些亚甲基上。蛋白质的翻译后修饰通过可逆的共价键将小分子或蛋白质与底物蛋白质上特定的氨基酸结合。北京蛋白质翻译后修饰组学分析研究

蛋白质学组翻译后修饰自下而上分析策略:常用的糖蛋白分离和富集技术有:a. 凝集素亲和技术;b. 肼化学富集;c. 亲水性相互作用色谱法;d. β-消除/迈克尔加成反应?;谥势椎奶堑鞍准ê吞腔坏悴舛ǚ椒ㄓ校篴. PNGase F酶法;b. Endo H酶法;c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化:泛素是一种由76个氨基酸组成的多肽,在真核生物中高度保守,可通过异肽键与目标蛋白赖氨酸残基的氨基进行共价连接。泛素化蛋白的富集主要基于标记,泛素用亲和标签(通常为6xHis)进行标记,并通过镍螯合色谱亲和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端为Arg-Gly-Gly结构,经胰蛋白酶水解后,Gly-Gly保留在修饰蛋白的肽链上,使肽的质量增加114,因此可作为泛素定位位点的质量标记。用HPLC对样品进行预分离,使用针对特定残留结构的抗体富集泛素化肽,可很大程度上提高泛素化蛋白的浓度。串联质谱可以鉴定泛素化位点。南京丙酰化修饰蛋白质组学费用蛋白质有哪些翻译后修饰?

蛋白质翻译后修饰有什么生物学意义?可以使蛋白质具有生物活性,可以发挥相应的功能。翻译是蛋白质生物合成(基因表达中的一部分,基因表达还包括转录)过程中的第二步(转录为第1步),翻译是根据遗传密码的中心法则,将成熟的信使RNA分子(由DNA通过转录而生成)中“碱基的排列顺序”(核苷酸序列)解码,并生成对应的特定氨基酸序列的过程。但也有许多转录生成的RNA,如转运RNA(tRNA)、核糖体RNA(rRNA)和小核RNA(snRNA)等并不被翻译为氨基酸序列。

蛋白质乙?;奘味ㄒ澹旱鞍字试谙赴芯牒?,到被运输到相应的细胞器并且发生特定的生物学作用前会经过很重要的一步加工,那就是蛋白质翻译后修饰加工。蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的活性、定位或功能。通过蛋白质翻译后修饰也进一步增加了细胞通路机制和生命活动的多样性和复杂性。常见的蛋白质翻译后修饰包括磷酸化,乙?;?,糖基化,泛素化等。蛋白质乙?;奘?,顾名思义指的就是在蛋白质原有基础上面嫁接上乙?;?。在细胞中,乙酰化修饰的反应由乙?;泼杆呋?,将乙酰辅酶A的乙酰基转移并添加在蛋白质赖氨酸残基上。在早期的研究中,乙?;奘我恢北蝗衔钦婧讼赴赜械囊恢址牒笮奘?,直到后来研究发现原核细胞中年也存在着蛋白质乙?;奘巍K?,乙?;奘问窃撕驼婧松锼灿械囊恢址牒笮奘卫嘈?。乙酰化修饰是体内高度保守的可逆转的蛋白修饰。

蛋白质翻译后修饰组学:蛋白质翻译后修饰(Post-translational modification, PTM)是指对翻译后的蛋白质进行共价加工的过程。它通过在一个或多个氨基酸残基加上修饰基团,可以改变蛋白质的物理、化学性质,进而影响蛋白质的空间构象和活性状态、亚细胞定位、折叠及其稳定性以及蛋白质-蛋白质相互作用。蛋白质翻译后修饰的丰度变化在生命活动研究中具有重大意义,异常的翻译后修饰会导致多种疾病的发生。质谱可以分辨蛋白质修饰前和修饰后分子量上的变化,因此只要知道靶蛋白翻译后修饰前后分子量的变化,就能对翻译后修饰方式进行鉴定和定量。蛋白质磷酸化修饰的免疫印迹技术优点:能够特异鉴定单个磷酸化位点。武汉泛素化修饰蛋白质组学服务

自中而下的蛋白质组学技术可用于组蛋白修饰的分析。北京蛋白质翻译后修饰组学分析研究

蛋白质乙?;奘巫檠Ф糠治觯?. SILAC细胞标记,组织/细胞破碎,提取、提纯目的蛋白质(基于SILAC的乙?;奘巫檠Ф浚?. 使用胰蛋白酶将目的蛋白酶解成多肽片段。3. 对多肽片段进行iTRAQ标记(基于iTRAQ的乙?;奘巫檠Ф浚?. 使用高效特异性乙?;固宥砸阴;奘坞亩谓忻庖吒患?。5. 使用LC-MS/MS对富集的乙?;亩谓行蛄蟹治?。6. 数据分析,比对不同样本中蛋白乙?;奘嗡讲钜?,并对产生变化的生物学意义进行解释。北京蛋白质翻译后修饰组学分析研究

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