蛋白质学组翻译后修饰的研究策略:目前,有几种分析蛋白质翻译后修饰的策略,包括质谱(MS)、Eastern blotting、放射性标记和Western blotting。放射性标记和Western blotting是比较传统、特异性和相对定量的方法。该过程需要事先知道翻译后修饰类型。局限性包括抗体的特异性和可用性。质谱技术也常被用于翻译后修饰分析,不受修饰类型和相关修饰位点的现有知识的限制。自下而上:自下而上的技术是蛋白质组学研究中使用的质谱策略之一。在根据序列鉴定肽之前,需要使用蛋白酶消化蛋白质。由于该技术不能保证在检测过程中被检测肽的完整性和稳定性,因此无法获得不同蛋白质翻译后修饰之间关系的信息,这意味着它无法检测到某些修饰。因此,该方法不适用于分析组蛋白的组合翻译后修饰。蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的定位。北京棕榈酰化修饰蛋白质组学质谱分析
什么是蛋白质的翻译后修饰?蛋白质的翻译后修饰()是指蛋白质在翻译后的化学修饰。对于大部分的蛋白质来说,这是蛋白质生物合成的较后步骤。PTM是细胞信号传导中的重要组成部分。通过向修饰基团添加一个或多个氨基酸残基或通过蛋白质水解切割该基团来改变蛋白质的性质,是蛋白质生物学功能表达的重要步骤。生物蛋白质的翻译后修饰极大地增加了蛋白质结构的类型和功能。这个过程调节细胞周期和蛋白质转录,并影响表观遗传学。四川蛋白质糖基化修饰组学研究常见的蛋白质翻译后修饰包括糖基化。
蛋白翻译后修饰检测:由于PTMs在基础生物学以及疾病发病机理中的重要性,因此非常需要对蛋白质的翻译后修饰进行检测。对蛋白翻译后修饰进行研究时通常需要富集步骤,因为这些翻译后修饰的蛋白质相对含量较低。大多数PTMs的检测方法与富集策略结合在一起开发,以提供比较好的机会来识别、验证和研究蛋白翻译后修饰的功能。但是,在检测已有特异性翻译后修饰抗体的修饰蛋白质时,可能不需要富集步骤。质谱技术,通过测定肽段的分子量可以对该肽段的翻译后修饰情况进行检测,并可以对翻译后修饰蛋白进行定性和定量分析。
蛋白质磷酸化修饰类型:根据磷酸氨基酸残基的不同,可将磷酸化蛋白质分为4类,即O-磷酸盐蛋白质、N-磷酸盐蛋白质、酰基磷酸盐蛋白质和S-磷酸盐蛋白质。1、O-磷酸盐蛋白质通过羟氨基酸(如丝氨酸、苏氨酸或酪氨酸)的磷酸化形成。2、 N-磷酸盐蛋白质通过精氨酸、赖氨酸或组氨酸的磷酸化形成。3、 酰基磷酸盐蛋白质通过天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸盐蛋白质通过半胱氨酸磷酸化形成。蛋白质磷酸化修饰鉴定方法:免疫印迹技术是在凝胶电泳和固相免疫测定技术基础上发展起来的、根据特定抗原-抗体的特异性反应来检测复杂样品中的某种蛋白质的免疫生化分析方法。蛋白质翻译后修饰的作用主要是改变蛋白质的活性。
蛋白质磷酸化修饰鉴定方法: Mn2+-Phos-tag SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳:Mn2+-Phos-tag SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳通过连接在丙烯酰胺分子上的双核金属(如Mn2+)配合物对磷酸基团的亲和,造成磷酸化蛋白迁移的滞留,再将电泳结果转移到PVDF膜上,用相应蛋白的抗体识别,根据迁移滞留检测蛋白磷酸化。技术优势特点:1、无放射危害。2、鉴定不受限于特异性识别蛋白质磷酸化的抗体。3、适用于大规模磷酸化蛋白分析。4、与质谱鉴定兼容,进行更为精细的分析鉴定。蛋白质的翻译后修饰通过可逆的共价键将小分子或蛋白质与底物蛋白质上特定的氨基酸结合。贵州氧化修饰蛋白质组学主要方式
在众多乙酰化修饰的蛋白质中,研究较多的要数细胞核中包围DNA的组蛋白了。北京棕榈酰化修饰蛋白质组学质谱分析
蛋白质乙酰化修饰组学定量分析:1. SILAC细胞标记,组织/细胞破碎,提取、提纯目的蛋白质(基于SILAC的乙酰化修饰组学定量)。2. 使用胰蛋白酶将目的蛋白酶解成多肽片段。3. 对多肽片段进行iTRAQ标记(基于iTRAQ的乙酰化修饰组学定量)。4. 使用高效特异性乙酰化抗体对乙酰化修饰肽段进行免疫富集。5. 使用LC-MS/MS对富集的乙酰化肽段进行序列分析。6. 数据分析,比对不同样本中蛋白乙酰化修饰水平差异,并对产生变化的生物学意义进行解释。北京棕榈酰化修饰蛋白质组学质谱分析
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