我们究竟怎么研究蛋白质组学呢？抗体免疫的方法呢，其实就是ELISA，Western及蛋白质芯片。通过合成大量蛋白质特异的抗体，能够进行定性检测及相对定量分析，只要你有好用的抗体，那么就可以通过免疫反应让抗体快速的识别你感兴趣的蛋白质，然后用例如HRP发光等标记方法显示它们是否存在于你的样品当中。现在已有的抗体不只能识别特定蛋白质，还能识别特定修饰的特定蛋白质或者被特定修饰过的特定蛋白质Motif。蛋白质组与基因组相对应，也是一个整体的概念。蛋白质组学技术有生物质谱。深圳Label free多肽组学方法
LabelFree(非标记蛋白质组学技术)：应用：1.需要快速在大量样本中找到差异表达的蛋白组合。2.需要在较短时间以较低成本得到具有提示意义的蛋白表达数据。3.需要检测的样品蛋白含量低。4.需要检测相互作用蛋白。技术特点：1.对质谱仪器设备要求较高，色谱和质谱需要同时有较好的稳定性和重复性。2.需要有特殊的定量分析软件。3.对样品中蛋白质总量要求较低，实验周期短，实验费用低。4.不需要额外并且昂贵的标记试剂，排除了标记过程带入实验误差的风险，同时也不必考虑标记效率的问题。四川TMT／iTRAQ标记定量蛋白质组学主要技术蛋白质组随着基因组学研究的不断深入，蛋白质组学已逐渐成为研究热点。
蛋白质组学发展趋势：技术发展方面：蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存，各有优势和的特点，而难以象基因组研究一样形成比较一致的方法。除了发展新方法外，更强调各种方法间的整合和互补，以适应不同蛋白质的不同特征。另外，蛋白质组学与其它学科的交叉也将日益明显和重要，这种交叉是新技术新方法的活水之源，特别是，蛋白质组学与其它大规模科学如基因组学，生物信息学等领域的交叉，构成组学（omics）生物技术研究方法，所呈现出的系统生物学（SystemBiology）研究模式，将成为未来生命科学比较令人激动的新前沿。
定量蛋白质组学技术：定量蛋白质组学是蛋白质组研究的重要内容，通过对基因表达产物——蛋白质的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境条件下的表达情况。近年来，随着非凝胶技术的发展，蛋白质组学（“Shotgun”proteomics）技术，特别是多维蛋白质鉴定（MultidimensionalProteinIdentification，MudPIT）已成为研究复杂生物样本中大规模蛋白质表达和定性和定量分析的强有力工具。蛋白质组学在医学的研究应用：蛋白质组学是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学。目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。
蛋白质组学概念：蛋白质组学（英语：proteomics，又译作蛋白质体学），是以蛋白质组为研究对象，研究细胞、组织或生物体蛋白质组成及其变化规律的科学。蛋白质组（Proteome）一词，源于蛋白质（protein）与基因组（genome）两个词的组合，意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”，即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平，翻译后的修饰，蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生，细胞代谢等过程的整体而全方面的认识。生物质谱技术是蛋白质组学研究中比较重要的鉴定技术。南京定量N糖基化蛋白质组学检测价格
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蛋白质组学：质谱分析蛋白质组学的基本原理主要是通过测定被测样品离子的理化性质来进行分析，根据样品的质量谱图和相关信息从而得到定性和定量结果。目前，蛋白质组学质谱分析一般是根据保留时间（retentiontime）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity）这三个维度对肽蛋白质进行鉴定和定量，即3D蛋白质组学。4D蛋白质组学在3D蛋白质组学的基础之上增加了第四维度，离子淌度（mobility），主要根据离子的形状和截面对离子进行分离，能够区分m/z差值非常小的肽段，使低丰度蛋白信号能够被区分和识别出来。4D蛋白质组学基于timsTOFPro质谱仪，结合PASEF（ParallelAccumulationSerialFragmentation，同步累积连续碎裂）与TIMS（TrappedIonMobilitySpectrometry，离子迁移谱），可重复测量所有检测离子的碰撞截面（CCS），能更快、更灵敏的进行蛋白质组定性和定量。深圳Label free多肽组学方法
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