代谢组学什么类型的样本更适合,样本采集需要注意什么?绝大多数可以可靠收集的生物样本都适用于代谢组学研究。常见的样本主要有:临床和动物的血清、血浆、尿液、粪便、各类组织、体液;细胞和微生物、培养液和发酵液;植物的根、茎、叶、花等。代谢每时每刻都在发生变化,我们需要研究的是某个或多个瞬时状态,因此样本采集一般需要保证“快速、一致、简单”的,采集后通过低温淬灭(如液氮淬灭或低温冻存等)的方法阻止离体后的样本的代谢活动。另外,不同的检测要求也需要配合不同的收集方法,具体步骤请参照谱领生物样本收集步骤文件。代谢组学作为系统生物学的一个重要的分支,与其他组学相比有着其特有的优势。广东个性化定制靶向代谢组学质谱分析
代谢组学样品收集方法及所需样本量是什么?根据不同的检测要求,需要配合不同的样本量和样本采集方法,常规的方法和单个样本量如下:(1) 微生物和细胞样本:细胞迅速猝灭细胞并冷冻保存;单个样本细胞数量要求10^6。(2) 动物体液(如尿、血、组织、唾液):采样后要迅速预处理,如加入抗凝血剂、防腐剂,并立即冷冻处理(-80 ℃);单个样本要求体积为10μL。(3) 植物样本:采集后迅速冷冻(液氮),然后转入-80℃保存,单个样本要求质量为50mg。杭州代谢组学定性分析代谢组学主要研究的是作为各种代谢路径的底物和产物的小分子代谢物(分子量<1000)。
代谢组学发展前景:代谢组学是继基因组学、蛋白质组学、转录组学后出现的新兴“组学”,每年发表的代谢组学研究的文章数量都在不断增加。代谢组学的发展很迅速,尽管还没有经典论文出现,但是研究人员相信,与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学将在临床上发挥更大的作用。许多公司通过市场研究发现,健康人并不希望进行基因型分析,所以,对于这些人群来说,基因组学研究在临床上的应用很有限。而代谢组学与临床化学较为相似,且相对于基因组学来说,提供的个人信息更少,故其在临床上的应用有可能产生一定的影响。
代谢组学的研究分为靶向和非靶向。通俗说就是你有没有目标分子。传统代谢组学研究利用的是GC-MS,因为代谢物大多数都不是高沸点的,而且GC-MS有庞大的数据库检索。然后发展的LC-MS差不多,就是克服了一些高沸点物质难以检测的弊端。NMR用于代谢组学不是很多,一方面是NMR这个东西入行起点有点高,另一方面是样品太复杂而且灵敏度不高。但是NMR样品处理简单,无损。不需要各种衍生化。而且NMR对于物质结构的指认要比MS更精确(比如异构体)因此对定性非常有用,成为非靶向代谢组学的重要方法。代谢组学 (metabolomics)的出现是生命科学研究的必然。
代谢组学如何控制临床样本的质量?对于临床的样本建议每组比较低的25个生物学重复,达到30例以上比较好。因为临床样本受外界环境和遗传背景影响较大,需要很多生物学重复来消除这些外在影响。此外,在样本收集过程中,应保持收养的时间段和操作程序尽可能一致。代谢组学样本收集取样基本原则:表示性和一致性:验组与对照组样本在取材部位、时间处理等方面尽可能保持一致,从而保证实验的可信度;迅速性:操作过程迅速,很大限度缩短样本采集到实验的时间;低温原则:所有样本离体后,分离步骤应在4℃或冰上进行,分离好的样本立即存于-80℃,以免样本产生进一步代谢活动。代谢组学着重研究的是生物整体、组织代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。广东个性化定制靶向代谢组学质谱分析
代谢组学技术得到了迅速发展。广东个性化定制靶向代谢组学质谱分析
代谢组学发展前景:较低的费用,是促使代谢组学在临床上易于接受的另一个原因。与其他“组学”研究相比,代谢组学的费用更低,研究人员可以通过代谢组学研究筛检出代谢产物,然后采用更昂贵的基因组学和蛋白质组学的方法对有意义的代谢产物进一步加以研究。首先,必须识别出代谢产物,这并不是简单的工作。代谢组学研究比较大的挑战就在于对代谢产物的识别,这也是比较有趣的方面,而更具挑战性的工作,是进一步确认所有代谢物的功能。此外,质谱分析发现,代谢产物的同质性不高,由于缺乏均匀性,使色谱分析变得更加困难,无法识别出样品中的未知物质。广东个性化定制靶向代谢组学质谱分析
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