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浙江PRM定量蛋白质组学主要技术

来源: 发布时间:2022-05-28

蛋白质组学植物篇样品寄样要求:植物相较于动物,蛋白占比不高,所以送样在量上面的要求会多一些,推荐送500mg以上的量可以确保实验能够提取到充足的蛋白。如果是种仁、豆类等蛋白含量比较高的,200mg足以完成抽提。处理样本需要用PBS将样本表面的泥土等杂质冲洗干净,去除掉多余的组织。尽量能够保证样本的形态和纯度,不推荐用锡纸包裹,放在EP管中使其形态完整为比较好。用液氮急速冷冻5min后置于-80℃环境中保存,送样时需要添加干冰。蛋白质组学技术在农业生物科研领域的应用为作物生长发育、病虫害防治、遗传育种、等方面发挥重要的作用。浙江PRM定量蛋白质组学主要技术

蛋白质组学介绍:蛋白质组学,指对某一基因组所表达的所有蛋白质及其特征进行大规模、系统化地研究,以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。研究的内容主要包括:组成蛋白质一级结构氨基酸的序列特征、蛋白质的丰度、蛋白质活性、蛋白质的修饰、亚细胞定位和三维结构、蛋白质之间的相互作用以及对蛋白质的高阶复合物结构。蛋白质组主要通过蛋白质双向电泳、氨基酸序列测定、质谱、生物信息等方法,研究某个基因组对应的所有蛋白质特征,包括蛋白质含量、亚细胞定位、活性以及蛋白修饰等内容。广东外泌体蛋白质组学检测价格蛋白质组研究有助于了解蛋白的结构、细胞的功能、生命的本质及活动规律。

常用的定量蛋白质组学技术方法有以下几类:非标记(labelfree)的定量蛋白组学技术:Label free定量蛋白组学技术是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。TMT定量蛋白组学技术:这种技术采用多个(2-10)稳定同位素标签,特异性标记多肽的氨基基团进行串联质谱分析,能够同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量,可用于研究不同病理条件下或者不同发育阶段的组织样品中蛋白质表达水平的差异。

蛋白质组学与基因组学的差异:蛋白质组和基因组(genome)在概念上有相关性,某一个蛋白质组的蛋白质是由其基因组所编码的,然而蛋白质组学和基因组学在研究对象和研究方法上有很大的区别?;蜃樵谒械南赴屑负醵际峭暾?,与之不同,蛋白质组具有很高的细胞和组织特异性,不同的细胞组织表达不同的蛋白质组。蛋白质组的复杂性也远远高于基因组,这是因为一个基因≠一个转录产物≠一个蛋白质。比如据估计人的基因组由30000个基因组成,经mRNA剪切和蛋白质翻译后修饰将产生20万~200万个蛋白质。由于不同的转录起始和mRNA剪切使同一基因产生了不同的转录产物。同样由于不同的翻译起始,一个mRNA可以翻译成不同的蛋白质。蛋白质组学的分析主要指蛋白的生信分析,依赖于数据库的建立。

蛋白质组学定义:蛋白质组学(proteomics),指对某一基因组所表达的所有蛋白质及其特征进行大规模、系统化地研究,以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。研究的内容主要包括:组成蛋白质一级结构氨基酸的序列特征、蛋白质的丰度、蛋白质活性、蛋白质的修饰、亚细胞定位和三维结构、蛋白质之间的相互作用以及对蛋白质的高阶复合物结构。蛋白质组学的研究方法主要有:蛋白质双向电泳、氨基酸序列测定(包括N端测序和C端测序)、质谱、生物信息学。iTRAQ定量是目前定量蛋白质组学应用比较普遍的技术。广州新型修饰蛋白组学服务

蛋白质组研究是对基因组研究的重要补充。浙江PRM定量蛋白质组学主要技术

蛋白质组学技术发展方面:蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存,各有优势和局限的特点,而难以象基因组研究一样形成比较一致的方法。除了发展新方法外,更强调各种方法间的整合和互补,以适应不同蛋白质的不同特征。另外,蛋白质组学与其它学科的交叉也将日益明显和重要,这种交叉是新技术新方法的活水之源,特别是,蛋白质组学与其它大规模科学如基因组学,生物信息学等领域的交叉,构成组学(omics)生物技术研究方法,所呈现出的系统生物学(System Biology)研究模式,将成为未来生命科学比较令人激动的新前沿。浙江PRM定量蛋白质组学主要技术

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