蛋白质组学研究应用：近年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域，覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围，涉及到各种重要的生物学现象，如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等。生物信息学的发展已给蛋白质组研究提供了更方便、有效的计算机分析软件，随着基因组学的迅速推进，会给蛋白质组研究提供更多更全的数据库。另外，蛋白质组学与其它学科的交叉也将推动新技术、新方法的发展。特别是蛋白质组学与其它大规?？蒲缁蜃檠?，生物信息学领域的交叉，所呈现出的系统生物学研究模式，将成为未来的生命科学新前沿。蛋白质组学技术的发展已经成为现代的生物技术快速发展的重要支撑。北京Label free非标记定量蛋白质组学方法

蛋白质组学研究内容：1.蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合相关技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。2.翻译后修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式，因此对蛋白质翻译后修饰的研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。3.蛋白质功能确定：如分析酶活性和确定酶底物，细胞因子的生物分析/配基-受体结合分析?？梢岳没蚯贸头匆寮际醴治龌虮泶锊?蛋白质的功能。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研究也在一定程度上有助于蛋白质功能的了解。有的荧光蛋白表达系统就是研究蛋白质在细胞内定位的一个很好的工具。山东外泌体蛋白质组学领域近年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域。

蛋白质组学的重要应用领域有：在临床疾病中的应用、在微生物蛋白质组学中的应用、在植物研究中的应用、在肾脏病学领域的应用。我们通过研究蛋白质组，可以为患者提供有用的疾病诊断、预后评估信息；可以早期更为准确的诊断出胰腺??；也可以为AD的诊断、治理药物的设计和筛选奠定基础。这项研究技术其实离我们生活非常近，对我们生命而言尤为重要。近年来，高通量蛋白质分离与鉴定技术，如双向电泳、生物质谱、蛋白质芯片、酵母双杂交系统、生物信息学等相继建立并日趋完善，加速了蛋白质组学的发展。

蛋白质组学研究策略：蛋白质组学研究主要分为自底向上（Bottom-Up），自顶向下（Top-Down）和自中向下（Middle-Down）三种策略?！白缘紫蛏稀辈呗允侵竿ü治鲇傻鞍字拭附馍傻碾亩卫醇ǖ鞍字?。当应用该策略来分析蛋白质组混合物时，因其类似于基因组测序的鸟管法，所以又被称为鸟管法蛋白质组学（Shotgun Proteomics），该策略依赖于蛋白酶的酶切?！白灾邢蛳隆辈呗砸惨览涤诘鞍酌傅拿盖?，但是由于采用了另外的酶，比如OmpT，只能酶切(Lys/Arg-Lys/Arg)，因此酶切之后的分子量较大，更利于后续的蛋白组装环节。蛋白质组研究技术涉及到各种重要的生物学现象，如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等。

PRM靶向定量蛋白质组学实验原理：PRM技术是一种根据已知实测信息或质谱检测规律的假定信息对样品中的蛋白质进行靶向定量的技术。该技术主要应用仪器为Q Exactive系列质谱仪，首先以四极杆作为质量过滤器，特异性地选择与预先设定质荷比相同的肽段离子（母离子）通过，随后在高能碰撞池中碎裂母离子，之后通过Orbitrap分析碎片离子（子离子）得到肽段的二级质谱信息。四极杆的高选择性离子过滤与Orbitrap高分辨率测量技术的结合使得PRM技术有很高的特异性，并且有效的降低了背景噪音，去除了干扰离子，提高了灵敏度。在对早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治理方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景。江苏定量乙?；鞍字首檠П?/p>

蛋白质组研究为疾病的诊断、疫苗及新药开发提供科学依据。北京Label free非标记定量蛋白质组学方法

蛋白质组学植物篇样品寄样要求：植物相较于动物，蛋白占比不高，所以送样在量上面的要求会多一些，推荐送500mg以上的量可以确保实验能够提取到充足的蛋白。如果是种仁、豆类等蛋白含量比较高的，200mg足以完成抽提。处理样本需要用PBS将样本表面的泥土等杂质冲洗干净，去除掉多余的组织。尽量能够保证样本的形态和纯度，不推荐用锡纸包裹，放在EP管中使其形态完整为比较好。用液氮急速冷冻5min后置于-80℃环境中保存，送样时需要添加干冰。北京Label free非标记定量蛋白质组学方法