蛋白组究竟研究原因:首先,由于翻译调控和翻译后调控的存在,RNA的表达量与实际对应蛋白质的含量相关性并不高,就简单地测试了酵母中mRNA和对应蛋白质的定量相关性,结果是,低丰度蛋白与mRNA的相关性尤其低,而高丰度蛋白和其mRNA的相关性则高,经过平均后r值只为0.4。蛋白质组学相关技术目前在一小部分]应用中具有独特优势。蛋白组究竟研究的是什么呢?第1,蛋白质定性,或者说大规模检测某些蛋白质是否存在于样品当中;第2,蛋白质定量,也就是大规模检测某些蛋白质的含量(包括一定含量与相对含量);第3,蛋白质翻译后修饰,这些修饰主要包括磷酸化,泛素化,糖基化,乙酰化等等,也包括对这些翻译后修饰的定量研究。蛋白质组学现已被普遍应用于生命科学研究领域。济南Label free非标记定量蛋白质组学分析方法
4D定量蛋白质组学 :目前,蛋白质组学质谱分析一般是根据保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度对肽蛋白质进行鉴定和定量,即3D蛋白质组学。4D蛋白质组学在3D蛋白质组学的基础之上增加了第四维度,离子淌度(mobility),主要根据离子的形状和截面对离子进行分离,能够区分m/z差值非常小的肽段,使低丰度蛋白信号能够被区分和识别出来。蛋白质组学分析策略:蛋白质组学分析包括分析蛋白质的结构和功能、翻译后修饰情况、蛋白质定位、蛋白质表达情况以及蛋白质间的相互作用等等。基于不同的分析内容可以采用不同的蛋白质组学分析技术和分析策略。上海PRM靶向定量蛋白质组学技术蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标比较有效的方法之一。
LabelFree(非标记蛋白质组学技术):在非标记策略的定量模型中,主要涉及两种不同的算法:其一,以肽段的色谱峰积分面积为基础,通过比较一对生物样品中相对应到蛋白质酶解多肽的色谱积分面积而得到两者的相对丰度;其二,以肽段被质谱检测的计数为基础,通过归一化来表征被检测蛋白质的相对丰度。非标记技术认为肽段在质谱中被捕获检测的频率(Counts)与其在混合物中的丰度成正相关,因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度,通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。
iTRAQ定量蛋白组学技术:iTRAQ(Isobaric Tag for Relative Absolute Quantitation)定量蛋白质组学技术多肽体外标记定量技术。这种技术同TMT定量蛋白组学技术相似,可研究不同病理条件下或者不同发育阶段的组织样品中蛋白质表达水平的差异。Label-free:Label-free定量,即非标记的定量蛋白质组学,不需要对比较样本做特定标记处理,只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化,通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量时所产生的质谱数据。蛋白质组学研究是生命科学进入后基因时代的特征。
蛋白质组学研究内容有什么?对人类而言,蛋白质组学的研究要服务于人类的健康,主要指促进分子医学的发展。如寻找药物的靶分子。很多药物本身就是蛋白质,而很多药物的靶分子也是蛋白质。药物也可以干预蛋白质-蛋白质相互作用。在基础医学和疾病机理研究中,了解人不同发育、生长期和不同生理、病理条件下及不同细胞类型的基因表达的特点具有特别重要的意义。这些研究可能找到直接与特定生理或病理状态相关的分子,进一步为设计作用于特定靶分子的药物奠定基础。蛋白质组学技术有等电聚焦。贵州定量乙酰化蛋白质组学检测价格
通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析,我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”。济南Label free非标记定量蛋白质组学分析方法
蛋白组学常见研究模式主要有两种:1.通过蛋白质组学寻找疾病发生的发展的新型标志物;2.结合其它组学建立疾病或者研究主题的表达谱和分子机制。蛋白质组学( proteomics) 是指系统研究某一基因组所表达的所有蛋白质,包括组成蛋白质一级结构的氨基酸序列,蛋白质的丰度,蛋白质的修饰以及蛋白质之间的相互作用。蛋白质组和基因组( genome)在概念上有相关性,表示某一个蛋白质组的蛋白质是由基因组所编码的,然而蛋白质组学和基因组学在研究对象和研究方法上有很大的区别。济南Label free非标记定量蛋白质组学分析方法