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深圳4D定量蛋白质组学应用

来源: 发布时间:2022-05-16

蛋白质组学技术:电喷雾质谱:ESI-MS是利用高电场使质谱进样端的毛细管柱流出的液滴带电,在N2气流的作用下,液滴溶剂蒸发,表面积缩小,表面电荷密度不断增加,直至产生的库仑力与液滴表面张力达到雷利极限,液滴爆裂为带电的子液滴,这一过程不断重复使液滴非常细小呈喷雾状,这时液滴表面的电场非常强大,使分析物离子化并以带单电荷或多电荷的离子形式进入质量分析器。ESI-MS从液相中产生离子,一般说来,肽段的混合物经过液相色谱分离后,经过偶联的与在线连接的离子阱质谱分析,给出肽片段的精确的氨基酸序列,但是分析时间一般较长。目前,许多实验室两种质谱方法连用,获得有意义的蛋白质的肽段序列,设计探针或引物来获得有意义的基因。随着蛋白质组研究的深入,又有多种新型质谱仪出现,主要是在上述质谱仪的基础上进行改进与重新组合。蛋白质组学相关技术目前在一小部分应用中具有独特优势。深圳4D定量蛋白质组学应用

蛋白质组学定义:蛋白质组学(proteomics),指对某一基因组所表达的所有蛋白质及其特征进行大规模、系统化地研究,以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。研究的内容主要包括:组成蛋白质一级结构氨基酸的序列特征、蛋白质的丰度、蛋白质活性、蛋白质的修饰、亚细胞定位和三维结构、蛋白质之间的相互作用以及对蛋白质的高阶复合物结构。蛋白质组学的研究方法主要有:蛋白质双向电泳、氨基酸序列测定(包括N端测序和C端测序)、质谱、生物信息学。山东新型修饰蛋白组学质谱分析蛋白质组学的研究主要促进分子医学的发展。

定量蛋白质组学方法学介绍:iTRAQ:iTRAQ定量是目前定量蛋白质组学应用比较普遍的技术,该技术的关键原理是多肽标记和定量,将多肽的含量转化为114、115、116和117同位素的含量(或113、114、115、116、117、118、119和121的8标记),从而简化了定量的复杂性,然后通过多肽定量值回归到蛋白的定量值,从而测定出不同样本之间蛋白质的差异。iTRAQ定量不依赖样本,可检测出较低丰度蛋白,胞浆蛋白、膜蛋白、胞外蛋白等,且定量准确,可同时对8个样本进行分析,并可同时得出鉴定和定量的结果,特别适用于采用多种处理方式或来自多个处理时间的样本的差异蛋白分析。

常用的定量蛋白质组学技术方法有以下几类:非标记(labelfree)的定量蛋白组学技术:Label free定量蛋白组学技术是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。TMT定量蛋白组学技术:这种技术采用多个(2-10)稳定同位素标签,特异性标记多肽的氨基基团进行串联质谱分析,能够同时比较多达10种不同样本中蛋白质的相对含量,可用于研究不同病理条件下或者不同发育阶段的组织样品中蛋白质表达水平的差异。近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域。

蛋白质组学技术有什么?双向凝胶电泳:双向凝胶电泳的原理是第1向基于蛋白质的等电点不同用等电聚焦分离,第二向则按分子量的不同用SDS-PAGE分离,把复杂蛋白混合物中的蛋白质在二维平面上分开。由于双向电泳技术在蛋白质组与医学研究中所处的重要位置,它可用于蛋白质转录及转录后修饰研究,蛋白质组的比较和蛋白质间的相互作用,细胞分化凋亡研究,致病机制及耐药机制的研究,疗效监测,新药开发,研究,蛋白纯度检查,小量蛋白纯化,新替代疫苗的研制等许多方面。近年来经过多方面改进已成为研究蛋白质组的比较有使用价值的关键方法。蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标比较有效的方法之一。哈尔滨PRM靶向定量蛋白质组学项目

蛋白质组研究是为了识别及鉴定一个细胞或组织所表达的全部蛋白质以及它们的表达模式。深圳4D定量蛋白质组学应用

蛋白质组学常用技术:非靶向蛋白组学:蛋白质定性(胶条鉴定和溶液鉴定),高通量定量蛋白组(Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量),多肽组学。蛋白质组研究技术在研究对象上,覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围。蛋白质组学主要以全蛋白组(组织、细胞)、线粒体蛋白组、叶绿体蛋白组和外泌体蛋白组为研究对象,通过对蛋白组进行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析,揭示生物学功能、作用机制、疾病诊断的标志物以及预测蛋白的上、下游变化关系。蛋白质组学可以克服核酸水平预测的不确定性、反映核酸翻译后修饰情况。深圳4D定量蛋白质组学应用

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