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南京蛋白质泛素化修饰组学一般流程

来源: 发布时间:2022-05-15

泛素化修饰蛋白质组技术原理:首先将蛋白样本酶解成肽段混合物,然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度,然后通过高质量的泛素化修饰类抗体和生物材料对修饰肽段进行富集,之后上样至液相色谱-串联质谱中进行分析定量。技术优势:1、高特异性的修饰类泛抗体;2、高分辨率、高灵敏度质谱仪;应用领域:泛素化修饰还参与了细胞周期、增殖、细胞凋亡、分化、转录调控、基因表达、转录调节、信号传递、损伤修复、炎症免疫等几乎一切生命活动的调控。泛素化心血管等疾病的发病密切相关。因此,作为近年来生物化学研究的一个重大成果,它已然成为研究、开发新药物的新靶点。已知的蛋白质翻译后修饰种类有20多种。南京蛋白质泛素化修饰组学一般流程

泛素化修饰蛋白质组学有些什么?泛素化可以生产出单泛素化或多泛素化蛋白质。后者在当7个赖氨酸残基的泛素与另一个泛素的甘氨酸C端连接形成。这种泛素分子链接在生物过程中起到重要的作用。共价结合泛素的蛋白质能被蛋白酶识别并降解,这是细胞内短寿命蛋白质和一些异常蛋白降解的普遍途径。泛素化及类泛素化蛋白在细胞分裂,自噬,DNA修复,免疫应答,细胞消亡等方面同样起到关键作用。与消化道内进行的蛋白质水解不同,从泛素与蛋白的结合到将蛋白水解成小的肽段,整个水解过程需要能量参与。人们开始意识到泛素-蛋白酶系统是一个对于真核细胞非常重要的调节系统。四川磷酸化修饰蛋白质组学分析研究蛋白质翻译后修饰组学有什么重要的作用呢?

泛素化修饰PRM定量验证:原理: 泛素化修饰是一种重要的翻译后修饰。泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物体内80%~85%的蛋白质降解。此外,泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位,调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的多种细胞活动。首先对泛素化的蛋白进行胰酶消化,在赖氨酸的修饰位点上会产生两个甘氨酸的残基(K-GG),利用对泛素化赖氨酸(K-GG)具有高亲和力的基序抗体,特异性富集复杂样本中的泛素化肽段,结合LC-MS/MS蛋白质定量方法,实现大规模泛素化蛋白质定性定量分析。

蛋白质翻译后修饰自中而下分析策略:自中而下的蛋白质组学技术可用于组蛋白修饰的分析。样品制备与普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到纯化的组蛋白。提取组蛋白后,用GluC进行消化。然后用弱阳离子交换/亲水相互作用色谱(WCX-HILIC)与配备电子转移解离(ETD)的高分辨率质谱联机联用,对样品进行理想的分离。谱识别可以用传统的软件进行,但是由于估计适当的错误发现率的问题,需要对结果进行过滤。自上而下分析策略:自上而下的技术可以直接引入完整的蛋白质并在串联质谱仪上对其进行片段化,不需要蛋白质水解消化。目前,有两种完全分离蛋白质的方法:离线和在线。前者用四维分离法,后者用WCX-HILIC。蛋白质翻译后修饰发挥十分重要的调控作用。

蛋白质翻译后修饰组学产品:常规的蛋白质组学研究往往只关注不同生理、病理条件下蛋白质表达水平的变化。然而,越来越多的研究发现,许多重要的生命活动、疾病发生不仅与蛋白质的丰度相关,更重要的是被各类蛋白质翻译后修饰所调控。因此深入研究蛋白质翻译后修饰对揭示生命活动的机理、筛选疾病的临床标志物、鉴定药物靶点等方面都具有重要意义。由于翻译后修饰的蛋白质在生物样本中含量低、动态范围广,质谱分析前需要对修饰进行富集以提高其丰度。翻译后修饰是指对翻译后的蛋白质进行共价加工的过程。四川磷酸化修饰蛋白质组学分析研究

乙酰化修饰蛋白组学应用方向有什么?南京蛋白质泛素化修饰组学一般流程

泛素化修饰蛋白组学研究:泛素化修饰蛋白组学是一种重要的翻译后修饰。泛素-蛋白酶体系统介导了真核生物体内80%~85%的蛋白质降解。此外,泛素化修饰还可以直接影响蛋白质的活性和定位,调控包括细胞周期、细胞凋亡、转录调控、DNA 损伤修复以及免疫应答等在内的多种细胞活动。由于翻译后修饰的蛋白质在生物样本中含量低、动态范围广,质谱分析前需要对修饰进行富集以提高其丰度,然后利用传统的定量蛋白组分析手段对富集得到的泛素化肽段样品进行定量分析。南京蛋白质泛素化修饰组学一般流程

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