蛋白质组学：质谱分析蛋白质组学的基本原理主要是通过测定被测样品离子的理化性质来进行分析，根据样品的质量谱图和相关信息从而得到定性和定量结果。目前，蛋白质组学质谱分析一般是根据保留时间（retentiontime）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity）这三个维度对肽蛋白质进行鉴定和定量，即3D蛋白质组学。4D蛋白质组学在3D蛋白质组学的基础之上增加了第四维度，离子淌度（mobility），主要根据离子的形状和截面对离子进行分离，能够区分m/z差值非常小的肽段，使低丰度蛋白信号能够被区分和识别出来。4D蛋白质组学基于timsTOFPro质谱仪，结合PASEF（ParallelAccumulationSerialFragmentation，同步累积连续碎裂）与TIMS（TrappedIonMobilitySpectrometry，离子迁移谱），可重复测量所有检测离子的碰撞截面（CCS），能更快、更灵敏的进行蛋白质组定性和定量。定量蛋白质组学技术主要分为标记（label）和非标记（label free）定量策略。济南外泌体蛋白质组学应用

蛋白质组学基础研究方面：近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域，如细胞生物学、神经生物学等。在研究对象上，覆盖了原核微生物、真核微生物、植物和动物等范围，涉及到各种重要的生物学现象，如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等等。在未来的发展中，蛋白质组学的研究领域将更加普遍。应用研究方面：蛋白质组学将成为寻找疾病分子标记和药物靶标比较有效的方法之一。在对早老性痴呆等人类重大疾病的临床诊断和治理方面蛋白质组技术也有十分诱人的前景，目前国际上许多大型药物公司正投入大量的人力和物力进行蛋白质组学方面的应用性研究。外泌体蛋白质组学研究内容蛋白质组的复杂性也远远高于基因组，这是因为一个基因≠一个转录产物≠一个蛋白质。

定量蛋白质组学方法学介绍：Label-free：Label-free定量，即非标记的定量蛋白质组学，不需要对比较样本做特定标记处理，只需要比较特定肽段/蛋白在不同样品间的色谱质谱响应信号便可得到样品间蛋白表达量的变化，通常用于分析大规模蛋白鉴定和定量时所产生的质谱数据。Label-free定量不需要标记处理，操作简单，可以做任意样本的总蛋白质差异定量，但对实验操作的稳定性、重复性要求较高，准确性也较标记定量差。因此，Label-free技术适合于大样本量的定量比较，以及对无法用标记定量实现的实验设计。

蛋白质组学在医学的研究应用：蛋白质组学(Proteomics)是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学。labelfree-非标定量法分析技术方法：非标定量法[Labelfree]是近年来重要的质谱定量方法，通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的数量变化。蛋白质非标记定量技术（LabelFree）是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。蛋白质组的研究能为生命活动规律提供物质基础。

蛋白质组学应用领域：1.蛋白质鉴定：能够应用一维电泳和二维电泳并分离相关的技术，应用蛋白质芯片和抗体芯片及共沉淀等技术对蛋白质停止审定研讨。2.修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要阅历后修饰如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。修饰是蛋白质调理功用的重要方式，因而对蛋白质后修饰的研讨对说明蛋白质的功用具有重要作用。3、蛋白质功用：如剖析酶活性和酶底物，细胞因子的生物剖析/配基-受体分离剖析。能够应用基因敲除和反义技术剖析基因表达产物-蛋白质的功用。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研讨也在水平上有助于蛋白质功用的理解。近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域。济南外泌体蛋白质组学应用

定量蛋白质组学通过对蛋白质的定量分析，以了解基因在不同的生理、病理和逆境条件下的表达情况。济南外泌体蛋白质组学应用

蛋白质组学技术：等电聚焦：等电聚焦（isoelectricfocusing，IEF）是一种利用有pH梯度的介质分离等电点不同的蛋白质的电泳技术。等电聚焦凝胶电泳依据蛋白质分子的静电荷或等电点进行分离，等电聚焦中，蛋白质分子在含有载体两性电解质形成的一个连续而稳定的线性pH梯度中电泳。载体两性电解质是脂肪族多氨基多羧酸，在电场中形成正极为酸性，负极为碱性的连续的pH梯度。蛋白质分子在偏离其等电点的pH条件下带有电荷，因此可以在电场中移动；当蛋白质迁移至其等电点位置时，其静电荷数为零，在电场中不再移动，据此将蛋白质分离。济南外泌体蛋白质组学应用