定量蛋白质组学分析(QuantitativeProteomics)是对一个基因组表达的全部蛋白质或一个复杂混合体系内所有蛋白质进行精确鉴定和定量。可用于筛选和寻找任何因素引起的样本之间的差异表达蛋白,结合生物信息学揭示细胞生理病理等功能,同时也可对某些关键蛋白进行定性和定量分析。目前定量蛋白质组学技术常见标记(Label)和非标记的(LabelFree)定量策略。定量蛋白质组学技术常见的几类主要包括:LabelFree定量蛋白组分析、SILAC与免疫共沉淀蛋白互作分析、MRM/PRM定量蛋白组学分析、SILAC/Dimethyl标记定量蛋白组分析、SWATH定量蛋白组学、TMT/iTRAQ/multinotch定量蛋白组学分析。对人类而言,蛋白质组学的研究终究要服务于人类的健康。深圳定量乙酰化蛋白质组学技术
LabelFree(非标记蛋白质组学技术):在非标记策略的定量模型中,主要涉及两种不同的算法:其一,以肽段的色谱峰积分面积为基础,通过比较一对生物样品中相对应到蛋白质酶解多肽的色谱积分面积而得到两者的相对丰度;其二,以肽段被质谱检测的计数为基础,通过归一化来表征被检测蛋白质的相对丰度。非标记技术认为肽段在质谱中被捕获检测的频率(Counts)与其在混合物中的丰度成正相关,因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度,通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。广东DIA定量蛋白质组学分析方法非标记定量蛋白质组学技术可以对不同物种和不同的样本类型可以同时开展蛋白定量分析。
蛋白质组研究:蛋白质组研究是指系统研究在某一特定时间、特定条件下,某一种特定组织中的所有蛋白质。对蛋白质的研究也不只是局限于蛋白质的氨基酸序列,而是包括了蛋白质的表达量,蛋白质活性,被修饰的状况以及和其他蛋白质或分子的相互作用情况、亚细胞定位和三维结构。这些信息对于全方面了解复杂的生物系统有着重要的意义。因此,蛋白质组学研究目标是大规模、系统化地研究蛋白质的特性,以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。
蛋白质组学与基因组学的差异:蛋白质组和基因组(genome)在概念上有相关性,某一个蛋白质组的蛋白质是由其基因组所编码的,然而蛋白质组学和基因组学在研究对象和研究方法上有很大的区别。基因组在所有的细胞中几乎都是完整的,与之不同,蛋白质组具有很高的细胞和组织特异性,不同的细胞组织表达不同的蛋白质组。蛋白质组的复杂性也远远高于基因组,这是因为一个基因≠一个转录产物≠一个蛋白质。比如据估计人的基因组由30000个基因组成,经mRNA剪切和蛋白质翻译后修饰将产生20万~200万个蛋白质。由于不同的转录起始和mRNA剪切使同一基因产生了不同的转录产物。同样由于不同的翻译起始,一个mRNA可以翻译成不同的蛋白质。蛋白质组学的分析主要指蛋白的生信分析,依赖于数据库的建立。
蛋白质组学研究策略有什么?“自顶向下”策略并不依赖于蛋白酶的酶切,而是直接鉴定完整蛋白质,在翻译后修饰和蛋白质同素异构体鉴定方面有一些潜在的优势。可是该策略的缺陷是蛋白质在气相中分离、电离及碎裂都十分困难。而鸟管法蛋白质组学由于将蛋白质酶解成肽段,使其在气相中更容易被分离、电离和碎裂;所以鸟管法蛋白质组学在蛋白质组学研究中得到了比较普遍的应用。“自中向下”策略也依赖于蛋白酶的酶切,但是由于采用了另外的酶,比如OmpT,只能酶切(Lys/Arg-Lys/Arg),因此酶切之后的分子量较大,更利于后续的蛋白组装环节。蛋白质组学技术的本质(从分析化学角度来看),就是对蛋白质的定性定量分析。贵州外泌体蛋白质组学费用
蛋白质组研究技术涉及到各种重要的生物学现象,如信号转导、细胞分化、蛋白质折叠等等。深圳定量乙酰化蛋白质组学技术
定量蛋白质组学的方法学背景和意义:从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究,识别功能模块和路径,监控疾病的生物标志物,这些研究都需要对蛋白质进行鉴定和定量。生物质谱技术的出现和不断成熟为蛋白质差异表达分析提供了更可靠、动态范围更广的研究手段。基于质谱技术,科学家们不断开发出新的定量蛋白质组学方法,来了解细胞、组织或生物体的整体蛋白质动力学。深圳定量乙酰化蛋白质组学技术