转录组学，基因组学，蛋白质组学的区别：蛋白组学针对的是全体蛋白，组要以2D-Gel和质谱为主，分为top-down和bottom-up分析方法。理念和基因组类似，将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段，在通过质量反推蛋白序列，之后进行搜索，标识已知未知的蛋白序列。转录组学研究的是某个时间点的mRNA总和，可以用芯片，也可以用测序。芯片是用已知的基因探针，测序则有可能发现新的mRNA。基因组学研究的主要是基因组DNA，使用方法目前以二代测序为主，将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。当然这只是第1步，随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作。转录组，指细胞某一时期所有基因的转录水平。南京mRNA-seq转录组学鉴定

什么叫转录组？广义转录组是指生命单元(通常是一种细胞)中所有按基因信息单元转录和加工的RNA分子(包括编码和非编码RNA功能单元),或者是一个特定细胞所有转录本的总和.它的研究对象就是这些RNA与蛋白质分子和它们所组成的基因功能网络以及它们与细胞功能的关系.而狭义转录组是指可直接参与翻译蛋白质的mRNA总和.研究生物细胞中转录组的发生和变化规律的科学就称为转录组学(tran—scriptomics).转录组学的意义1．转录组谱可以提供特定条件下某些基因表达的信息,并据此推断相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制.2．通过基于基因表达谱的分子标签,不仅可以辨别细胞的表型归属,还可以用于疾病的诊断.3．转录组的研究应用于临床的另一个例子是可以将表面上看似相同的病症分为多个亚型,尤其是对原发性恶性瘤子,通过转录组差异表达谱的建立,可以详细描绘出患者的生存期以及对药物的反应等。浙江SmalIRNA转录组学鉴定转录组学差异基因太多，注释信息太杂乱，怎么挑选目标基因？

什么是转录组测序？转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的组合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的组合。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括mRNA和ncRNA。转录组具有时间特异性、组织特异性、空间特异性等特点。普通转录组测序适用于哪些情况？普通转录组测序主要适用于两大类：一是不同的生长阶段或者发育过程；二是不同的环境、药物、病原菌等逆境胁迫处理。

转录组学的概念：转录组是指特定组织或细胞在某一发育阶段或功能状态下转录出来的所有RNA的汇合，包括蛋白质编码的信使RNA和非编码RNA（rRNA、tRNA和其他ncRNAs），高通量测序技术也被称为下一代测序（NGS）技术，推进了基因组学的研究进展。该项新技术除了研究静态基因组，近年来也开始应用于动态转录分析，由此衍生的技术称为RNA序列分析（RNA-seq）随着DNA基因芯片技术的快速发展，开创了这个病症近十年的高通量转录组研究。RNA-Seq技术可以从转录水平检测瘤中的改变基因。通过相关软件分析，鉴定相关改变基因在瘤发生的发展中所起的作用。然后经过刷选，进一步挑选出相关靶基因进行实验研究，有望为瘤的基因医治提供新的靶点。转录组学是研究特定的细胞、组织或个体在特定时间和状态下所转录出所有 RNA 的学科。

转录组学测序流程：1、样品RNA准备。2、测序文库构建。3、DNA成簇(Cluster)扩增。4、高通量测序(Illumina)。5、数据分析。转录组的分析大致有以下几种情况：1、同一物种在发育过程中的各时间节点的基因表达特点及存在的差异；2、不同品系之间存在的差异表达基因；3、不同的外界条件处理，如细菌、病毒、光照、紫外、干旱、高温、高盐胁迫，对基因表达的影响；转录组（transcriptome），是指特定生长阶段某组织或细胞内所有转录产物的汇合，狭义上指所有mRNA的汇合。宏转录组学能有效的扩展微生物资源的利用空间。浙江SmalIRNA转录组学鉴定

circRNA转录组学一类具有闭合环状结构的非编码RNA分子。南京mRNA-seq转录组学鉴定

RNA-Seq转录组学技术优势：相比基因芯片和标记的碱基序列的测序方法，RNA-seq具有一定的优越性。与基因芯片相比，RNA-Seq不只可以在更高的分辨率下用来测量基因的表达水平情况，还可以揭示未知的转录组和拼接亚型，并为选择性拼接亚型提供定量分析。相对于传统的芯片杂交平台，转录组测序无需预先针对已知序列设计探针，即可对任意物种的整体转录活动进行检测，提供更精确的数字化信号、更高的检测通量以及更普遍的检测范围，是目前深入研究复杂性转录组的强大工具。鉴于这些优势，RNA-Seq很快就被应用到关于瘤病相关研究的多个方面。南京mRNA-seq转录组学鉴定