蛋白组学研究怎么做？PRM:平行反应监测(ParallelReactionMonitoring)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术，能够对目标蛋白质、目标肽段（如发生翻译后修饰的肽段）进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质/肽段进行一定定量，因此也被称之为基于液相色谱质谱联用技术的WesternBlot（LC-MSMSbasedWesternBlot,L-WB）。PRM技术基于Q-Orbitrap为表示的高分辨、高精度质谱平台，首先利用四级杆质量分析器的选择能力，用Q1选择目标肽段的母离子，随后在Collisioncell中对母离子进行碎裂，之后利用Orbitrap分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。蛋白质组学，指对某一基因组所表达的所有蛋白质及其特征进行大规模、系统化地研究。贵州PRM定量蛋白质组学质谱鉴定

蛋白质学组翻译后修饰的研究策略：自中而下：自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一种替代方法，分析组蛋白时其原理类似于自下而上分析策略。在使用这种分析方法时，通常需要将被检测蛋白质消化成3-9kDa范围内的肽段，因此也无法保证检测到的肽段的完整性。但是，由于仪器的进步和保留了组蛋白尾部的组合修饰，自中而下分析法正逐渐受到欢迎。自中而下更接近于自下而上法的灵敏度。自上而下：自上而下技术可以直接对完整的蛋白质进行测序，包括翻译后修饰的蛋白质和其他大的蛋白质片段，而不只是肽段。这可以比较大程度地保留与PTMs相关的信息，使其适用于组蛋白的全方面表征和分析。广东定量蛋白组学应用蛋白质组学为农业作物的进一步开发利用提供巨大的参考价值。

非标定量法(Label-free)是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的数量变化，认为肽段在质谱中被捕获检测的频率与其在混合物中的丰度成正相关，因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度，通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。按照其原理主要分为两种，第1种spectrumcounts类的非标记方法，发展比较早，已经形成多种定量算法，但是主要的原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础，各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。第二种非标记定量的原理是以MS1为基础，计算每个肽段的信号强度在LC-MS上的积分。

蛋白质组学的目标是要回答关于蛋白质的4个方面的问题:①细胞中蛋白质的含量。②定位。③活性。④修饰。蛋白质组学的研究方法主要有:①蛋白质双向电泳。②氨基酸序列测定（包括N端测序和C端测序)。③质谱。④生物信息学。发育蛋白质组学指在某一特定的生长发育时期，在特定的生长条件下，特定的细胞、组织中所表达的所有蛋白质。发育蛋白质组学揭示了在每个特定时期所表达的蛋白质和这些不同的蛋白质在特殊的生长时期可能发挥的作用，是进一步了解和深入研究蛋白质功能的基础。蛋白质组学研究不只是探索生命奥秘的必须工作，也能为人类健康事业带来巨大的利益。

蛋白质组学应用领域：1.蛋白质鉴定：能够应用一维电泳和二维电泳并分离相关的技术，应用蛋白质芯片和抗体芯片及共沉淀等技术对蛋白质停止审定研讨。2.修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要阅历后修饰如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。修饰是蛋白质调理功用的重要方式，因而对蛋白质后修饰的研讨对说明蛋白质的功用具有重要作用。3、蛋白质功用：如剖析酶活性和酶底物，细胞因子的生物剖析/配基-受体分离剖析。能够应用基因敲除和反义技术剖析基因表达产物-蛋白质的功用。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研讨也在水平上有助于蛋白质功用的理解。蛋白质组学的研究主要促进分子医学的发展。杭州高通量蛋白质组学质谱分析

蛋白质组学技术有飞行时间质谱。贵州PRM定量蛋白质组学质谱鉴定

蛋白质组学研究内容：1.蛋白质鉴定：可以利用一维电泳和二维电泳并结合相关技术，利用蛋白质芯片和抗体芯片及免疫共沉淀等技术对蛋白质进行鉴定研究。2.翻译后修饰：很多mRNA表达产生的蛋白质要经历翻译后修饰如磷酸化，糖基化，酶原刺激等。翻译后修饰是蛋白质调节功能的重要方式，因此对蛋白质翻译后修饰的研究对阐明蛋白质的功能具有重要作用。3.蛋白质功能确定：如分析酶活性和确定酶底物，细胞因子的生物分析/配基-受体结合分析。可以利用基因敲除和反义技术分析基因表达产物-蛋白质的功能。另外对蛋白质表达出来后在细胞内的定位研究也在一定程度上有助于蛋白质功能的了解。有的荧光蛋白表达系统就是研究蛋白质在细胞内定位的一个很好的工具。贵州PRM定量蛋白质组学质谱鉴定