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哈尔滨动物靶向代谢组学分析

来源: 发布时间:2022-04-28

代谢组学的特点:1.相对于其他组学研究,检测技术相对简单(液-质联用,气-质联用及核磁)2.代谢组学是体内外多种综合因素的结果。代谢组学的应用:生物标志物寻找,疗效的监控,疾病分型,中药研究中的治病机理,毒副作用评价。代谢组学研究思路:1.?通过差异分析得到差异代谢物后,对大样本数据进行KM,ROC,Cox等分析,发现临床生存及疾病预测价值。2.?差异代谢物进行功能研究,抗代谢物或者是添加外源代谢物,细胞及动物实验验证该代谢物对表型的重要性。3.?多组学研究,根据代谢物找到上游调控蛋白,对上游蛋白进行研究。代谢组学的概念来源于代谢组,代谢组是指某一生物或细胞在一特定生理时期内所有的低分子量代谢产物。哈尔滨动物靶向代谢组学分析

非靶向代谢组学:非靶向代谢组学是将生物体所有内源性代谢物作为研究目标(广筛),重点在于比较实验组和对照组,发现寻找其种具有明显的变化的代谢物质(差异代谢物),并构建代谢通路以解释代谢物于该生命体的关联。LC-MS非靶向代谢组的优势:1、分析范围广,MS几乎可以检测所有的化合物,更加容易地解决了分析热不稳定化合物的难题;2、分离能力强,即使被分析混合物在色谱上没有完全分离开,但通过MS的特征离子质量色谱图也能分别给出它们各自的色谱图来进行定性定量。济南LC-MS/MS非靶向脂质组学研究内容与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学与生理学的联系更加紧密。

代谢组学需要多少的生物学重复?生物学重复指的是相同处理的相同类型的生物样本的数量(如相同剂量给药后2小时的小鼠采集并且相同储存条件和处理方法血清样本)。相较于基因和蛋白,代谢物处于生命活动的下游,收到环境和遗传背景等因素影响较大,生物学重复少可能会放大组内差异对于整体差异的影响,进而影响结果(如准确和足够多的找出生物标志物)。因此根据不同的生物类型,需要不同的生物学重复来增加数据的可靠性和说服力。代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似。

代谢组学样品收集方法及所需样本量是什么?(1) 血清样品: 避免反复冻融。血液收集在离心管中静置30分钟进行凝血。8000rpm离心10分钟,取上清分装到冻存管中,放置液氮中或-80度冻存;单个样本要求体积为50μL。(2) 尿液样品:临床样本请全部取清晨第1次尿液。尿液直接分装到离心管中,8000rpm离心10分钟,取上清分装到冻存管中,放置液氮中或-80度冻存,-80度冻存;单个样本要求体积为100μL。(3) 其他样本收集办法请咨询谱领工作人员。代谢组学可与生物表型变化建立直接相关性。

非靶向代谢组学:新陈代谢网络是复杂的网络,特别是人体的代谢网络,一直被认为是相对复杂的代谢网络。现在多数信号通路的研究是集中在代谢网络的一个很小的领域。基因组学、蛋白组学研究已经揭示了部分调节通路,但是和代谢网络直接相关的是代谢产物。从多种代谢产物中选取研究对象,无疑是困难的。非靶向代谢组学又称为发现代谢组学,主要是将对照组和实验组的代谢组(某一生物体的全部代谢物)进行比对,以找出其代谢物的差异。代谢组学研究通过一定的手段能够帮助研究员从代谢产物海中跳出来,提供一个“航拍”的视角,从而发现差异性代谢产物。然后通过已知的代谢通路逆推找出调节酶和基因,完成疾病发病机制、药物疗理机制等方面的研究。代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似。哈尔滨动物靶向代谢组学分析

代谢组学作为系统生物学的一个重要的分支,与其他组学相比有着其特有的优势。哈尔滨动物靶向代谢组学分析

靶向代谢组学分析成功的关键因素是准确度、高通量和可靠性。靶向代谢组学鉴定一般采用 GC/MS 系统的选择性离子监测 (SIM),或在三重串联四极杆 LC/MS 系统上用多反应离子监测 (MRM) 进行靶向 MS/MS。SIM 比全扫描图谱采集具有更高的灵敏度,在单四极杆质谱中,这种灵敏度增强的原因是延长了所选择离子的采集时间。因为监测的是一个很小的质量窗口,所以质量色谱图只表示对极为特定质量的检测。在大多数情况下,灵敏度可以提高 10 倍。MRM 是进行质谱定量的选择方法,与 SIM 相比更为灵敏、更加特异。可以产生独特的碎片离子,可对非常复杂基质中的目标化合物进行监测和定量。哈尔滨动物靶向代谢组学分析

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