转录组学 (transcriptomics)是功能基因组学 ( Functional Genomics)研究的重要组成部分，是一门在整体水平上研究细胞中所有基因转录及转录调控规律的学科。随着越来越多的基因组序列相继被测定,生命科学的研究进入了后基因组时代,各类组学技术得到迅速地发展与普遍地应用包括以基因为研究对象的基因组学(Genomics)、以转录过程为研究对象的转录组学(Transcriptomics)。意义：1、转录组谱可以提供特定条件下某些基因表达的信息,并据此推断相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制。2、通过基于基因表达谱的分子标签,不只可以辨别细胞的表型归属,还可以用于疾病的诊断。转录组学分析转录本的结构和表达水平的同时，还能发现未知转录本和稀有转录本。河南宏转录学组技术

什么叫转录组学？广义转录组是指生命单元(通常是一种细胞)中所有按基因信息单元转录和加工的RNA分子(包括编码和非编码RNA功能单元),或者是一个特定细胞所有转录本的总和.它的研究对象就是这些RNA与蛋白质分子和它们所组成的基因功能网络以及它们与细胞功能的关系.而狭义转录组是指可直接参与翻译蛋白质的mRNA总和。转录组是干什么用的，和表达谱有什么区别？转录组，指细胞某一时期所有基因的转录水平。转录组学，是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。简而言之，转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。南京全转录学组质谱鉴定转录组学灵敏度高，可以检测细胞中少至几个拷贝的稀有转录本。

宏转录组学也称为环境转录组学，指从整体水平上研究某一特定环境、特定时期菌群群体全部基因转录情况以及转录调控规律，以揭示微生物在不同环境压力下的适应机制，探索环境与微生物之间的相互作用机理。其适用范围包括人体微生态、环境、工业、农业等领域。宏转录组学以生态环境中的全部RNA为研究对象，避开了微生物分离培养困难的问题，能有效的扩展微生物资源的利用空间。应用领域：包括肠道微生物、口腔微生物、粪便微生物、人体组织微生物。

转录组学测序流程：1、样品RNA准备。2、测序文库构建。3、DNA成簇(Cluster)扩增。4、高通量测序(Illumina)。5、数据分析。转录组的分析大致有以下几种情况：1、同一物种在发育过程中的各时间节点的基因表达特点及存在的差异；2、不同品系之间存在的差异表达基因；3、不同的外界条件处理，如细菌、病毒、光照、紫外、干旱、高温、高盐胁迫，对基因表达的影响；转录组（transcriptome），是指特定生长阶段某组织或细胞内所有转录产物的汇合，狭义上指所有mRNA的汇合。circRNA是一种非编码RNA，可以多种方式参与生物学功能。

RNA-seq转录组学技术优势有：1、可以直接测定每个转录本片段序列、单核苷酸分辨率的准确度;2、灵敏度高，可以检测细胞中少至几个拷贝的稀有转录本;3、可以对任意物种进行全基因组分析，能够检测未知基因，发现新的转录本，并准确地识别可变剪切位点及cSNP，UTR区域;4、检测范围广，能够同时鉴定和定量稀有转录本和正常转录本。RNA-seq转录组学是需要生物学重复的，至少需要两次生物学重复，3次以上的生物学重复更好。以3个重复为例，加上对照的三个生物学重复，一次RNA-seq需要6个样本。宏转录组学适用范围包括人体微生态、环境、工业、农业等领域。南京全转录学组质谱鉴定

转录组学测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和。河南宏转录学组技术

转录组学应用领域：农林领域：生长发育机制，抗逆胁迫机制，育种，物种保护研究等；畜牧业：生长发育机制，致病机理研究，肉类及乳制品品质研究等；海洋水产：生长发育机制，渔业资源，渔业环境与水产品安全等；微生物：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等；生物医药：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，药物开发，个性化医治等；环境科学：发酵过程优化，生物燃料生产，环境危害风险评估研究等；食品科学：食品储藏及加工条件优化，食品组分及品质鉴定，功能性食品开发，食品安全监检测等。河南宏转录学组技术