蛋白质组学有什么用,能给我实验带来什么?可以大规模鉴定特定组织、细胞等各种样本的蛋白质种类、修饰状态以及蛋白质之间的相互作用,以及对这些蛋白质功能分析、分类;可以对不同条件下某一特定样本进行大规模的蛋白质(包括翻译后修饰蛋白)表达量变化分析,筛选潜在biomarker,筛选重要信号通路;依托大样本量,可以实现疾病的分子分型分析、重要潜在靶标鉴定。质谱的蛋白质组学和芯片哪个更好出结果?若有对应物种的全基因组并有预测的全蛋白序列库,可优先选择全蛋白序列库;若无全蛋白序列库,有对应物种对应组织的转录组测序结果并,可以使用转录组的测序结果(mRNA三框翻译或者预测CDS,并翻译成氨基酸序列);若基因组、转录组数据库都没有,优先选择同源性比较接近的物种的全蛋白数据库,若近源物种没有合适的全蛋白库,则选择更大的蛋白全库(如动物全库、绿色植物全库、微生物库等)。蛋白质组学为农业作物的进一步开发利用提供巨大的参考价值。江苏外泌体蛋白质组学应用
蛋白质组学介绍:蛋白质组学,指对某一基因组所表达的所有蛋白质及其特征进行大规模、系统化地研究,以期望在蛋白质水平上解释控制复杂的生命活动的分子网络。研究的内容主要包括:组成蛋白质一级结构氨基酸的序列特征、蛋白质的丰度、蛋白质活性、蛋白质的修饰、亚细胞定位和三维结构、蛋白质之间的相互作用以及对蛋白质的高阶复合物结构。蛋白质组主要通过蛋白质双向电泳、氨基酸序列测定、质谱、生物信息等方法,研究某个基因组对应的所有蛋白质特征,包括蛋白质含量、亚细胞定位、活性以及蛋白修饰等内容。江苏TMT/iTRAQ标记定量蛋白质组学检测多少钱蛋白质组意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。
蛋白质组学技术:飞行时间质谱:MALDI的基本原理是将分析物分散在基质分子(尼古丁酸及其同系物)中并形成晶体,当用激光(337nm的氮激光)照射晶体时,基质分子吸收激光能量,样品解吸附,基质-样品之间发生电荷转移使样品分子电离。它从固相标本中产生离子,并在飞行管中测定其分子量,MALDI-TOF-MS一般用于肽质量指纹图谱,非常快速(每次分析只需3~5min),灵敏(达到fmol水平),可以精确测量肽段质量,但是如果在分析前不修饰肽段,MALDI-TOF-MS不能给出肽片段的序列。
蛋白质组学的重要应用领域有:在临床疾病中的应用、在微生物蛋白质组学中的应用、在植物研究中的应用、在肾脏病学领域的应用。我们通过研究蛋白质组,可以为患者提供有用的疾病诊断、预后评估信息;可以早期更为准确的诊断出胰腺病;也可以为AD的诊断、治理药物的设计和筛选奠定基础。这项研究技术其实离我们生活非常近,对我们生命而言尤为重要。近年来,高通量蛋白质分离与鉴定技术,如双向电泳、生物质谱、蛋白质芯片、酵母双杂交系统、生物信息学等相继建立并日趋完善,加速了蛋白质组学的发展。Label Free 非标记定量蛋白质组学技术处理步骤简单,成本低。
常规蛋白质组学:Labelfree多肽组学:顾名思义,就是不使用任何标记方法,直接对肽段进行质谱鉴定和定性定量分析。实验流程简单,只需要对蛋白进行常规酶解和除盐步骤即可上机。定量方式分为两种:峰面积(Peakintensity)和峰计数(Spectralcount),常用的是峰面积。不过,由于质谱采集时只选取topN的母离子进行二级碎裂和MS2检测,所以会丢失一些丰度较低的肽段信息,缺失值比较多。TMT/iTRAQ标记定量蛋白组学:TMT全称是TandemMassTag,是经典化学标记试剂,普遍用于差异表达蛋白质组分析研究中。该技术采用6重、10重或16重同位素标签,与肽段的氨基发生共价结合反应,可实现同时对6个/10个/16个不同样品中蛋白质的定性和定量分析。(目前16标鹿明生物可提供技术服务)。蛋白质组的概念指由一个基因组,或一个细胞、组织表达的所有蛋白质。哈尔滨4D定量蛋白质组学研究方法
DIA 定量蛋白质组学是高通量,能同时监测所有目标蛋白。江苏外泌体蛋白质组学应用
蛋白质组学技术:电喷雾质谱:ESI-MS是利用高电场使质谱进样端的毛细管柱流出的液滴带电,在N2气流的作用下,液滴溶剂蒸发,表面积缩小,表面电荷密度不断增加,直至产生的库仑力与液滴表面张力达到雷利极限,液滴爆裂为带电的子液滴,这一过程不断重复使液滴非常细小呈喷雾状,这时液滴表面的电场非常强大,使分析物离子化并以带单电荷或多电荷的离子形式进入质量分析器。ESI-MS从液相中产生离子,一般说来,肽段的混合物经过液相色谱分离后,经过偶联的与在线连接的离子阱质谱分析,给出肽片段的精确的氨基酸序列,但是分析时间一般较长。目前,许多实验室两种质谱方法连用,获得有意义的蛋白质的肽段序列,设计探针或引物来获得有意义的基因。随着蛋白质组研究的深入,又有多种新型质谱仪出现,主要是在上述质谱仪的基础上进行改进与重新组合。江苏外泌体蛋白质组学应用