非标定量法(Label-free)是通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的数量变化，认为肽段在质谱中被捕获检测的频率与其在混合物中的丰度成正相关，因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度，通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。按照其原理主要分为两种，第1种spectrumcounts类的非标记方法，发展比较早，已经形成多种定量算法，但是主要的原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础，各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。第二种非标记定量的原理是以MS1为基础，计算每个肽段的信号强度在LC-MS上的积分。Label Free 非标记定量蛋白质组学技术处理步骤简单，成本低。广东PRM定量蛋白质组学研究方法

蛋白质组学的分析介绍：蛋白质组学的分析主要指蛋白的生信分析，依赖于数据库的建立。现在常用的蛋白质组学生信分析有GO功能分析和KEGG通路分析。GO（gene ontology）是基因本体联合会（Gene Onotology Consortium）所建立的数据库。根据基因产物的相关分子功能、生物学途径、细胞组分而给予定义，无物种相关性。是系统分析基因功能，它将基因组的信息与基因功能联系起来，旨在揭示生命现象的遗传与化学蓝图。旨在借助计算机全方面地展示细胞和生物所包含的生物学信息；根据基因组中的信息，用计算机计算或者预测出比较复杂的细胞中的通路或者生物的复杂行为。武汉定量乙酰化蛋白质组学应用在当前的生物医学研究和临床诊断中，蛋白质组学相关技术有非常多的应用。

蛋白质组学在医学的研究应用：蛋白质组学(Proteomics)是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学。labelfree-非标定量法分析技术方法：非标定量法[Labelfree]是近年来重要的质谱定量方法，通过比较质谱分析次数或质谱峰强度，分析不同来源样品蛋白的数量变化。蛋白质非标记定量技术（LabelFree）是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析，无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准，只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据，比较不同样品中相应肽段的信号强度，从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。

蛋白质组学技术方法介绍：蛋白质组学技术方法：生物质谱：生物质谱技术是蛋白质组学研究中比较重要的鉴定技术，其基本原理是样品分子离子化后，根据不同离子之间的荷质比（M/E）的差异来分离并确定分子量。对于经过双向电泳分离的目标蛋白质用胰蛋白酶酶解（水解Lys或Arg的-C端形成的肽键）成肽段，对这些肽段用质谱进行鉴定与分析。目前常用的质谱包括两种：基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）和电喷雾质谱（ESI- MS）。蛋白质组学研究策略有什么？

PRM靶向蛋白质组学：是一种基于Orbitrap为表示的高分辨、高精度质谱的离子监视技术，首先利用四级杆质量分析器的选择能力，用Q1选择目标肽段的母离子，随后在collisioncell中对母离子进行碎裂，然后利用Orbitrap分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片信息。这样能够对目标蛋白质、目标肽段（如发生翻译后修饰的肽段）进行选择性检测，即可对目标蛋白质/肽段进行相对(一定)定量。随着质谱、系统生物学、生物信息学等相关学科的发展，我认为今后我们会更多地在现实生活中见到蛋白质组学相关的应用。如定量胰岛素、鉴定血红蛋白氨基酸突变（镰刀形红细胞症）、糖化血红蛋白比例测定等。从测试体量估计，应该远小于1%的ELISA测试量。蛋白质组学技术有生物质谱。深圳新型修饰蛋白组学质谱分析

蛋白质组学技术的发展已经成为现代的生物技术快速发展的重要支撑。广东PRM定量蛋白质组学研究方法

蛋白质组学技术：飞行时间质谱：MALDI的基本原理是将分析物分散在基质分子（尼古丁酸及其同系物）中并形成晶体，当用激光（337nm的氮激光）照射晶体时，基质分子吸收激光能量，样品解吸附，基质-样品之间发生电荷转移使样品分子电离。它从固相标本中产生离子，并在飞行管中测定其分子量，MALDI-TOF-MS一般用于肽质量指纹图谱，非常快速（每次分析只需3~5min），灵敏（达到fmol水平），可以精确测量肽段质量，但是如果在分析前不修饰肽段，MALDI-TOF-MS不能给出肽片段的序列。广东PRM定量蛋白质组学研究方法