什么是转录组学测序？转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的组合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的组合。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括mRNA和ncRNA。转录组具有时间特异性、组织特异性、空间特异性等特点。无参转录组和有参转录组的区别？如果所研究的物种有组装注释质量较好基因组序列，且和该基因组序列比对效率较高，那么可以采用有参转录组的分析策略，直接进行分析。反之，则需要按照无参转录组的分析策略进行转录本组装，构建unigene库，然后进行后续分析。circRNA主要存在于细胞质或外泌体中，具有组织特异性、疾病特异性、时序特异性及高稳定性等特征。南京全长转录学组方法

转录组是特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整转录信息的汇合，表示了基因表达的中间状态。转录组测序可以对所有转录物进行分类、确定基因的转录结构、量化转录物的表达水平。蛋白质是生命功能的直接执行者，蛋白组是一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。整合转录组学和蛋白质组学的表达数据对生物样本进行研究，可以从整体上解释生物学问题，探究生物体生理和疾病机理等。转录组学应用于胃肠瘤发生机制研究：利用转录组学可检测瘤细胞恶化过程中的RNA（编码RNA及非编码RNA）的变化，有助于更好地理解胃肠瘤的发生机制。武汉转录组学鉴定转录组学测序样品纯度要求，电泳检测28S:18S至少大于1.8。

宏转录组分析：从以G为单位的高通量测序数据中获取研究所需的微生物种类、基因、通路等信息是进行宏转录组研究必须经历的一步。现在网络上分析组学数据的工具五花八门。能否从众多组学工具中选择出适合分析宏转录组数据的软件，能否搭建一套完整、快速、高效、灵敏、高精确的宏转录组分析pipline，直接关乎到后期数据分析的进行。这种技术不只具有宏基因组技术的全部优点，可以检测环境中的活性微生物、活性转录本以及活性功能进行研究，还可以比较不同环境下的差异表达基因和差异功能途径，揭示微生物在不同环境压力下的适应机制，探索环境与微生物之间的互作机理。

转录组学测序比其他研究方法有哪些优势?（1）可以直接测定每个转录本片段序列、单核苷酸分辨率的准确度，同时不存在传统微阵列杂交的荧光模拟信号带来的交叉反应和背景噪音问题；（2）灵敏度高，可以检测细胞中少至几个拷贝的稀有转录本；（3）可以对任意物种进行全基因组分析，无需预先设计特异性探针，因此无需了解物种基因信息，能够直接对任何物种进行转录组分析，同时能够检测未知基因，发现新的转录本，并准确地识别可变剪切位点及cSNP，UTR区域。转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。

转录组测序推荐的测序数据量？转录组测序所需数据量与所研究物种的基因组大小有关，基因组越大，则所需数据量越大。按照我们的经验来说：常规物种一般建议6G数据即可；基因组较大的物种推荐8G以上数据，比如：小麦建议10G数据起，甘蔗、甘薯建议至少8G数据。转录组测序必须做生物学重复么？需要几个重复？生物学重复是生物实验所必须的，转录组测序也不例外，至少3 次生物学重复。准备生物重复样品时，通过对实验的预先设计和控制，尽可能将与实验处理无关的背景条件控制在同一水平，减少批次效应对结果的影响。转录学组测序可对任意物种的整体转录活动进行检测。广东全长转录学组服务

转录组学是研究细胞表型和功能的一个重要手段。南京全长转录学组方法

单细胞RNA-seq转录组学工作流程：单细胞RNA测序等高通量单细胞转录组学技术通常从针对不同瘤和组织类型（解离、分选和分离细胞等）量身定制的实验工作流程开始，然后产生可以比对的序列，量化、质量控制(QC)过滤和以不同方式标准化，以实现许多下游计算分析，例如聚类分析以识别转录不同的细胞类型和亚群，等位基因分析以识别单核苷酸变异（SNV，用星号表示）或拷贝数变体（CNV）、轨迹分析、剪接检测或瘤的微环境（TME）相互作用的推断中。单细胞转录组学数据的分析通常因精心设计的研究设计而变得复杂，这些设计可能包括来自患病和未患病个体的样本、在不同时间点（例如，诊疗前和诊疗后）收集的同一个人的多个样本，或来自表现出不同疾病状态的不同个体的多个样本。这样的研究设计可以发现患者共享的转录特征，这些特征可能定义疾病中常见的干扰分子途径。南京全长转录学组方法