定量蛋白质组学的方法学背景意义:从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究,识别功能模块和路径,监控疾病的生物标志物,这些研究都需要对蛋白质进行鉴定和定量。生物质谱技术的出现和不断成熟为蛋白质差异表达分析提供了更可靠、动态范围更广的研究手段。近两年来蛋白质组研究技术已被应用到各种生命科学领域。浙江蛋白质定量组学领域
定量蛋白质组学的方法学背景和意义:从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律(特别是疾病防治和病理研究)已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究,识别功能模块和路径,监控疾病的生物标志物,这些研究都需要对蛋白质进行鉴定和定量。生物质谱技术的出现和不断成熟为蛋白质差异表达分析提供了更可靠、动态范围更广的研究手段。基于质谱技术,科学家们不断开发出新的定量蛋白质组学方法,来了解细胞、组织或生物体的整体蛋白质动力学。浙江蛋白质定量组学领域蛋白质组学技术有飞行时间质谱。
蛋白质组(Proteome)的概念指由一个基因组(genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(Protein).蛋白质组的概念与基因组的概念有许多差别,它随着组织、甚至环境状态的不同而改变.在转录时,一个基因可以多种mRNA形式剪接,并且,同一蛋白可能以许多形式进行翻译后的修饰.故一个蛋白质组不是一个基因组的直接产物,蛋白质组中蛋白质的数目有时可以超过基因组的数目.蛋白质组学(Proteomics)处于早期“发育”状态,这个领域的**否认它是单纯的方法学,就像基因组学一样,不是一个封闭的、概念化的稳定的知识体系,而是一个领域.蛋白质组学集中于动态描述基因调节,对基因表达的蛋白质水平进行定量的测定,鉴定疾病、药物对生命过程的影响,以及解释基因表达调控的机制.作为一门科学。
蛋白组学技术:蛋白质组学研究的首要任务是建立获取和分析蛋白质的常规、可靠、有效的技术。为达到这一要求,就需要样品准备、数据获取标准化及自动化,也就是要有可重复的高通量的技术。蛋白质组学技术手段在不断完善,其工作流程,包括蛋白质样本的制备、分离、定量及鉴定。由双向凝胶电泳、质谱技术、酵母双杂交系统、蛋白质微阵列技术、能进行大规模数据处理的计算机系统和软件、软电离技术及生物信息学技术构成了蛋白质组学研究的主要技术体系。其中蛋白质组学技术中的质谱技术是现在比较常用的一种蛋白质鉴定技术。蛋白质组学包括翻译后的修饰。
Labelfree非标记定量蛋白质组学技术特点:(1)不需要标记处理,操作简单,成本低、实验周期短;(2)每个样品单独处理、上机;(3)可以做任意样本的总蛋白质差异定量,样品类型不受限制;(4)对单个样品的蛋白总量要求相对较低,对于组织本身蛋白量不高,可以选择Label-Free,适用于一些难收集样品;(5)定性没有问题,但是定量的准确性较标记定量稍差,会受到质谱稳定性等因素的影响;(6)适合于大样本量的定量比较(大于24个样本)。蛋白质组学在医学的研究应用:蛋白质组学(Proteomics)是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学。生物质谱技术是蛋白质组学研究中比较重要的鉴定技术。四川Label free非标记定量蛋白质组学质谱分析
蛋白质组学在医疗和健康方面有什么应用?浙江蛋白质定量组学领域
我们究竟怎么研究蛋白质组学呢?目前高通量检测蛋白质的方法中,还是首推基于质谱的方法,纳流液相可以将复杂样品中的肽段高效地分离,然后依次进入质谱,对每个被离子化的肽段及其碎裂后碎片的荷质比进行分析,从而得到该肽段的序列信息,然后根据对应的色谱峰面积或者报告离子强度等信息,我们又可以得到该肽段的定量信息。蛋白组学研究怎么做?当下蛋白组学研究中应用比较普遍的技术是同位素标记定量(iTRAQ/TMT技术)。iTRAQ/TMT技术是利用DDA扫描模式,其扫描的方式是将一级质谱信号比较强的Top20的多肽进行二级打碎,然后进入二级质谱进行检测。其优势是二级谱图采集的肽段信息都来源于同一条多肽,有利于后续的定性分析。浙江蛋白质定量组学领域