转录组学(transcriptomics)是功能基因组学(FunctionalGenomics)研究的重要组成部分,是一门在整体水平上研究细胞中所有基因转录及转录调控规律的学科。随着人类基因组计划HGP(HumanGenomeProject)的完成,科学家也逐渐认识到对基因结构序列的研究只是基因组学研究的一部分,并不能揭示所有的生命奥秘,所以接下来需要解决的问题是:研究这些基因序列的功能、参与的生命过程、表达调控方式,以及这些基因在不同的时空条件下的表达差异等。这些问题都需要功能基因组学技术来解决,而转录组学技术是功能基因组学研究的重要组成部分。对基因及其转录表达产物功能研究的功能基因组学,将为疾病控制和新药开发、作物和畜禽品种的改良提供新思路,为人类解决健康问题、食物问题、能源问题和环境问题提供新方法。转录学组测序能够提供更准确的数字化信号。广州转录组学领域
普通转录组学测序适用于哪些情况?普通转录组测序主要适用于两大类:一是不同的生长阶段或者发育过程;二是不同的环境、药物、病原菌等逆境胁迫处理。转录组学测序必须做生物学重复么?需要几个重复?生物学重复是生物实验所必须的,转录组测序也不例外,至少3次生物学重复。准备生物重复样品时,通过对实验的预先设计和控制,尽可能将与实验处理无关的背景条件控制在同一水平,减少批次效应对结果的影响。转录组学测序可以同时测到mRNA、lncRNA、micRNA以及circRNA么?我们通常所讲的转录组测序只能测到mRNA。但是全转录组测序通过构建两个测序文库(一是小RNA测序文库、二是lncRNA测序文库)是可以测到以上4种RNA的。杭州circ RNA转录组学分析转录组学是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。
转录组学,基因组学,蛋白质组学的区别:蛋白组学针对的是全体蛋白,组要以2D-Gel和质谱为主,分为top-down和bottom-up分析方法。理念和基因组类似,将蛋白用特定的物料化学手段分解成小肽段,在通过质量反推蛋白序列,之后进行搜索,标识已知未知的蛋白序列。转录组学研究的是某个时间点的mRNA总和,可以用芯片,也可以用测序。芯片是用已知的基因探针,测序则有可能发现新的mRNA。基因组学研究的主要是基因组DNA,使用方法目前以二代测序为主,将基因组拆成小片段后再用生物信息学算法进行迭代组装。当然这只是第1步,随后还有繁琐的基因注释等数据分析工作。
宏转录组学适用范围包括人体微生态、环境、工业、农业等领域。宏转录组学以生态环境中的全部RNA为研究对象,避开了微生物分离培养困难的问题,能有效的扩展微生物资源的利用空间。应用领域:包括肠道微生物、口腔微生物、粪便微生物、人体组织微生物。宏转录学组的概念:宏转录组是特定时期、环境样本、组织样本中所有的微生物的RNA(转录本)的汇合。通过对这些转录本进行大规模高通量测序,可以直接获得环境中可培养和不可培养的微生物转录组信息。转录组学为什么原核物种只能做有参转录组分析?
单细胞转录组学技术:单细胞转录组目前主要有三种方法:SMART扩增技术、10×genomics技术及Andeplete技术。SMART扩增技术比较关键的技术,就是设计了2个特殊的引物。再配合用MMLV逆转录酶进行逆转录。特殊引物1由中间PolyT序列加上一段通用序列及3’末端两个简并碱基构成,但在PolyT的3’端倒数第二个碱基是A、C、G而非T的简并碱基,而倒数第1个为简并碱基,这样做的好处是让它正好结合在mRNA的3’端连到Poly(A)尾巴的这个连接处,而不会结合到mRNA的别的地方。这样就保证了逆转录的起始位置正好是mRNA的3’端的序列终止位置。转录学组测序能够提供更高的检测通量。南京circ RNA转录组学检测多少钱
转录组学可应用于植物生长机制的发现及干预。广州转录组学领域
什么叫转录组转录组学?1、转录组,广义上指某一生理条件下,细胞内所有转录产物的组合,包括信使RNA、核糖体RNA、转运RNA及非编码RNA;狭义上指所有mRNA的组合。2、转录组学,是指一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。以DNA为模板合成RNA的转录过程是基因表达的第一步,也是基因表达调控的关键环节。广州转录组学领域