蛋白质翻译后修饰组学技术原理:首先将蛋白样本酶解成肽段混合物,然后使用液相色谱对酶解后的肽段混合物进行组分分离以降低样本复杂程度,然后通过高质量的修饰类抗体和生物材料对修饰肽段进行富集,之后上样至液相色谱 - 串联质谱中进行分析,通过相应的数据库检索匹配,一次可鉴定成百上千个修饰位点。蛋白质磷酸化位点分析样品经酶解后,用 TiO2 微球对磷酸化肽段进行富集,富集后的产物由质谱分析,并通过软件完成数据检索。琥珀酰化修饰蛋白质组技术特点:采用主流抗体亲和富集方法,特异性高,富集效率好。在细胞中,乙酰化修饰的反应由乙酰基转移酶所催化,将乙酰辅酶A的乙酰基转移并添加在蛋白质赖氨酸残基上。济南亚硝基化修饰蛋白质组学
蛋白质学组翻译后修饰分析自中而下分析策略:自中而下的蛋白质组学技术可用于组蛋白修饰的分析。样品制备与普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到纯化的组蛋白。提取组蛋白后,用GluC进行消化。然后用弱阳离子交换/亲水相互作用色谱(WCX-HILIC)与配备电子转移解离(ETD)的高分辨率质谱联机联用,对样品进行理想的分离。谱识别可以用传统的软件进行,但是由于估计适当的错误发现率的问题,需要对结果进行过滤。自上而下的技术可以直接引入完整的蛋白质并在串联质谱仪上对其进行片段化,不需要蛋白质水解消化。目前,有两种完全分离蛋白质的方法:离线和在线。前者用四维分离法,后者用WCX-HILIC。江苏蛋白质翻译后修饰组学服务各种蛋白质翻译后修饰在信号通路和网络中发挥着重要的作用。
翻译后修饰蛋白组学分析:蛋白质组学的研究的工作不只聚焦于细胞不同生长时期或是疾病条件下的蛋白质表达水平变化,许多至关重要的生命进程不只由蛋白质相对丰度控制,更重要的是被时空特异分布的、可逆的翻译后修饰所调控,因而揭示翻译后修饰发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。蛋白质发生翻译后修饰时其分子质量会发生响应的改变,通过质谱能够精确测定蛋白质或多肽的分子质量。同时,发生翻译后修饰的蛋白质再样本中含量低且动态范围广,所以在质谱检测前需要对发生修饰的蛋白质或肽段进行富集。
蛋白质糖基化修饰组学技术服务:糖基化是在酶的控制下,蛋白质或脂质附加上糖类的过程,发生于内质网和高尔基体等部位。在糖基转移酶作用下将糖转移至蛋白质,和蛋白质上的氨基酸残基共价结合。蛋白质经过糖基化作用,形成糖蛋白。糖基化是对蛋白的重要的修饰作用,有调节蛋白质功能作用。凝素亲和法是目前糖蛋白质组学中应用比较普遍的分离富集方法。凝集素(lectin)是一类糖结合蛋白质,能专一识别某一特殊结构的单糖或聚糖中特定的糖基序列而与之结合,它们与糖链可逆非共价结合,糖蛋白或糖肽被凝集素捕获之后,通常用特定的单糖通过竞争结合凝集素将糖蛋白或糖肽洗脱下来。蛋白质的翻译后修饰过程极其复杂。
蛋白质磷酸化修饰组学技术优点:1、全方面性:磷酸化蛋白质组学以整个细胞蛋白为研究对象,研究内容包括了细胞内具有生命功能的蛋白,如细胞增生、细胞分裂和细胞分化等相关蛋白,因而研究更为全方面。2、可靠性:传统的生物学研究蛋白质磷酸化往往针对特定条件,以两个蛋白或更多蛋白之间的相互作用为出发点,具有局限性,缺乏整体认识。磷酸化蛋白质组学则可检测不同蛋白激酶及磷酸化酶对同一个蛋白磷酸化程度的影响,因而结果具有普遍性和可靠性。3、有效性:磷酸化蛋白质组学反映的是细胞内真实发生的事件,在一次试验中考虑了不同变量,克服了生物学中逐步添加变量的缺陷。4、探索性:磷酸化蛋白质组学以细胞内蛋白为研究对象,相对于传统的生物学研究以及蛋白质芯片,更易发现未知的新磷酸化位点和磷酸化蛋白质。如果可以联合生物学技术,则可以发现具有磷酸化或者去磷酸化功能的酶。蛋白质的翻译后修饰通过可逆的共价键将小分子或蛋白质与底物蛋白质上特定的氨基酸结合。河南棕榈酰化修饰蛋白质组学分析方法
常见的蛋白质翻译后修饰包括泛素化。济南亚硝基化修饰蛋白质组学
磷酸化修饰蛋白质组学:磷酸化修饰蛋白质组的研究主要集中于真核生物中普遍存在的丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸的磷酸化。由于体内磷酸化蛋白的含量很低,因此在分析前必须对其进行分离和富集。目前,常用的磷酸化蛋白质的分离和富集技术包括固定化金属亲和色谱、免疫沉淀、强阳离子交换色谱、强阴离子交换色谱、反相色谱等。这些技术被整合和优化用于不同生物样品的磷酸化蛋白质组分析。翻译后修饰分析自中而下分析策略:自中而下的蛋白质组学技术可用于组蛋白修饰的分析。样品制备与普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到纯化的组蛋白。提取组蛋白后,用GluC进行消化。然后用弱阳离子交换/亲水相互作用色谱与配备电子转移解离(的高分辨率质谱联机联用,对样品进行理想的分离。谱识别可以用传统的软件进行,但是由于估计适当的错误发现率的问题,需要对结果进行过滤。济南亚硝基化修饰蛋白质组学