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四川蛋白质翻译后修饰组学一般流程

来源: 发布时间:2022-04-04

质谱分析蛋白翻译后修饰:相对于蛋白质印迹等技术,质谱技术能更有效的对蛋白质的翻译后修饰进行分析,且可以对常规的Western blot 翻译后修饰蛋白鉴定进行补充。质谱分析蛋白翻译后修饰一般使用自下而上的基于肽段的方法。但是自下而上的质谱方法无法保证可以完全识别目的蛋白的特定翻译后修饰,因为质谱是通过蛋白质序列内的多个肽段来鉴定的,这很大程度上降低了翻译后修饰肽段被识别的机会。一种提高质谱仪检测到修饰肽段数量的策略是使用PTM亲和试剂进行肽段富集,而不是使用PTM亲和试剂进行蛋白富集,这将减少富集的未修饰肽段的数量。蛋白质磷酸化修饰组学具有全方面性。四川蛋白质翻译后修饰组学一般流程

蛋白翻译后修饰组学技术在准确医学中的应用:尽管目前大数据的获得会采用基因组学和转录组学,但是关键的发现还是依赖蛋白质组数据而得到的。近来越来越多的研究表明蛋白组学驱动的准确的医学具有极大的实用性和普适性,蛋白组学的研究更加速了临床转化的进程。蛋白翻译后修饰(post-ranslational modification, PTM)赋予了蛋白种类的丰富性及蛋白功能的多样化,研究蛋白翻译后修饰不只可以确定蛋白修饰(磷酸化、泛素化、酰化、甲基化、SUMO化等)或蛋白酶裂解的新位点,还可以发现生物标记物及探索药物/化学调节物的作用机制。南京蛋白质丙酰化修饰组学价钱质谱是蛋白质翻译后修饰检测的常用技术之一。

蛋白质学组翻译后修饰的研究策略:自中而下:自中而下的分析方法是自下而上分析方法的一种替代方法,分析组蛋白时其原理类似于自下而上分析策略。在使用这种分析方法时,通常需要将被检测蛋白质消化成3-9kDa范围内的肽段,因此也无法保证检测到的肽段的完整性。但是,由于仪器的进步和保留了组蛋白尾部的组合修饰,自中而下分析法正逐渐受到欢迎。自中而下更接近于自下而上法的灵敏度。自上而下:自上而下技术可以直接对完整的蛋白质进行测序,包括翻译后修饰的蛋白质和其他大的蛋白质片段,而不只是肽段。这可以比较大程度地保留与PTMs相关的信息,使其适用于组蛋白的全方面表征和分析。自上而下技术对蛋白质的有效分辨率已达到229kDa,一次可以检测到的蛋白质数量也在增加。

蛋白质-蛋白质相互作用是蛋白质发挥功能的主要机制之一,在DNA损伤修复,自噬和代谢等过程中都扮演着非常重要的角色,蛋白相互作用异常便会导致疾病的发生.在蛋白质的赖氨酸,丝氨酸和苏氨酸等氨基酸残基上,可发生甲基化,乙酰化,磷酸化和泛素化等200多种翻译后修饰,这些修饰通常能改变蛋白质的电性,疏水性和空间结构等属性,为与之结合的蛋白提供结合的锚定或产生位阻效应,像一把开关在时空上精确调控蛋白质-蛋白质相互作用的发生以及动态变化.结构研究表明,蛋白质之间的相互作用通常由临近的几个氨基酸残基直接结合,替换该区域的氨基酸残基,通常能破坏结合,使其失去部分功能或酶活性,可以针对性地开发和设计抑制剂,用于疾病的诊疗。通过蛋白质翻译后修饰也进一步增加了细胞通路机制和生命活动的多样性和复杂性。

蛋白质翻译后修饰的检测方法:质谱是蛋白质翻译后修饰检测的常用技术之一,可以用于已知和未知的翻译后修饰检测。蛋白质翻译后修饰(post-translational modifications,PTMs),如磷酸化、乙酰化、泛素化、SUMO化、糖基化等,大幅度的增加了蛋白质组的复杂性。检测蛋白质的翻译后修饰,了解它们如何工作、影响蛋白质组和调控基因组将极大地提高我们对遗传学和表观遗传学的理解。目标蛋白的PTMs研究通常需要一个富集步骤,因为修饰蛋白的丰度一般较低。大多数PTMs检测方法都是结合富集策略开发的,以比较好的识别、验证和研究目标蛋白中PTMs的功能。自中而下的蛋白质组学技术可用于组蛋白修饰的分析。湖北蛋白质糖基化修饰组学分析

蛋白质的磷酸化修饰是生物体内重要的共价修饰方式之一。四川蛋白质翻译后修饰组学一般流程

蛋白质乙酰化修饰组学技术:乙酰化修饰是体内保守的可逆转的蛋白修饰,对细胞核内转录调控因子的刺激有着重要的作用。此外,还存在的非组蛋白乙酰化修饰参与了代谢通路及代谢酶活性的调节。采用肽段预分离降低高丰度组蛋白对蛋白乙酰化鉴定的影响,再结合免疫共沉淀通过抗体富集乙酰化的肽段,从而实现乙酰化的鉴定及定量。样品要求:1、SDS-PAGE条带:5个以上可见考染条带。2、溶液(目标蛋白质):目标蛋白总量>50μg,目标蛋白浓度>80%。3、溶液(大规模混合蛋白质):蛋白总量>1mg,蛋白浓度>1μg/μl。四川蛋白质翻译后修饰组学一般流程

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