蛋白质组学在医疗和健康方面有什么应用?基于质谱的蛋白质组学是目前比较主流的高通量蛋白质研究手段,当前在医疗健康方面的应用主要集中于基础研究和转化医学。随着质谱、系统生物学、生物信息学等相关学科的发展,我认为今后我们会更多地在现实生活中见到蛋白质组学相关的应用。如定量胰岛素、鉴定血红蛋白氨基酸突变(镰刀形红细胞症)、糖化血红蛋白比例测定等。从测试体量估计,应该远小于1%的ELISA测试量。由于成本和通量等原因,蛋白质组学技术并不如ELISA适合大量的日常分析。但对于一些分析有问题的项目,采用基于质谱(或二维胶等手段)的蛋白质组学有独特的技术优势。另外,蛋白质组学方法开发和验证周期短,在中高级特殊应用(如极少使用的特殊蛋白指标临床检测、未知疾病研究和控制)中也有其独特优势。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析,我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”。深圳医学蛋白质组学质谱分析
蛋白质组学技术:等电聚焦:等电聚焦(isoelectricfocusing,IEF)是一种利用有pH梯度的介质分离等电点不同的蛋白质的电泳技术。等电聚焦凝胶电泳依据蛋白质分子的静电荷或等电点进行分离,等电聚焦中,蛋白质分子在含有载体两性电解质形成的一个连续而稳定的线性pH梯度中电泳。载体两性电解质是脂肪族多氨基多羧酸,在电场中形成正极为酸性,负极为碱性的连续的pH梯度。蛋白质分子在偏离其等电点的pH条件下带有电荷,因此可以在电场中移动;当蛋白质迁移至其等电点位置时,其静电荷数为零,在电场中不再移动,据此将蛋白质分离。上海新型修饰蛋白组学领域蛋白质组学技术有生物质谱。
LabelFree(非标记蛋白质组学技术):应用:1.需要快速在大量样本中找到差异表达的蛋白组合。2.需要在较短时间以较低成本得到具有提示意义的蛋白表达数据。3.需要检测的样品蛋白含量低。4.需要检测相互作用蛋白。技术特点:1.对质谱仪器设备要求较高,色谱和质谱需要同时有较好的稳定性和重复性。2.需要有特殊的定量分析软件。3.对样品中蛋白质总量要求较低,实验周期短,实验费用低。4.不需要额外并且昂贵的标记试剂,排除了标记过程带入实验误差的风险,同时也不必考虑标记效率的问题。
蛋白质组的研究不但能为生命活动规律提供物质基础,也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析,我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”,它们可成为新药物设计的分子靶点,或者也会为疾病的早期诊断提供分子标志。确实,那些世界范围内销路比较好的药物本身是蛋白质或其作用靶点为某种蛋白质分子。因此,蛋白质组学研究不只是探索生命奥秘的必须工作,也能为人类健康事业带来巨大的利益。蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征。质谱技术相较于传统蛋白质鉴定技术而言,拥有灵敏、准确、高通量、自动化等特点。
蛋白质组学发展趋势:技术发展方面:蛋白质组学的研究方法将出现多种技术并存,各有优势和的特点,而难以象基因组研究一样形成比较一致的方法。除了发展新方法外,更强调各种方法间的整合和互补,以适应不同蛋白质的不同特征。另外,蛋白质组学与其它学科的交叉也将日益明显和重要,这种交叉是新技术新方法的活水之源,特别是,蛋白质组学与其它大规模科学如基因组学,生物信息学等领域的交叉,构成组学(omics)生物技术研究方法,所呈现出的系统生物学(SystemBiology)研究模式,将成为未来生命科学比较令人激动的新前沿。蛋白质组与基因组相对应,也是一个整体的概念。Label free非标记定量蛋白质组学价格
蛋白质组随着基因组学研究的不断深入,蛋白质组学已逐渐成为研究热点。深圳医学蛋白质组学质谱分析
LabelFree(非标记蛋白质组学技术):在非标记策略的定量模型中,主要涉及两种不同的算法:其一,以肽段的色谱峰积分面积为基础,通过比较一对生物样品中相对应到蛋白质酶解多肽的色谱积分面积而得到两者的相对丰度;其二,以肽段被质谱检测的计数为基础,通过归一化来表征被检测蛋白质的相对丰度。非标记技术认为肽段在质谱中被捕获检测的频率(Counts)与其在混合物中的丰度成正相关,因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度,通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来,从而对蛋白质进行定量。深圳医学蛋白质组学质谱分析
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