转录组学测序结果的影响因素？RNA的降解严重影响测序的质量，RNA降解后，加入poly-A后无法捕获纯化mRNA，因此，随机引物反转录无法得到全部的cDNA，导致测序结果出现明显的3‘-和5’-偏向。文库中的poly-A多聚物的存在会对测序信号产生干扰，影响测序结果的准确性；同时由于转录组中转录本的丰度不一致，实验前需要对样本进行均一化处理，否则高丰度的表达基因会掩盖低丰度表达基因，导致寻找新基因失败或者是获得大量无意义的重复序列。转录组学包括：mRNA、ncRNA、rRNA等。江苏RNA转录组学主要技术

转录组学：转录组学是研究特定的细胞、组织或个体在特定时间和状态下所转录出所有RNA的学科，转录组测序是指利用高通量测序方法，研究特定的细胞、组织或个体在特定时间和状态下所转录出的所有mRNA，用于揭示不同功能状态下的基因表达、结构的差异，阐明分子机制。应用领域：医学研究：疾病标志物筛查、疾病的诊断和分型、疾病复发诊断、病因与病理机制探究、临床疗效评价、药物毒理学评价。生命科学研究：非生物环境关系研究、植物与微生物、在表型鉴定中的应用、代谢途径及功能基因组研究、药用植物研究中的应用。全转录学组研究转录学组测序可对任意物种的整体转录活动进行检测。

宏转录学组的概念：宏转录组是特定时期、环境样本、组织样本中所有的微生物的RNA（转录本）的汇合。通过对这些转录本进行大规模高通量测序，可以直接获得环境中可培养和不可培养的微生物转录组信息。这种技术不只具有宏基因组技术的全部优点，可以检测环境中的活性微生物、活性转录本以及活性功能进行研究，还可以比较不同环境下的差异表达基因和差异功能途径，揭示微生物在不同环境压力下的适应机制，探索环境与微生物之间的互作机理。

转录组学技术：转录组学（transcriptomics），是一门在整体水平上研究细胞中基因转录的情况及转录调控规律的学科。简而言之，转录组学是从RNA水平研究基因表达的情况。转录组即一个活细胞所能转录出来的所有RNA的总和，是研究细胞表型和功能的一个重要手段。优势：高通量、更精确的数字信号；在单核苷酸水平对任意物种的整体转录活动进行检测；分析转录本的结构和表达水平的同时，还能发现未知转录本和稀有转录本；准确地识别可变剪切和融合基因。应用方向：植物生长机制的发现及干预；炎症发生机制的发现及干预；表达差异的研究；基因点突变及多态性检测。转录组学分析转录本的结构和表达水平的同时，还能发现未知转录本和稀有转录本。

什么是转录组学测序？转录组广义上指在某一生理条件下，细胞内所有转录组产物的组合，包括：mRNA、ncRNA、rRNA等；狭义上指所有mRNA的组合。转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA的总和，主要包括mRNA和ncRNA。转录组具有时间特异性、组织特异性、空间特异性等特点。无参转录组和有参转录组的区别？如果所研究的物种有组装注释质量较好基因组序列，且和该基因组序列比对效率较高，那么可以采用有参转录组的分析策略，直接进行分析。反之，则需要按照无参转录组的分析策略进行转录本组装，构建unigene库，然后进行后续分析。转录组学有高通量、更精确的数字信号。深圳单细胞转录组学质谱鉴定

相对于传统的芯片杂交平台，转录学组测序无需预先针对已知序列设计探针。江苏RNA转录组学主要技术

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