代谢组学介绍:通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有明显变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大多是分子量1500Da以内的小分子物质。技术优势:较高的灵敏度、分辨率;较宽的动态范围;适合对标本中未知代谢物的探索研究;适合于生物样本中复杂代谢产物的检测和潜在标志物的鉴定。代谢组学应用方向: 土壤代谢组学。研究土壤中有机质及土壤微生物代谢含量变化及相互作用,了解土壤微生物多样性及其碳代谢能力,为探索调节、控制和改善土壤环境质量提供重要的参考。靶向代谢组学(Trgeted metabolomics)则为目标性代谢组学。贵阳脂质代谢组学多技术服务
代谢组学样品收集方法及所需样本量是什么?(1) 血清样品: 避免反复冻融。血液收集在离心管中静置30分钟进行凝血。8000rpm离心10分钟,取上清分装到冻存管中,放置液氮中或-80度冻存;单个样本要求体积为50μL。(2) 尿液样品:临床样本请全部取清晨第1次尿液。尿液直接分装到离心管中,8000rpm离心10分钟,取上清分装到冻存管中,放置液氮中或-80度冻存,-80度冻存;单个样本要求体积为100μL。(3) 其他样本收集办法请咨询谱领工作人员。南京代谢组学质谱鉴定代谢组学在生物信息的传递中起到承上启下的作用。
代谢组学比较常用到的数据分析方法:代谢组学分析数据用于统计分析时,数据集通常为一个N × K的矩阵(X矩阵),N表示N个样本数,每一行表示一个样品, K表示K个变量,每一列表示一个变量,在代谢组学中变量通常是指代谢物含量。单变量分析方法只分别分析单个变量,不考虑多个变量的相互作用与内在联系。具有简单性、易应用性和可解释性。但是无法基于整体数据对所测样品的优劣、差异进行综合评价和分析。差异倍数变化大小(Fold Change,FC)表示实验组与对照组的含量比值,可以快速考察各个代谢物在不同组别之间的含量变化大小。
代谢组学样本收集注意事项:(1)血液离开动物或人体后,应尽快开展血清、血浆的分离,并严格按照操作说明进行。(2)采集到的血清为黄色透明液体、血浆为淡黄色半透明液体,如果发现样本中是红色,说明在已经发生了了溶血现象,样本需重新制备。(3)血清与血浆的主要区别在于血清中不含纤维蛋白原。血清和血浆中脂质,氨基酸,核苷酸等代谢谱存在差别。粪便样本收集:1.人粪便:(1)用无菌勺挖取新鲜的,排泄中后部的内侧粪便(避免尿液及其他壁对样本污染);(2)分装样本20mg/管。(3)迅速放入液氮中冷冻处理至少15min.(4)-80℃冰箱冻存。寄样需足量干冰。代谢组学主要技术手段是色谱(HPLC,GC)。
代谢组学样本收集植物组织:果实、种子:1)对于含水量高、体积较大的果实(番茄、西瓜、苹果等)需要先将样品分成“均匀”的小块(≈ 200 mg/样本)分装至2 mL离心管中,标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。2)对于细小的颗粒种子(拟南芥种子、谷物种子等),可以先将同一组的植株种子混匀后再分装(≈ 200 mg/样本)至离心管中,标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。3)对于要求对整个果实进行提取的(整粒葡萄等),需要把果实装在50 mL离心管/自封袋中,标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15min,-80 ℃冻存,干冰寄送。代谢组学着重研究的是生物整体、组织代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。贵州常规靶向代谢组学鉴定
代谢组学技术得到了迅速发展。贵阳脂质代谢组学多技术服务
代谢组学疾病诊断应用:与基因组学和蛋白质组学相比, 代谢组学的研究侧重于相关特定组分的共性,是要涉及研究每一个代谢组分的共性、特性和规律,目前据此目标相距甚远。尽管充满了挑战,研究人员仍然坚信,与基因组学和蛋白质组学相比,代谢组学与生理学的联系更加紧密。疾病导致机体病理生理过程变化,引起代谢产物发生相应的改变,通过对某些代谢产物进行分析,并与 正常人的代谢产物比较,寻找疾病的生物标记物,将提供一种较好的疾病诊断方法。贵阳脂质代谢组学多技术服务
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