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深圳农学靶向代谢组学技术

来源: 发布时间:2022-03-27

代谢组学在系统生物学中有什么作用?它的地位如何?代谢物作为生物体表型的基础能够帮助我们更直观有效地了解生命现象揭示生命本质。代谢组学本质上是指从整体上研究生物体的代谢物,是对某一生物、组织或细胞中的所有低分子量代谢产物进行定性与定量分析的一门科学。代谢组学以指标分析为基础,高通量检测为手段,通过研究生物体内代谢物的种类与数量及其变化规律来阐述机体在正常生命状态及环境变化后的代谢过程。代谢组是系统生物学的分支学科之一。其研究内容主要包括对代谢物进行定性或定量分析,不同基因型的生物体进行代谢组学表型研究,不同生长环境及加物理、化学或生物性刺激后个体代谢产物的应答,进行代谢途径或代谢网络解析与转基因评价。非靶向代谢组学无偏向性地对所有小分子代谢物(一般相对分子量小于1000)。深圳农学靶向代谢组学技术

代谢组学样本收集注意事项:1.对于动物组织样本无法满足50mg/样,如海马组织,大脑组织等,可考虑同组混样以达到50mg/样的要求。2.对于含水量高的果实进行取样很难保持高度均一性(如番茄的果皮、果肉等),建议将整个果实进行液氮研磨后冻干混匀,对混匀后的粉末进行称重分装,冻存。3.尽量不要使用锡箔纸以及自封袋包装样本,建议将样本液氮研磨后使用离心管/冻存管进行分装。4.在使用PBS缓冲液/超纯水进行漂洗时,需要尽快处理。5.植物各类组织样本建议都使用超纯水进行漂洗完之后,再研磨分装冻存,防止因种植过程中施加的一些肥料、农药等含有表面活性剂或其他杂质,对后续实验造成影响。武汉动物靶向代谢组学分析方法代谢组学作为系统生物学的一个重要的分支,与其他组学相比有着其特有的优势。

代谢组学有哪些特点?(1) 代谢处于系统生物学的末端,更能反映基因与外部环境互作的真实情况,因此,在多数生物表型研究上更加适用。(2) 常规代谢组学只关注内源性化合物,也有使用代谢组学技术测定外源性化合物的。内源性化合物的上调和下调指示了与疾病、毒性、基因修饰或环境因子的影响。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 内源性化合物的结果可以作为疾病的诊断、药物筛选或者其他分型评估等潜在生物标志物。谢组学通过揭示内在和外在因素影响下,生物体的代谢整体的变化轨迹来反映某种生理或病理的一系列发展过程。

什么是代谢组学?代谢组学是用来解决什么问题的?代谢组学(Metabonomics/Metabolomics)是发展起来的一门新兴学科,是研究关于生物体被扰动后(如基因的改变或环境变化后)其代谢产物(内源性代谢物质)种类、数量及其变化规律的科学。代谢组学着重研究的是生物整体、组织的内源性代谢物质的代谢途径及其所受内在或者外在因素的影响及随时间变化的规律。代谢组学通过揭示内在和外在因素影响下代谢整体的变化轨迹来反映某种病理生理过程中所发生的一系列生物事件。代谢组学先进分析检测技术结合模式识别和**系统等计算分析方法是代谢组学研究的基本方法。

靶向代谢组学的一般分析流程为:1. 数据采集 第1步是得到标准品。如果无法从市场上买到,就必须定制合成。然后通过优化产物离子碰撞能量以得到的信号,再通过测定三重串联四极杆测定代谢物的 MRM 跃迁值。2. 定量 接下来用定量分析软件对 MRM 数据进行处理,得到报告。3. 统计分析和解释 将定量报告输入统计分析软件包,用统计工具,如ANOVA,对数据进行处理。靶向分析:在基于质谱的代谢组学分析中,要意识到离子强度和色谱保留时间都会随着时间的推移而产生漂移,所以在实验中,要按随机顺序对样本进行检测,且数据需要在同天同一批次进行采集,以减少误差。代谢组学与临床化学较为相似。武汉动物靶向代谢组学分析方法

代谢组学主要研究的是产物的小分子代谢物(MW<1000)。深圳农学靶向代谢组学技术

代谢组学概念:基因与蛋白质的表达紧密相连,而代谢物则更多地反映了细胞所处的环境,这又与细胞的营养状态,药物和环境污染物的作用,以及其它外界因素的影响密切相关。因此有人认为,“基因组学和蛋白质组学告诉你什么可能会发生,而代谢组学则告诉你什么确实发生了。”代谢组学的概念来源于代谢组,代谢组是指某一生物或细胞在一特定生理时期内所有的低分子量代谢产物,代谢组学则是对某一生物或细胞在一特定生理时期内所有低分子量代谢产物同时进行定性和定量分析的一门新学科。它是以组群指标分析为基础,以高通量检测和数据处理为手段,以信息建模与系统整合为目标的系统生物学的一个分支。深圳农学靶向代谢组学技术

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