代谢组学比较常用到的数据分析方法：代谢组学分析数据用于统计分析时，数据集通常为一个N × K的矩阵（X矩阵），N表示N个样本数，每一行表示一个样品， K表示K个变量，每一列表示一个变量，在代谢组学中变量通常是指代谢物含量。单变量分析方法只分别分析单个变量，不考虑多个变量的相互作用与内在联系。具有简单性、易应用性和可解释性。但是无法基于整体数据对所测样品的优劣、差异进行综合评价和分析。差异倍数变化大小（Fold Change，FC）表示实验组与对照组的含量比值，可以快速考察各个代谢物在不同组别之间的含量变化大小。相比于其他组学，代谢组学有哪些特殊的优势？深圳靶向代谢组学服务

代谢组学细胞样本收集：悬浮细胞：1）连同培养基转移到1.5 mL的进口离心管中。2）低速离心5 min（低于3000 rpm），使细胞沉淀于离心管的底部（1*107个细胞为宜）。3）倒掉培养基（尽量倒干净），用预冷的PBS反复冲洗2 ~ 3次，低速离心5 min，弃上清。4）标记离心管，将离心管的尖的一端插入液氮中，淬灭细胞沉淀1 min，-80 ℃冻存，干冰寄送。注意事项：1. 培养基倾倒时尽量倒干净，可使用滤纸将残留培养液吸净；2. 甲醇/水请使用色谱纯及以上规格；3. 液氮淬灭细胞时，请小心避免离心管破碎导致样本受损;4. 建议细胞样本在进行培养时多准备样本，以备后续使用。深圳靶向代谢组学服务在食品安全领域，利用代谢组学工具发现农兽药等在动植物体内的相关生物标志物也是一个热点领域。

代谢组学有哪些特点？(1) 代谢处于系统生物学的末端，更能反映基因与外部环境互作的真实情况，因此，在多数生物表型研究上更加适用。(2) 常规代谢组学只关注内源性化合物，也有使用代谢组学技术测定外源性化合物的。内源性化合物的上调和下调指示了与疾病、毒性、基因修饰或环境因子的影响。(3) 高通量定量和定性研究生物小分子化合物。(4) 内源性化合物的结果可以作为疾病的诊断、药物筛选或者其他分型评估等潜在生物标志物。谢组学通过揭示内在和外在因素影响下，生物体的代谢整体的变化轨迹来反映某种生理或病理的一系列发展过程。

代谢组学研究方法：代谢组学的研究方法与蛋白质组学的方法类似，通常有两种方法。一种方法称作代谢物指纹分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色谱-质谱联用（LC-MS）的方法，比较不同血样中各自的代谢产物以确定其中所有的代谢产物。从本质上来说，代谢指纹分析涉及比较不同个体中代谢产物的质谱峰，然后了解不同化合物的结构，建立一套完备的识别这些不同化合物特征的分析方法。另一种方法是代谢轮廓分析（metabolomic profiling）,研究人员假定了一条特定的代谢途径，并对此进行更深入的研究。代谢组学的代谢物的种类要远小于基因和蛋白的数目。

代谢组学样本收集植物组织：果实、种子：1）对于含水量高、体积较大的果实（番茄、西瓜、苹果等）需要先将样品分成“均匀”的小块(≈ 200 mg/样本)分装至2 mL离心管中，标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。2）对于细小的颗粒种子(拟南芥种子、谷物种子等)，可以先将同一组的植株种子混匀后再分装(≈ 200 mg/样本)至离心管中，标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15 min。3）对于要求对整个果实进行提取的（整粒葡萄等），需要把果实装在50 mL离心管/自封袋中，标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少15min，-80 ℃冻存，干冰寄送。代谢组学主要研究的是各种代谢路径的底物。深圳靶向代谢组学服务

代谢组学的代谢产物是基因表达的产物。深圳靶向代谢组学服务

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