蛋白质组学主要以全蛋白组（组织、细胞）、线粒体蛋白组、叶绿体蛋白组和外泌体蛋白组为研究对象，通过对蛋白组进行定性、定量、分子功能分析、通路互作分析和蛋白互作分析，揭示生物学功能、作用机制、疾病诊断的标志物以及预测蛋白的上、下游变化关系。蛋白质组学可以克服核酸水平预测的不确定性、反映核酸翻译后修饰情况。常用技术：非靶向蛋白组学：蛋白质定性（胶条鉴定和溶液鉴定），高通量定量蛋白组（Labelfree、iTRAQ/TMT和DIA定量），多肽组学。蛋白组学样本寄送前是否需要精确计数或是称量？贵州PRM靶向定量蛋白质组学分析方法

蛋白组学技术：蛋白质组学研究的首要任务是建立获取和分析蛋白质的常规、可靠、有效的技术。为达到这一要求，就需要样品准备、数据获取标准化及自动化，也就是要有可重复的高通量的技术。蛋白质组学技术手段在不断完善，其工作流程，包括蛋白质样本的制备、分离、定量及鉴定。由双向凝胶电泳、质谱技术、酵母双杂交系统、蛋白质微阵列技术、能进行大规模数据处理的计算机系统和软件、软电离技术及生物信息学技术构成了蛋白质组学研究的主要技术体系。其中蛋白质组学技术中的质谱技术是现在比较常用的一种蛋白质鉴定技术。定量蛋白组学研究内容在未来的发展中，蛋白质组学的研究领域将更加普遍。

蛋白质组学在医学的研究应用：蛋白质组学(Proteomics)是研究细胞、组织或生物体中蛋白质组成、定位、变化及其相互作用规律的科学，包括对蛋白质表达模式和蛋白质组功能模式的研究。蛋白质组学的发展对寻找疾病的诊断标志、筛选药物靶点、毒理学研究等有重要意义，也因此被普遍应用于医学研究。蛋白质组学研究，总体可分为一下几个步骤：（1）差异筛选（Discovery）（2）初步验证（Verification）（3）然后确诊（Validation）。基于质谱的蛋白质组学是目前比较主流的高通量蛋白质研究手段，当前在医疗健康方面的应用主要集中于基础研究和转化医学。

LabelFree(非标记蛋白质组学技术)：在非标记策略的定量模型中，主要涉及两种不同的算法：其一，以肽段的色谱峰积分面积为基础，通过比较一对生物样品中相对应到蛋白质酶解多肽的色谱积分面积而得到两者的相对丰度；其二，以肽段被质谱检测的计数为基础，通过归一化来表征被检测蛋白质的相对丰度。非标记技术认为肽段在质谱中被捕获检测的频率（Counts）与其在混合物中的丰度成正相关，因此蛋白质被质谱检测的计数反映了蛋白质的丰度，通过适当的数学公式可以将质谱检测计数与蛋白质的量联系起来，从而对蛋白质进行定量。蛋白质组学的研究是生命科学进入后基因时代的特征。

我们究竟怎么研究蛋白质组学呢？目前高通量检测蛋白质的方法中，还是首推基于质谱的方法，纳流液相可以将复杂样品中的肽段高效地分离，然后依次进入质谱，对每个被离子化的肽段及其碎裂后碎片的荷质比进行分析，从而得到该肽段的序列信息，然后根据对应的色谱峰面积或者报告离子强度等信息，我们又可以得到该肽段的定量信息。蛋白组学研究怎么做？当下蛋白组学研究中应用比较普遍的技术是同位素标记定量（iTRAQ/TMT技术）。iTRAQ/TMT技术是利用DDA扫描模式，其扫描的方式是将一级质谱信号比较强的Top20的多肽进行二级打碎，然后进入二级质谱进行检测。其优势是二级谱图采集的肽段信息都来源于同一条多肽，有利于后续的定性分析。定量蛋白质组学技术主要分为标记（label）和非标记（label free）定量策略。定量蛋白组学研究内容

通过对正常个体及病理个体间的蛋白质组比较分析，我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”。贵州PRM靶向定量蛋白质组学分析方法

我国科学家已经在重大疾病如肝病、维甲酸诱导白血病细胞凋亡启动模型及维甲酸定向诱导胚胎干细胞向神经系统分化的模型等比较蛋白质组研究以及一些重要生理和病理体系的蛋白质组成分研究方面获得了重要成就。蛋白质组学的重要应用领域有：在临床疾病中的应用、在微生物蛋白质组学中的应用、在植物研究中的应用、在肾脏病学领域的应用。我们通过研究蛋白质组，可以为患者提供有用的疾病诊断、诊疗、预后评估信息；可以早期更为准确的诊断出胰腺病；也可以为AD的诊断、诊疗药物的设计和筛选奠定基础。这项研究技术其实离我们生活非常近，对我们生命而言尤为重要。近年来，高通量蛋白质分离与鉴定技术，如双向电泳、生物质谱、蛋白质芯片、酵母双杂交系统、生物信息学等相继建立并日趋完善，加速了蛋白质组学的发展。贵州PRM靶向定量蛋白质组学分析方法

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